Ferris nousi useiden pienempien alusten komentajaksi rauhan aikana Amerikan itsenäisyyssotien lopun ja Ranskan vallankumoussodan puhkeamisen välisenä aikana, mutta hän ei saavuttanut täyden post-kapteenin asemaa ennen Ranskan kanssa käytyjen sotien alkua. Hän oli sodan suurimman osan komentajana yhdellä laivalla monissa eri tehtävissä. Hän osallistui Gorée'n valloitukseen vuonna 1801. Palattuaan tuoreena tältä voitolta hänet nimitettiin 74-tykkijoukon komentajaksi ja lähetettiin laivaston kanssa konterimiraali Sir James Saumarezin johdolla partioimaan ranskalaisia ja espanjalaisia satamia. Saumarez löysi ja hyökkäsi Charles-Alexandre Léon Durand Linois -joukkojen kimppuun. Ensimmäinen taistelu Algecirasissa
Englantilaiset joutuivat vaikeuksiin, koska vesi oli matalaa, tuuli oli kevyttä ja vihollisen rantapatterit olivat läsnä. "Hannibal" ajautui rantaan ja vahingoittui pahasti, aiheuttaen useita uhreja. Yritykset purkaa se pois pinnalta epäonnistuivat, eikä muu laivasto kyennyt auttamaan sitä. Toivottomassa tilanteessa Ferris joutui luovuttamaan aluksensa.