Vuonna 1856 Kekulé tuli Privatdozentin Heidelbergin yliopistossa. Vuonna 1858 hänet palkattiin täysiprofessorina Gentin yliopistossa, sitten vuonna 1867 hänet kutsuttiin Bonn, jossa hän pysyi lopun uransa. Perustaen ajatuksiaan sellaisten edeltäjien kuin Williamson, Edward Frankland, William Odling, Auguste Laurent, Charles-Adolphe Wurtz ja muut, Kekulé oli pääasiallinen muotoilija kemiallisen rakenteen teorian (1857<unk>58). Tämä teoria perustuu ajatukseen atomi valenssi, erityisesti tetravalenssi hiilen (joka Kekulé ilmoitti myöhään vuonna 1857) ja kyky hiiliatomeja linkittää toisiinsa (joka julkaistiin paperi vuonna 1858), on palkattu täysiprofessori Ghentin yliopistossa, sitten vuonna 1867 hänet kutsuttiin Bonnissa, jossa hän pysyi lopun uransa.
kemiallinen rakenne