Stone &amp; Websterin vaikeudet tavanomaisten voimaloiden rakentamisessa vastasivat sen ongelmat ydinvoimaloiden rakentamisessa. 1970-luvun loppupuolella yhtiö oli saavuttanut keskeisen roolin ydinvoima-alalla - merkittävä osa koko ydinvoimasta Yhdysvalloissa tuotettiin Stone & Websterin suunnittelemissa ja tuottamissa voimalaitoksissa. Vuonna 1975 yhtiö oli valittu rakentamaan Clinch River Breeder -reaktorin. Ydinvoimaloiden rakentamiseen kohdistuva yleinen vastustus kasvoi kuitenkin, kun julkisen palvelun toimikuntien esittämien haasteiden aiheuttamat pitkät viivästykset ja vastaava kasvua voimaloiden rakentamisen kustannuksissa, joita tapaus rajoitti,
Vuonna 1979 Three Mile Islandilla lopetettiin suurten ydinvoimaloiden rakentaminen ja peruutettiin monia olemassa olevia määräyksiä.