Bonaga teki debyyttinsä Panaman puolella UNCAF Nations Cup 2009 -puoliskon semifinaalissa, joka tuli viime hetken sijaisena Hondurasiin vastaan 30. tammikuuta 2009 ja on 1. toukokuuta 2015 saakka ansainnut yhteensä 23 ottelua ja tehnyt 1 maalia. Hän edusti maataan kahdessa FIFA:n MM-kilpailuihin asetetuissa otteluissa ja pelasi
2011 ja 2013 CONCACAF Gold Cups. 10. tammikuuta 2013 hän teki maalin Guatemalaa vastaan ystävällisessä ottelussa 67. minuutissa.