Molempien laivastojen komennot vaihtuivat Notiumin jälkeen. Koska navarkin viran määräaika oli rajoitettu, Lysander korvattiin Callicratidasilla; Ateena puolella Alkibiadesin kaatuminen vei myös hänen ystävänsä Thrasybuluksen ja Theramenesin, ja kokonaiskäsky annettiin Cononille. Seuraavan vuoden aikana laivastot törmäsivät toisiinsa kahdesti, ensin taistelussa, jossa Callicratidas voitti ateenalaiset kahdesti enemmän laivoja kuin Conon ja vangitsi heidät Mytileneen; Ateenalainen avustuslaivasto voitti Callicratidasin ratkaisevasti ja tappoi hänet Arginusaeissa. Nämä Ateenalaisten voitot osoittautuivat kuitenkin hyödyttömiksi, sillä vuonna 405 eKr Lysander palasi epäviralliseen komennoon ja tuhosi Ateenalaisen laivaston
Aegospotami, joka lopetti Peloponneson sodan, jonka Sparta voitti.