Toukokuussa 1942 luutnantti Shiga otti lentotukialuksen "Jun'yō's" hävittäjäryhmän komennon, jonka hän piti joulukuuhun 1942 asti. Shiga johti hävittäjiä taisteluissa Dutch Harbourissa.
ja Santa Cruzin saarille. Jälkimmäisessä taistelussa hän hyökkäsi Yhdysvaltojen lentotukialusten, ja, jossa entinen oli myöhemmin uponnut, kun taas "Enterprise" vahingoittui pahasti. Hän komensi lentotukialuksen "Hiyō's" hävittäjäryhmää joulukuusta 1942 tammikuuhun 1943, kun se oli satamassa Japanissa.