Murray kieltäytyi alun perin tukemasta kumpaakin puolueesta vuoden 2014 kansanäänestyksessä.
Skotlannin itsenäisyydestä, ja hän mainitsi hyväksikäytön, jonka hän oli saanut Englannin-maailmancupin kommenttien jälkeen vuonna 2006. Juuri ennen kansanäänestystä Murray twiittasi viestin, jonka media piti riippumattomuuden kannattavana. Häntä pahoinpideltiin verkossa mielipiteensä ilmaisemisesta, mukaan lukien viestit, joita Skotlannin poliisi kuvaili "häpeällisiksi"; yksi viittasi Dunblaneen verilöylyyn. Muutama päivä äänestyksen jälkeen, jossa 55 prosentin enemmistö vastusti Skotlannin itsenäisyyttä, Murray sanoi, että hän ei katunut näkemystään, mutta sanoi, että se oli luonteeltaan epäsopivaa ja että hän keskittyy tulevaisuudessa tenniskarrieriinsa.