Kirjoita jatko tästä kappaleesta - sen jälkeen kun McKinley murhattiin.
Syyskuussa 1901 Long muutti mielensä ja antoi eronsa presidentti Rooseveltille 1. toukokuuta 1902. Tämän täsmälliset syyt ovat epäselviä, mutta siihen on luultavasti vaikuttanut useita tekijöitä. Ensinnäkin Rooseveltilla oli läheinen suhde Longin poliittiseen kilpailijaan Lodgeen, ja hänen tiedettiin olevan eri mieltä Longin kanssa meriasioissa, eikä hän ollut tyytyväinen Longin läsnäoloon Valkoisessa talossa. Toiseksi, tutkimus amiraali Winfield Scott Schleyn toimista heinäkuussa 1898 Santiago de Cuban taistelussa oli johtanut merkittävään arvosteluun Longin roolista sodassa. Kolmanneksi, yksi hänen tyttäristään kuoli lokakuussa 1901, alle kuukausi McKinleyn salamurhan jälkeen. Nämä asiat ajoivat Longin masennukseen, ja tilanne pahentui entisestään, kun Roosevelt riiteli hänen kanssaan sodan alkamisesta ja teki sitten uutisoivan kumouksen joistakin päätöksistään. Historioitsija Wendell Garrett huomauttaa, että Roosevelt oli henkilökohtaisesti kiinnostunut laivastosta ja että hänellä oli vaikeuksia työskennellä seuraavien sihteerien kanssa.