Hernández tuomitsi World Seriesissä vuonna 2002 ja 2005, sekä All-Star-pelissä vuonna 1999, 2009 ja 2017. Hän on tuominnut seitsemän League Championship Series (2000, 2001, 2003, 2004, 2007,
2010, 2016), ja yhdeksän League Division Series (1997, 1998, 2002, 2005, 2009, 2011, 2012, 2015, 2017, 2018, 2020). Hernández työskenteli myös vuoden 2008 ALCS:n pelissä seitsemäntenä Derryl Cousinsille. Vuoden 2011 baseball-kauden toisella puoliskolla Hernández siirrettiin Joe Westin tuomarin joukosta Gerry Davisin joukkoon.