Merivoimien sota jatkui myös, kun Yhdistynyt kuningaskunta ylläpitää Ranskan saartoa meritse. Neuvostoliitto, Ranska, Tanska ja Ruotsi liittyivät puolueettomien maiden joukkoihin suojelemaan puolueettomia laivoja brittiläisiltä hyökkäyksiltä, mutta ne eivät onnistuneet. Brittiläinen amiraali Horatio Nelson hyökkäsi Tanskan laivaston kimppuun Kööpenhaminan taistelussa ja tuhosi suuren osan Ranskan vakaamman liittolaisen laivastosta. Tulitauko esti häntä jatkamasta Itämerelle hyökkäämään venäläisten laivastoon Revalissa (Tallinnissa). Sillä välin Gibraltarin rannikolla Linois'n ranskalainen laivue torjui ensimmäisen brittiläisen hyökkäyksen Saumarezin johdolla.
- Ottamassa linjan aluksen. Neljä päivää myöhemmin Algeciran toisessa taistelussa britit saivat ranskalaisen aluksen ja upottivat kaksi espanjalaista, jolloin kuoli noin 2000 enimmäkseen espanjalaista merimiestä ja 12 brittiä.