Gutoc nimitettiin 10. helmikuuta 2017 Rodrigo Duterten hallinnon Bangsamoron siirtymäkauden komission jäseneksi, jonka tehtävänä oli laatia Bangsamoron perussopimus. Kuitenkin hän erosi 29. toukokuuta samana vuonna, koska hän ei hyväksynyt hallituksen käsittelyä Marawin piirityksessä.
, sota-ajan julistaminen ja Duterte'n vitsi siitä, että hän ottaisi vastuun sotilaista, jotka raiskaavat sota-ajan aikana.