Senna vaati, että Honda vauhdittaa moottorin kehittämisohjelmaansa ja vaati lisäparannuksia autolle ennen kuin oli liian myöhäistä. Muutokset auttoivat häntä voittamaan vielä kolme kilpailua ja varmistamaan mestaruuden, joka päätettiin Japanissa.
Kun Mansell (joka tarvitsi voittoa), lähti ensimmäisestä mutkasta juoksemassa kolmanneksi - ja rantautui Williamsinsa kivilukkoon. Senna pääsi toiseksi ja antoi voiton tiimikaverilleen Gerhard Bergerille viimeisessä mutkassa kiitoksena hänen tuestaan kauden aikana. Senna suunnitteli siirtyvänsä Williams-joukkueeseen kaudelle 1992, mutta Hondan toimitusjohtaja Nobuhiko Kawamoto pyysi henkilökohtaisesti, että hän pysyy McLaren-Hondassa, minkä Senna teki uskollisuuden tunteen vuoksi; Alain Prostin suosituksen lisäksi Hondalla oli ollut tärkeä rooli Sennan tuomisessa McLarenille.