Itävaltalainen palasi kilpailupaikalle Kanadan Grand Prix -kilpailussa ja säilytti kilpailupaikkansa vahvojen suoritustensa ja Red Bullin lisääntyneen paikoiden määrän ansiosta, kun hän osti Minardi-joukkueen (joka nimettiin Scuderia Toro Rosso, italiaksi "Team Red Bull") vuonna 2006. Klien päätti toisen vuodensä Formula 1: ssä kahdella pisteellä: kahdeksanneksi Turkissa ja viidenneksi kauden lopussa Kiinassa.
- Mitä? Kiinassa saadun lupaavan suorituksen jälkeen joulukuussa 2005 vahvistettiin, että Klien ajaisi Red Bull Racingilla David Coulthardin rinnalla kaudella 2006.