Kirjoita jatko-osa tähän kappaleeseen - Sodan jälkeen Mackay opiskeli fysiikkaa Cambridge-yliopistossa Ernest Rutherfordin alaisuudessa ennen kuin palasi Australiaan ja entiseen työhönsä luennoitsijana Sydneyn yliopistossa. Vuosina 1933-1940 hän oli Cranbrook Schoolin rehtori Sydneyssä. Hän pysyi miliisiassa sodan välillä ja oli kenraalimajuri toisen maailmansodan puhjetessa. Hänet valittiin 6. divisioonan komentajaksi vuonna 1940 ja johti sitä Australian armeijan ensimmäisten sodan taisteluiden aikana. Kaikki epäilyt hänen kyvyistään hävisivät pian, kun divisioona sitoutui Länsi-Aavikon kampanjaan. Bardia-taistelun aikana
Tammikuussa 1941 6. divisioona valloitti linnoitetun kaupungin 36 000 italialaisen vangin kanssa. Kreikan taistelussa hänestä tuli ainoa australialainen kenraali, joka kohtasi "Waffen-SS:n" taistelussa. Hän kärsi sarjan takaiskuja Kreikassa, mutta teki vaikutuksen hänen johtamaansa joukkoihin hänen rohkeudellaan tulessa. Hänet kutsuttiin takaisin Australiaan vuonna 1941 palvelemaan kotijoukkojen kenraaliupseerinä. 6. huhtikuuta 1942 hän otti toisen armeijan komennon. Vuoden 1943 aikana hän komensi kahdesti Uuden Guinean joukkoja taistelussa Uuden Guinean kampanjassa. Hänen aktiivinen palveluksensa päättyi hänen nimittämiseensä Intian korkeaksi komissaariksi marraskuussa 1943.