Boehner vastusti vuonna 2011 Naton johtamaa
Sotilaallinen interventio Libyassa. Vuonna 2015 Boehner tuki Saudi-Arabian johtamaa interventiota Jemenissä sanoen: "Kiitän Saudi-Arabiaa siitä, että he ovat ryhtyneet tähän toimiin suojellakseen kotimaataan ja omaa naapurustoaan".