Taffarel pelasi yli 100 kertaa Brasilian maajoukkueessa. Taffarel auttoi maajoukkuetta voittamaan vuoden 1994 MM-kisojen. Hän esiintyi myös kahdeksassa muussa suuressa kansainvälisessä turnauksessa yhden vuosikymmenen aikana. Hän auttoi Brasiliaa saamaan toisen sijan vuoden 1998 MM-kisoissa ja kaksi Copa América -mestaruutta vuonna 1989.
Hän voitti myös hopeamitalin vuoden 1988 kesäolympialaisissa.