Marín teki debyyttinsä Costa Rican maajoukkueessa kesäkuussa 1993 ystävyyssopimuksessa Panamaa vastaan ja pelasi yhteensä 128 maalia ja teki 5 maalia. Hän edusti maataan 41 FIFA World Cup -kilpailussa ja pelasi kaikissa kolmessa pelissä sekä 2002: n että 2006: n FIFA World Cup -kisoissa. Hän pelasi myös vuosina 1997, 1999, 2001 ja 2003 järjestetyissä UNCAF Nations Cup -kisoissa sekä vuosina 1993-1998 järjestetyissä UNCAF Nations Cup -kisoissa.
, 2002 ja 2003 CONCACAF Gold Cups ja 2001 ja 2004 Copa Américas. Hän oli myös pelaamaton joukkueen jäsen Copa América -kisoissa 1997.