Täytä seuraava lause: Tiedekunta jaettiin Tšekin ja Saksan osiksi vuonna 1882, ja luonnontieteiden tiedekunnasta tuli erillinen laitos vuosina 1920-1939. Vuonna 1939 natsi-Saksan miehitysjoukot sulkivat koulun, ja opettajat ja oppilaat joutuivat julmaan vainoon. Miehityksen päättymisen jälkeen vuonna 1945 taideyliopisto kukoisti jälleen muutaman vuoden ajan. Tämä lopetettiin pakolla vuonna 1948 kommunistisen vallankaappauksen seurauksena vuonna 1948. Tieteellisen tiedekunnan arvostus väheni nopeasti, kun lukuisat arvostetut opettajat pakotettiin lähtemään ja marxilais-leninistiset tutkimukset otettiin käyttöön. 1960-luvulla tiedekunta alkoi avautua ajan huomattaville ajattelijoille, mutta tämä suuntaus kääntyi
Neuvostoliiton miehittäminen vuonna 1968, jota Jan Palach, tiedekunnan opiskelija, vastusti polttamalla itsensä. Kun kommunistinen hallinto päättyi Tšekkoslovakiassa vuonna 1989 ja sen edustajat lähtivät tiedekunnasta, se perustettiin uudelleen yhtenä maan arvostetuimmista yliopistoista.