Hän ja hänen vaimonsa nähtiin usein ajamassa Land Rover-kuorma-autoa Afganistanin kaupungeissa. Huhtikuun 1978 Saurin vallankumouksen jälkeen
Dupree pidätettiin ja karkotettiin maasta. Hän muutti takaisin Yhdysvaltoihin, mutta vieraili usein naapurimaassa Pakistanissa tarkkailemassa Neuvostoliiton ja Afganistanin välistä sotaa. Hän on työskennellyt mujahideenien kanssa, jotka taistelivat Neuvostoliiton tukemaa Afganistanin hallitusta vastaan. Hän vietti aikaa Peshawarissa Pakistanissa vaimonsa kanssa auttaen afganistanilaisia pakolaisia. Hän oli aikaisemmin asunut Pakistanissa Fulbrightin stipendinä ja Afganistanin asioista Pakistanin Yhdysvaltain suurlähettilään neuvonantajana.