Janša toimi puolustusministerinä vuosina 1990-1994, ja toimi myös Slovenian itsenäisyys sodan aikana.
- Mitä? Janša toimi pääministerinä vuosina 2004-2008, ja hänestä tuli jälleen pääministeri joulukuussa 2011 pidetyissä ennenaikaisissa vaaleissa. 27. helmikuuta 2013 Janšan toinen hallitus syrjäytettiin epäluottamuslauseella. Kesäkuussa 2013 Janša tuomittiin kaksi vuotta vankeuteen korruptiosta. Slovenian korkein oikeus vahvisti tuomion huhtikuussa 2014, mutta sen jälkeen kun Slovenian perustuslakituomioistuin määräsi oikeudenkäynnin uudelleenkäsittelyn menettelyllisistä syistä, tapaus päättyi myöhemmin. Vaikka hänen puolueensa voitti enemmistön äänistä Slovenian parlamenttivaaleissa vuonna 2018, Janša jätettiin alun perin pääministeriksi, koska useimmat puolueet kieltäytyivät liittymästä Janšan johtamaan hallitukseen Janšan äärimmäisten näkemysten vuoksi. Vuosien opposition jälkeen Janša valittiin nimitetyksi pääministeriksi maaliskuussa 2020 pääministerin Marjan Šarecin eroamisen jälkeen.