Koska Decatur sijaitsee Tennesseen joen varrella, strategisesti tärkeässä kahden suuren rautatien risteyksessä, se oli useita kohtaamispaikkoja Amerikan sisällissodan aikana. Kun liittoarmeija miehitti kaupungin sodan alussa, komentava kenraali määräsi kaikki kaupungin rakennukset, lukuun ottamatta neljää, tuhoutumaan. Joidenkin kaupungin kirkkojen tiiliä käytettiin keittiöiden ja savupiippujen rakentamiseen rakennuksiin, joissa asui sotilaita. Neljä jäljellä olevaa rakennusta ovat Old State Bank, Dancy-Polk House, Todd House ja Burleson-Hinds-McEntire House. Unionin voiton jälkeen Atlantan taistelussa
, kenraali John Bell Hoodin johtama liittoutuneiden armeija taisteli lyhyesti huomattavasti ylivoimaisen varuskunnan kanssa vuonna 1864 Decaturin taistelussa, jolloin Decaturia kutsuttiin nimellä "A Tough Nut To Crack".