Thiago aloitti kauden 2011-12 Espanjan Supercupan ottelun ensimmäisellä puolella Real Madridia vastaan, kun Xavi vaihdettiin 58 minuutin kuluttua, ja oli käyttämätön korvike, kun he voittivat FC Porton 2011 UEFA Super Cupissa.
- Mitä? Hän teki sen jälkeen Barcelonan ensimmäisessä La Liga -ottelussa kaudella 5 - 0 kotiseurassa Villarreal CF:ää vastaan. 18. joulukuuta hän aloitti, kun Barcelona voitti 4<unk>0 Klubi-maailmancupin finaalissa International Stadium Yokohamassa. Thiago teki myös Barcelonan viidennen maalin Rayo Vallecanoa vastaan 29. huhtikuuta.