Lentokenttä rakennettiin toisen maailmansodan aikana Fort Randallin armeijan lentokenttänä Alyaskan alueen salaisen sotilasrakennuksen aikana, joka alkoi vuonna 1941. Alun perin laitteiden piti rakentaa McGrathin armeijan lentotukikohta, - mutta maa oli jäätynyt siihen mennessä, kun laitteet saapuivat. Blair Canning and Packing Company -yhtiön siviilihenkilöstön naamioituneina Yhdysvaltain armeijan henkilöstö siviilivaatteissa kuljetettiin Cold Bayhin. Rakentaminen alkoi joulukuussa 1941, ja lentokenttä oli valmis käytettäväksi maaliskuussa 1942. Alaskan sotilaallisten komentajien ennakoinnin ansiosta uusi lentokenttä oli yhdessä toisen uuden salaisen lentokentän, Umnakin Cape Fieldin, kanssa valmis auttamaan Alaskan puolustamisessa Japanin laivaston ilmahyökkäyksiä vastaan Dutch Harborin taistelun aikana.
Kesäkuussa 1942. Cold Bayn lentokenttä pysyi toiminnassa koko toisen maailmansodan ajan.