Hitler valitsi Jodlin vasta perustetun Oberkommando der Wehrmachtin (OKW) operatiivisen päälliköksi 23. elokuuta 1939, juuri ennen Saksan hyökkäystä Puolaan. Jodl toimi henkilöstöpäällikönä Tanskan hyökkäyksen aikana.
ja Norjaan. Ranskan kukistumisen jälkeen Jodl oli optimistinen Saksan menestyksestä Britanniaa vastaan kirjoittaen 30. kesäkuuta 1940, että "Saksan lopullinen voitto Englantia vastaan on nyt vain ajan kysymys".