Kaupunki tuhoutui lähes kokonaan vuonna 1634 kolmekymmentävuotisen sodan aikana, kun keisari- ja espanjalaiset joukot ryöstivät kaupungin Nördlingenin taistelun jälkeen.
- Mitä? Palot riehuivat yli viikon, ja useimmat Waiblingenin asukkaista kuolivat tai joutuivat pakenemaan. Uudelleenrakentaminen alkoi vasta neljä vuotta katastrofin jälkeen; kaupungin nykyinen vanha keskusosa on peräisin vuosilta 1640-1700. Sen linnoitukset on nyt kunnostettu hyvin.