Astros kohtasi Bravesin playoffeissa neljännen kerran Bagwellin uralla. 3. pelissä 7. lokakuuta hän löi uransa ensimmäisen kotipotkunsa Mike Hamptonia vastaan ensimmäisessä inningissä 4-2 ylimääräisen inningin tappiossa. Kun kolme epäonnistunutta pyrkimystä siirtyä playoff-ottelujen ensimmäisestä kierroksesta Bagwellin uransa alussa - kaikki Bravesiin (1997, 1999 ja 2001) - ja seitsemän kokonaista 43 vuoden franchise-historiassa, Astros voitti Bravesin ensimmäiseksi playoff-sarjan voitokseen. Neljäkko nimettiin "Killer B's" - tällä kertaa Carlos Beltránin ja Lance Berkmanin lisäyksillä - sytytti Astrosin hyökkäyksen, lyömällä.395 (34-for-86) kahdeksalla kotimaalla, 21 RBI: llä ja 24 juoksulla. Astros teki NLDS-ennätyksellisen 36 juoksun ja Bagwell lyönyt.318 kahdella kotijuoksulla ja viidellä RBI. He pääsivät Bagwellin ensimmäiseen National League Championship -sarjaan.
(NLCS) kohdata kardinaalit. St. Louis voitti Houstonin seitsemässä pelissä.