Ensimmäistä kertaa sen jälkeen, kun Shirai debytoi kansainvälisissä kilpailuissa vuoden 2013 MM-kisoissa, hän ei päässyt Japanin miesten maajoukkueeseen. Shirain suorituksia hidasti useimmiten vuoden 2019 kaudella melko itsepäinen ja kiusaava vasemman nilkkakivutus, mikä johti siihen, että hän ei kyennyt kilpailemaan parhaiten vuoden 2019 Japanin laitteiden mestaruuskilpailuissa, että tulokset siellä ja vuoden 2019 NHK Trophy -kilpailussa määrittelivät voimistelijan kelpoisuuden liittyä Japanin maajoukkueeseen vuoden 2019 Maailmanmestaruuskilpailussa. Shirain paras mahdollisuus oli saada yksi kahdesta paikasta erikoisryhmän henkilöissä, erityisesti FX:n ja VT:n tunnetuissa tapahtumissa. Shirai onnistui kuitenkin vain kolmanneksi FX: ssä ja viidenneksi VT: ssä, mikä ei oikeuttanut häntä WC: hen, eikä hän kyennyt puolustamaan maailmanmestaruuksiaan vuodesta 2018. Koska Shirai ei ollut ainoa korkean profiilin poissaoleva (Kōhei Uchimura ei myöskään ollut loukkaantumisen vuoksi), japanilaiset olivat lähettäneet melko kokemattoman joukkueen vuoden 2019 MM-kisoihin.
Miesten kilpailua dominoivat muut maat. Shirai työskenteli kovasti palautuakseen kilpailukykyyn pitkän aikaa yrittäen toipua erilaisista vammoista, ja sitten hän tuli melko ruosteelliseksi jokaisessa tapahtumassa.