Eddy johti 9. divisioonaa Normandian taistelun alkuvaiheessa. Se laskeutui Utah Beachille neljä päivää D-päivän jälkeen. Eddy sai Ranskan sataman valloittamisen jälkeen kunniamerkin. Elokuussa hänestä tuli XII armeijakunnan komentava kenraali, joka oli usein kenraaliluutnantti George S. Pattonin kolmannen Yhdysvaltain armeijan kärki. Eddy johti XII armeijakuntaa
Liittoutuneiden eteneminen Pariisista Reiniin ja sen jälkeiset taistelut länsirintamalla. Ardennien taistelun aikana Eddy'n XII armeijakunta piti menestyksekkäästi kiinni Saksan eteläpuolelta. Huhtikuussa 1945, kun Eddy oli osallistunut Länsi-liittoutuneiden hyökkäykseen Saksaan, vähän ennen toisen maailmansodan loppua Euroopassa, hän palasi Yhdysvaltoihin vakavan sairauden (erittäin korkean verenpaineen, josta hän toipui) vuoksi ja hänet korvattiin XII armeijakunnan komennossa kenraalimajuri Stafford LeRoy Irwinilla.