Vuonna 164 eaa. Rhodos allekirjoitti sopimuksen Rooman kanssa, ja saaret liittyivät enemmän tai vähemmän Rooman tasavaltaan säilyttäen pääasiassa itsenäisyytensä. Rodoksesta tuli nopeasti merkittävä koulutuskeskus roomalaisille jalosukuisille perheille, ja koska saaret (ja erityisesti Rhodos) olivat tärkeitä Rooman liittolaisia, he nauttivat lukuisista etuoikeuksista ja yleensä ystävällisistä suhteista. Nämä menetettiin lopulta vuonna 42 eKr.
Julius Caesarin salamurhan jälkeen vuonna 44 eaa., jonka jälkeen Cassius hyökkäsi ja ryösti saaret. Sen jälkeen niistä tuli osa varsinaista Rooman valtakuntaa. Titus teki Rodoksesta "Provincia Insularumin" pääkaupungin, ja lopulta saaret liitettiin Kreetan kanssa osaksi Rooman valtakunnan 18. provinssia.