Lyonissa alkoi kapina 29. toukokuuta 1793. Edustaja Edmond Louis Alexis Dubois-Crancé halusi jo 8. heinäkuuta, että Kellermann johtaa armeijansa Lyonissa, mutta komentaja vaati kirjallista käskyä. Lyonin johtava jakobini Joseph Chalier lähetti sille kaupungille giljotiinin Pariisista. Hän suunnitteli teloittavansa 900 vastarevoluutionaria Lyonissa, mutta hänet pidätettiin sen sijaan. 18. heinäkuuta Chalier joutui oman giljotiininsa uhriksi. Kansallinen konventti määräsi 20. heinäkuuta Kellermannin tukahduttamaan Lyonin kapinan. Kenraali oli vastahakoinen ja huomautti, että Lionin hyökkäys aiheuttaisi hänen poistavan joukot, joita tarvitaan Alppien rajan puolustamiseen. Kellermann lähti kuitenkin liikkeelle 10 000 jalkaväen ja 3 000 ratsuväen kanssa 6. elokuuta. Lopulta 28 000 sotilasta tarvittiin Lyonin piirittämiseksi.
Päätteeksi.