Kun brittiläinen hallinto palasi toisen maailmansodan lopussa, perustettiin Malaijan unioni, jonka tarkoituksena oli saada koko niemimaalle yhtenäinen hallinta. Tätä politiikkaa hylkäsivät täysin alkuperäiset malaialaiset, mukaan lukien Parti Kebangsaan Melayu Malaya, joka myöhemmin perusti Malaijan liittovaltion palaamalla federaalismiin. Brittiläisen vallan jatkuminen oli kuitenkin kestämätöntä MCP: lle, joka perusti Malaijan kansallisen vapautusarmeijan hyökkäyksille brittiläisiä siirtomaalaisia vastaan. MNLA:n kolmen brittiläisen maanviljelijän murhan jälkeen - siirtomaavallan hallinto julisti hätätilan.
Se sytytti sisällissodan Liiton ja kommunistien välillä. Hallinto alkoi tukahduttaa kaikkia vasemmistolaisia poliittisia ryhmiä julistamalla PKMM:n ja MCP:n laittomiksi. Oikeistolaisesta Yhdistyneistä malaijilaisista kansallisesta järjestöstä tuli myöhemmin maan hallitseva poliittinen puolue, joka teki yhteistyötä brittiläisten kanssa kommunistien kapinan kukistamiseksi. Samaan aikaan PKMM uudelleenorganisoitiin Parti Rakyat Malesiaksi, joka hylkäsi UMNO:n hallinnon ja teki yhteistyötä Malaijan työväenpuolueen kanssa elvyttääkseen Malaijan vasemmistoa.