Koska valvontaneuvosto voi toimia vain kaikkien neljän jäsenen suostumuksella, tämä askel käytännössä sulki instituution, kun kylmä sota saavutti varhaisen huippukohtansa Neuvostoliiton Berliinin saarron aikana.
1948-1949 -vuoden määräyksestä. Liittoutuneiden valvontaneuvostoa ei virallisesti hajotettu, vaan se lopetti kaiken toiminnan, lukuun ottamatta neljän vallan viranomaisten toimintaa, nimittäin Spandaun vankilan johtamista, jossa Nürnbergin oikeudenkäynneissä tuomitut pidettiin vuoteen 1987 saakka, ja Berliinin lentoturvallisuuskeskusta.