Vuoden 1997 UNCAF Nations Cup -kisoissa, jotka järjestettiin Guatemalassa, El Salvador hävisi Hondurasille ensimmäisessä ottelussa 3:0, mutta voitti Panaman toisessa ottelussa 2:0. Toisessa ryhmävaiheessa he päätyivät kolmanneksi, häviät 1<unk>0 sekä Guatemala ja Costa Rica, ja tasapeli 0<unk>0 vastaan Honduras. He pääsivät CONCACAF Gold Cupille vuonna 1998.
, joka järjestetään Yhdysvalloissa. El Salvadorin valmentajana oli Kiril Dojcinovski. Ryhmävaiheessa he tasasivat 0:0 Guatemalan kanssa ja hävisivät Brasilialle (4:0) ja Jamaikalle (2:0).