Vuonna 1857 Rigault de Genouilly purjehti fregatilla "Némésis" liittymään amiraali Léonard Charnerin kokoamaan laivastoon toiseen oopiumsotaan.
Hän sai komennon Ranskan laivastoon. Kampanjan aikana hän osallistui Macaon piiritykseen ja vangitsi Kantonin.