Bogaerts ja Red Sox sopivat 7,05 miljoonan palkan vuodelta 2018. Hän aloitti kauden 2018 yleensä lyömässä viidenneksi. Hän iski kaksi Grand Slamia huhtikuussa; yksi huhtikuun 7. päivänä Tampa Bay Raysia vastaan ja yksi huhtikuun 30. päivänä Kansas City Royalsia vastaan. Bogaerts nimitettiin AL:n viikon pelaajaksi heinäkuun 2.8. Hän teki toisen ison slamin 14. heinäkuuta, tällä kertaa ylimääräisen inningsin walk-off home runia Toronto Blue Jaysia vastaan. Säännöllisen kauden aikana Bogaertsilla oli 23 kotia, 103 lyöntiä ja.288 keskiarvo. Red Sox voitti vuoden 108<unk>54 ja voitti World Seriesin.
Los Angeles Dodgersin yli. Bogaerts oli ainoa pelaaja, joka oli Red Soxin joukkueessa sekä vuoden 2013 että vuoden 2018 World Seriesissä.