Kesällä 2009 35-vuotias Fontana vapautettiin Torosta ja liittyi Novara Calcioon kolmannessa divisioonassa, jossa hän oli jälleen toinen valinta, tällä kertaa albanialaisen Samir Ujkanin jälkeen. Hän pelasi myös muutaman ottelun loukkaantumisen vuoksi, mukaan lukien 15 vuoden 2011-12 huipputason ottelua.
, joka päättyi syrjäytymiseen.