30. kesäkuuta 1989 eversti Omar al-Bashir johti verettömän sotilasvallankaappauksen.
- Mitä? Uusi sotilashallitus keskeytti poliittiset puolueet ja otti käyttöön kansallisen tason islamilaisen lain. Myöhemmin al-Bashir suoritti puhdistuksia ja teloituksia armeijan ylemmissä riveissä, kielsi yhdistykset, poliittiset puolueet ja riippumattomat sanomalehdet sekä vangitsi johtavia poliittisia henkilöitä ja toimittajia. 16. lokakuuta 1993 al-Bashir nimitti itsensä "presidenttiksi" ja hajotti vallankumouksellisen komennon neuvoston. Al-Bashir otti neuvoston toimeenpanevan ja lainsäätävän vallan.