Toukokuussa 1861 2. luutnantti Heywood ylennettiin ylimmäksi luutnanttiksi - ja laskeutui merijalkaväen kanssa Hatteras Inlettiin.
Hän osallistui Fort Clarkin ja Fort Hatterasin valloitukseen. Hänet ylennettiin kapteeniksi saman vuoden marraskuussa, ja talven 1861-62 aikana hän osallistui aktiivisesti useisiin James-joen veneisiin.