Täytä seuraava lause: Kovalyov on ollut avoin arvostelu Boris Jeltsinin ja Vladimir Putinin hallintojen autoritaarisista suuntauksista. Vuonna 1996 hän erosi Jeltsinille osoitetun avoimen kirjeen jälkeen, jossa Kovaljov syytti presidenttiä demokraattisten periaatteiden luopumisesta. Vuonna 2002 hän perusti julkisen komission tutkimaan
Vuoden 1999 Moskovan asunnon pommitukset (Kovalev-komissio), joka käytännössä lamaantui sen jälkeen, kun yksi sen jäsenistä, Sergei Yushenkov, murhattiin, toinen jäsen, Yuri Shchekochikhin, väitettiin myrkytetyksi taliumilla, ja sen lakimies ja tutkija, Mikhail Trepashkin, pidätettiin.