Heinäkuussa 1944 Neuvostoliiton armeija valtasi jälleen Vilnan.
, jonka aikana se kukisti saksalaisen varuskunnan. Kaupunki oli jälleen kerran Liettuan SSR:n pääkaupunki. NKVD aloitti tukahduttamisen liettualaisia ja Armia Krajowaa vastaan. Neuvostomallistaminen alkoi tosissaan.