Täytä seuraava lause: Vuonna 1365 <unk> 66 ja 1384 <unk> 85 kaupunki toimi turvapaikkana Konstancen piispalle, kun hänet karkotettiin Konstancesta. Ennen vuotta 1324 ja vuosien 1371-86 välisenä aikana kaupunki pantattiin ulkopuolisille omistajille lainan vakuudeksi. Vuosina 1359-1403 linna oli paikallisten omistuksessa. Vuonna 1374 heille myönnettiin vapautus sotapalkasta. Piispanvalta heikkeni, kun suvereniteetti siirtyi Habsburgista Badenin kreivikuntaan vuonna 1415. Koska Kaiserstuhl sijaitsi uskonnollisella rajalla, se oli tärkeä sillanpää katolisille alueille. Sekä ensimmäisessä Villmergenin sodassa 1655/56 että
Toggenburgin sota (tai Villmergenin toinen sota) vuonna 1712, kylä oli Zürichin miehittämä. Uskonnollisten konfliktien aikana Kaiserstuhl-liikenne oli pakotettu ylittämään Reinin Zürichin hallinnassa olevilla alueilla. Koska kaupungilla ei ollut oikeutta verottaa Reinin varrella kulkevaa laivaliikennettä, tämä maaliikenteen menetys maksoi kaupungille suurimman osan tullituloistaan. Kaupunki pysyi kuitenkin vauraana viininviljelyn ja karjanhoidon, luoton ja pankkitoiminnan sekä ulkomaisten palvelujen ansiosta. Hyvinvointi heijastuu tämän aikakauden aikana rakennetuissa majesteettisissa taloissa. (Gasthaus zur Krone vuonna 1550, Pyhän Blaisen luostarin hallintohuone vuonna 1563 ja 1612, ja "Marschallhaus" vuonna 1764). Rakennukset, joiden ansiosta Kaiserstuhl toimi alueellisena keskuksena, olivat Reinin oikealla rannalla, ja ne menetettiin vuonna 1798 Badenin kantonin perustamisen myötä. Kun ranskalaiset tuhosivat sillan vuonna 1799, rajanylitys Kaiserstuhlin kautta loppui lähes kahden vuosikymmenen ajan.