Andrée Malebranche syntyi 28. marraskuuta 1916 Haitin Port-au-Prince'ssa Clio (syntymäaika Lemaire) ja Lelio Malebranchen lapseksi. Malebranche kasvoi varakkaassa perheessä, ja hänen halunsa työskennellä taiteilijana oli epätavallinen tuohon aikaan, mutta Malebranche halusi jo nuorena oppia maalaamaan. Hänen lapsuutensa aikana Yhdysvallat miehitti Haitin.
, joka vaikutti voimakkaasti hänen haluunsa voittaa hänen afrikkalaisen ja haitilaisen perintönsä tukahduttaminen. Saatuaan peruskoulutuksensa yksityisissä kouluissa hän kävi École Normale -koulun ja valmistui siitä vuonna 1938. Kun hänen isänsä nimitettiin Haitin lähettilääksi Kuubaan, Malebranche jatkoi opintojaan Ciriulo da Bella Artesissa Havannassa ja sai baccalauréatin vuonna 1941.