Kirjoita jatko tämän kappaleen - Vuonna 1935 Yhdysvallat perusti Filippiinien yleishyödyllisyyden sen lupauksen mukaisesti, että Filippiinit saisivat täyden itsemääräämisoikeuden, vuoden 1935 perustuslain ratifioinnin jälkeen, joka myös palautti presidenttiyden. Ensimmäiset kansalliset presidentinvaalit pidettiin, ja Manuel L. Quezon (1935-1944) valittiin kuudeksi vuodeksi, ilman uudelleenvalinnan varausta, toisena Filippiinien presidenttinä ja ensimmäisenä Commonwealthin presidenttinä. Vuonna 1940 perustuslakia kuitenkin muutettiin, jotta uudelleenvalinta olisi mahdollista, mutta kausi lyhennettiin neljäksi vuodeksi. Hallituksen muutos tapahtui kolme vuotta myöhemmin, kun toisen Filippiinien tasavallan perustettiin vuoden 1943 perustuslain voimaantulolla, jonka Japani pani voimaan sen jälkeen, kun se oli miehittänyt Filippiinit vuonna 1942 toisen maailmansodan aikana. José P. Laurel toimi Japanin tukeman uuden hallituksen nukkepresidenttinä. Hänen de facto -presidenttinään, jota ei tunnustettu laillisesti ennen 1960-lukua, päällekkäin Kansainyhteisön presidentin kanssa, joka meni maanpaossa. Toinen tasavalta hajotettiin, kun Japani antautui.
Liittoutuneille vuonna 1945; Kansainyhteisö palautettiin Filippiineille samana vuonna Sergio Osmeñan (1944-1946) presidenttinä.