Kun Jean-Charles Pichegru siirrettiin johtamaan "Pohjoisen armeijaa" tammikuussa 1794, Michaud ylennettiin armeijan komentajaksi jonkin verran haluttomasti. Sinä vuonna hän johti armeijaa Schifferstadissa ja Vosgeilla. Armeija yhdistettiin "Rhin-et-Mosellen armeijaan" huhtikuussa 1795. Hän komensi sisämaahan vuoteen 1800, jolloin hän johti joukkoja Mincion.
Italiassa. Hän komensi sotilaita Hollannissa ja Pohjois-Saksassa vuosina 1805-1813 ensimmäisen Ranskan valtakunnan aikana. Hän jäi eläkkeelle vuonna 1814 ja kuoli vuonna 1835. MICHAUD on yksi niistä nimistä, jotka on kirjoitettu Arc de Triomphe -pilarin alle kolonnalle 13.