Vuosia myöhemmin eläintarhan eläimet Alex, Marty, Melman, Gloria, pingviinit Skipper, Kowalski, Rico ja Private sekä simpansit Mason ja Phil valmistautuvat palaamaan New Yorkiin pingviinien ohjaamassa vaurioituneessa lentokoneessa, jota ohjaavat lemurit kuningas Julien XIII, Maurice ja Mort. Lentokoneen polttoaine loppuu ja se putoaa manner-Afrikkaan. Eläimet löytävät itsensä luonnonsuojelualueen vesipisteestä ja ovat innoissaan tapaamisesta muiden lajiensa kanssa. Alex tapaa vanhempansa ja tekee vaikutuksen heille kertomalla tarinoita asemastaan "New Yorkin kuninkaana". Marty sopii yhteen muiden seepraattien kanssa, jotka näyttävät ja kuulostavat aivan kuin hän. Melman on hykkähyläinen noita, joka on ahdistunut siitä, että ei ole reserviossa muita Moto Moto Moto -hippopotteja.
sileäpuhuva uroshippopotami