Viitataan alla olevaan kohtaan ja vastataan kysymykseen sen jälkeen samalla kielellä kuin kohtaa:  Vaikka Newton syntyi anglikaaniseen perheeseen, hän oli kolmekymppisenä kristitty, ja jos se olisi julkistettu, valtavirran kristinusko ei olisi pitänyt sitä ortodoksisena; viime aikoina häntä on kuvattu kerettiläiseksi. Vuoteen 1672 mennessä hän oli alkanut kirjata teologisia tutkimuksiaan muistikirjoihin, joita hän ei näyttänyt kenellekään ja joita on vasta äskettäin tutkittu. He osoittavat laajan tuntemuksen varhaiskirkko kirjoituksista ja osoittavat, että Athanasiuksen ja Ariuksen välisessä ristiriidassa, joka määritteli uskontunnustuksen, hän otti Ariuksen, häviäjän, puolelle, joka hylkäsi kolminaisuuden tavanomaisen näkemyksen. Newton "tunnusti Kristuksen jumalalliseksi välittäjäksi Jumalan ja ihmisen välillä, joka oli alhaisempi kuin Isä, joka loi hänet". Hän oli erityisen kiinnostunut profetioista, mutta hänen mielestään "suuri luopumus oli kolminaisuusoppi". Newton yritti epäonnistuneesti saada yhden niistä kahdesta stipendistä, jotka vapauttivat sen haltijan virkaanasettamisvaatimuksesta. Viime hetkellä vuonna 1675 hän sai hallitukselta vapautuksen, joka vapautti hänet ja kaikki tulevat Lukasian tuolinhaltijat. Newtonin silmissä Kristuksen palvonta Jumalaksi oli epäjumalanpalvelusta, hänelle perussyntiä. Historioitsija Stephen D. Snobelen sanoo: "Isaac Newton oli kerettiläinen. Mutta hän ei koskaan julistanut yksityistä uskoaan - jota ortodoksit olisivat pitäneet äärimmäisen radikaalina. Hän kätki uskonsa niin hyvin, että tutkijat ovat yhä selvittämässä hänen henkilökohtaisia uskomuksiaan". Snobelen päättelee, että Newton oli ainakin sosiiniläinen sympatisoija (hän omisti ja oli perusteellisesti lukenut ainakin kahdeksan sosiiniläistä kirjaa), mahdollisesti arrialainen ja lähes varmasti anti-kolminaisuuden kannattaja. Vähemmistöasennossa T.C. Pfizenmaier tarjoaa hienostuneemman näkemyksen väittäen, että Newton oli lähempänä puoli-arialaista kolminaisuuden näkemystä siitä, että Jeesus Kristus oli "samanlaisesta substanssista" (homoiousios) Isästä kuin ortodoksinen näkemys siitä, että Jeesus Kristus on "samanlaisesta substansista" Isän (homoousios), kuten nykyaikaiset ortodoksit, roomalaiskatoliset ja protestantit. Mutta tämä...  Kysymys: Mitä Snobelen ajatteli Newtonista?
Hän oli kerettiläinen.