Hän syntyi 11. huhtikuuta 1935 Gaibandhassa Bangladeshissa Gouranath Sarkarin poikana. Bijon Sarkar lähti kotoaan Dhakkaan sen jälkeen, kun hänen vanhempansa kuolivat ja hänen esi-isiensä maa hävisi joen eroosiossa. Bijon sai ensimmäiset valokuvausopetuksensa vanhemmalta veljeltään Tarapodo Sarkarilta, joka oli itseoppinut kuvanveistäjä, mutta harjoitti valokuvausta vapaa-aikana. Hänen ensimmäinen ammatillinen valokuvausharjoittelu oli, kun hän osallistui valokuvaaja Manzoor Alam Begin johtamaan työpajaan vuonna 1961. Sarkarin uransa valokuvauksessa alkoi Pakistanin geologisessa tutkimuslaitoksessa vuonna 1962. Seitsemän vuotta myöhemmin hän liittyi Pakistanin televisioon kuvaajana. Televisiotoimisto erotti hänet vapaussodan jälkeen.
Vuonna 1971 Sarkar pakotettiin turvaan Intiaan. Myöhemmin hän liittyi Bangladesh Parjatan Corporationin päävalokuvaajana vuonna 1972 ja jäi eläkkeelle sieltä vuonna 1995. Hän oli Bangladesh Photographic Society (BPS) -järjestön perustajajäsen, ja hänestä tuli sen puheenjohtaja 1990-luvulla. Hän oli myös yksi Bangladeshin elokuvayhteisön perustajajäsenistä. Bijon uskoi, että valokuvauksella on kaikki mahdollisuudet tulla taidemuodoksi kuten maalauksella. Hänen ensimmäinen valokuvausnäyttelynsä osoitti hänen uskonsa hyvin. Bijon Sarker kuoli 29. joulukuuta 2012. Hän sai päävammat liikenneonnettomuudessa 21. marraskuuta 2012 illalla. Hän oli koomassa eikä koskaan tullut tajuihinsa.