Eustakio Mendizabalin poliisi jäljitti ja ampui hänet päähän Algortassa, Bizkajassa huhtikuussa 1973. ETA:n kommandot Madridissa nimesivät itsensä "Comando Txikiaksi" kunnioittaen ETA:n suuresti ihailtua marttyyria. Toisin kuin yleisesti uskottu, Luis Carrero Blancon vastaista operaatiota suunniteltiin jo Mendizabalin kuollessa, eikä "Comando Txikia" luotu nimenomaan kostamaan hänen kuolemaansa. Lopulta kommandot murhasivat Luis Carrero Blancon.
Joulukuussa 1973 hänen nimityksensä Espanjan presidentiksi teki alkuperäisen kidnappaussuunnitelman mahdottomaksi.