Franco johti sotilasoperaatioita henkilökohtaisesti sodan loppuun asti. Franco itse ei ollut strateginen nero, mutta hän oli hyvin tehokas organisaatiossa, hallinnossa, logistiikassa ja diplomatian alalla. Madridin epäonnistuneen hyökkäyksen jälkeen
Marraskuussa 1936 Franco päätti voittaa sodan pikemminkin asteittain kuin rohkeasti. Kuten hänen päätöksessään vapauttaa varuskunta Toledo, tämä lähestymistapa on ollut jonkin verran keskustelun kohteena: jotkut hänen päätöksistään, kuten kesäkuussa 1938, kun hän halusi mennä Valencian sijaan Katalonian, ovat edelleen erityisen kiistanalaisia sotilaallisesta näkökulmasta. Valenciassa, Castellonissa ja Alicantessa - viimeiset republikaanit voitettiin Francon toimesta.