Jolie sai elokuussa 2002 ensimmäisen humanitaarisen palkinnon Church World Service's Immigration and Refugee Program -ohjelmasta ja lokakuussa 2003 hän oli ensimmäinen, joka sai Yhdistyneiden Kansakuntien kirjeenvaihtajien yhdistyksen Citizen of the World -palkinnon. Hän sai UNA-USA: n maailmanlaajuisen humanitaarisen palkinnon lokakuussa 2005, ja hän sai Freedom Award -palkinnon kansainväliseltä pelastuskomitealta marraskuussa 2007. Lokakuussa 2011 YK: n pakolaisasiain pääkomissaari António Guterres lahjoitti Jolielle kultaisen pinni, joka on varattu pitkäaikaisimmalle henkilöstölle, tunnustuksena hänen vuosikymmenestä UNHCR: n hyvän tahdon lähettiläänä. Marraskuussa 2013 Jolie sai Jean Hersholt Humanitarian Award -palkinnon, yksityisen humanitaarisen palkinnon, Picture Arts and Sciences -ohjelman hallitukselta.
Maailman humanitaarinen palkinto