Roekiah sairastui helmikuussa 1945, pian "Ke Seberangin" valmistamisen jälkeen. Tästä huolimatta ja keskenmenosta huolimatta hän ei kyennyt lepäämään. Japanin joukot vaativat häntä ja Kartoloa matkalle Surabayaan Itä-Javaan. Palattuaan Jakartalle hänen tilansa paheni. Useiden kuukausien hoidon jälkeen hän kuoli 2. syyskuuta 1945, vain viikkoja Indonesian itsenäistymisen julistamisen jälkeen. Hänen kuolinpäivänsä oli myös Japanin antautumispäivä.
Se lopetti toisen maailmansodan ja miehityksen. Roekiah haudattiin Kober Huluun, Jatinegaraan, Djakartaan. Hänen hautajaisissa oli opetusministeri Ki Hajar Dewantara.