"Paul Jacobi" vietti suurimman osan vuodesta 1943 toimettomana arktisella alueella ennen kuin palasi Saksaan syyskuussa uudelle kunnostukselle. Hänet vahingoitettiin pahasti liittoutuneiden ilmahyökkäyksissä Kielin kimppuun, eikä hän ollut toiminnassa uudelleen ennen vuoden 1944 loppua. Hän käytti suurimman osan sodan jäljellä olevasta ajasta saattelemalla laivoja Saksan evakuoimisessa Itä-Preussiaan.
ja pommittaa Neuvostoliiton joukkoja. Liittoutuneet vangitsivat aluksen toukokuussa 1945 ja käyttivät lopun vuotta brittiläisten valvonnassa, kun liittoutuneet päättivät, miten vangitut saksalaiset alukset hävitettäisiin.