Vuosi 2004 oli erilainen Garnerille. Kun Houston Astrosilla oli hidas alku tuolloin managerin Jimy Williamsin johdolla, Garner tuotiin puolivälillä Williamsin tilalle ja johti Astrosia National League Wild Card -paikkaan, ja hävisi lopulta seitsemässä pelissä St.
- Mitä? Joukkue sai taas hitaan alun vuonna 2005, mutta teki jälleen kerran juoksun myöhään kaudella ja palasi voittamaan toisen National League Wild Cardin. Tällä kertaa Houston voitti St. Louis Cardinalsin National League Championship Seriesissä kuudessa pelissä ja voitti lipun vain voittaakseen Chicago White Soxin World Seriesissä.