San Andrés Semetabajin vanhin viittaus Guatemalan espanjalaisen valloituksen jälkeen
on fransiskaanien luostarin raportissa, jonka munkki Francisco de Zuasa kirjoitti vuonna 1689, joka sanoi, että San Andrés Semetabaj oli pieni kaupunki Panajachelissa sijaitsevan luostarin lainkäyttöalueella, jossa asui 315 ihmistä (297 alkuperäiskansaa ja 18 kreolaa).