Colón de Carvajal ja hänen kuljettajansa tapettiin vuonna 1986 Euskadi Ta Askatasunalla (ETA), joka oli avannut tulen heidän autoonsa ja heittänyt siihen käsikranaatin lähellä Paseo de la Castellanaa Madridissa Espanjassa. Carrero Blancon murhan lisäksi
Vuonna 1973 hän oli tärkein henkilö, jonka järjestö oli murhannut.