Vuonna 1994 Ferrari oli paljon kilpailukykyisempi, mutta epäluotettava, - ja tiimikaveri Berger tuli joukkueenjohtajaksi. Valmistuttuaan kolmanneksi kauden ensimmäisessä kisoissa Alesi loukkaantui selkäänsä Mugellon radalla Italiassa kauden ensimmäisen kisan jälkeen (Brasilia) ja hänet korvattiin Tyynenmeren Grand Prix -kilpailussa ja San Marinon Grand Prix -kilpailussa.
Nicola Larinin kirjoittama. Hän palasi viidennellä sijalla Monakoon ja sijoittui vahvasti kolmanneksi Kanadassa, mutta melkein menetti aseman kilpailun lopussa vaihteiston ongelman vuoksi. Hän vetäytyi Ranskan Grand Prix -kilpailusta törmäyksestä Rubens Barrichellon kanssa, mutta pääsi toiseksi Britannian Grand Prix -kilpailussa Michael Schumacherin diskvalifioinnin ansiosta. Hän pyrki vahvaan tulokseen Saksan Grand Prix -kilpailussa, jossa hän pääsi toiseksi joukkuetoverinsa Bergerin jälkeen, mutta hänen moottorinsa hajosi ensimmäisellä kierroksella. Seuraavia kisoja merkitsi joukko vetäytymisiä. Monzassa hän otti ensimmäisen polupositsionsa ja johti, kunnes hänen ensimmäinen pysähtymisensä, jolloin vaihdepaketti epäonnistui pitlaneessa, ja vihassa hän ajoi takaisin Avignoniin nopeudella yli 200 km / h. Tämä sarja päättyi lopulta Japanissa, kun hän pääsi kolmanneksi Nigel Mansellin Williamsin kanssa käytyyn kaksintaisteluun, ja sitten hän pääsi kuudenneksi Australiassa. Alesi sijoittui mestaruuden viidenneksi 24 pisteellä.