Honda palasi taas vuonna - ja tarjosi moottoreita British American Racingille. BAR-Honda sijoittui toiseksi valmistajien mestaruudessa vuonna 2004, ja vuoden 2005 loppuun mennessä Honda oli ostanut BAR-ryhmän, joka nimettiin uudelleen Honda vuonna 2006. Vuoden 2006 hyvän kauden jälkeen, jolloin Jenson Button voitti Unkarin Grand Prix -
Honda ilmoitti joulukuussa 2008, että se lopettaisi Formula 1:n välittömästi maailmanlaajuisen finanssikriisin vuoksi kahden vaikean kauden 2007 ja 2008 jälkeen.