Keväällä 1968 Klokocka tuli Tšekin kansallisneuvoston edustajaksi, Tšekin alahuoneeksi Tšekkoslovakian sisällä Prahan keväällä. Hänestä tuli myös Brnon oikeustieteellisen tiedekunnan dekaani, jossa hän laati Tšekkoslovakian uusia vaalilakeja. Kuitenkin elokuussa 1968 Neuvostoliiton ja muiden Varsovan liiton joukot hyökkäsivät Tšekkoslovakian kimppuun.
ja murskasi vapauttamisliikkeen. Klokocka poistettiin virastaan ja akateemisesta asemastaan yliopistossa.