Margaret syntyi Farleigh Hungerfordin linnassa Somersetissä. Hän oli Clarencian herttua George Plantagenetin ja hänen vaimonsa Isabel Nevillen ainoa elossa oleva tytär. Hänen isoisänsä kuoli taistelemassa setänsä Edvard IV:tä vastaan Barnetin taistelussa.
- Mitä? Hänen isänsä, joka oli jo Clarencien herttua, nimitettiin Salisburyn ja Warwickin jarliksi. Edvard IV julisti, että Margretin nuoremman veljen Edvardin tulisi tunnustaa Warwickin jarliksi kohteliaisuusnimikkeenä, mutta hänelle ei koskaan luotu paristoa. Margretilla olisi ollut oikeus Warwickin kreivikuntaan, mutta kreivikunta menetettiin hänen veljensä Edvardin jälkeen.