Grant päätti laskeutua joen rannalle Vicksburgin alla huhtikuussa. Kun konfederaation vastarinta oli kukistettu Port Gibsonin taistelussa
Grantin sotilaat hyökkäsivät Jacksonia vastaan - ja valloittivat kaupungin Vicksburgin tukemaan kokoontuneelta liittoutuneelta armeijalle. Vicksburgin konfederaation puolustajat olivat siirtyneet itään kaupungista, mutta heidät kukistettiin Champion Hillin taistelussa 16. toukokuuta. 18. toukokuuta Grantin miehet olivat saavuttaneet Vicksburgin. 19. ja 22. toukokuuta tehdyt hyökkäykset epäonnistuivat, ja kaupunki asetettiin piiritykseen. Vicksburgin piiritys jatkui, kunnes konfederaation puolustajat antautuivat 4. heinäkuuta. Vicksburgin antautumisen jälkeen Port Hudsonin konfederaation varuskunta seurasi esimerkkiä ja antoi liittolaisille täydellisen hallinnan Mississippin joella.