Honda osti BAR:n vuonna 2005 ja siitä tuli Honda-tiimi vuonna 2006. Joukkue aloitti kauden kunnolla, mutta suorituskyvyn heikkeneminen kauden puolivälissä johti autojen suunnittelijan Geoff Willisin lähtemiseen joukkueesta. Kokemattoman Shuhei Nakamoto korvasi hänet. Kuitenkin asiat alkoivat parantua Ranskan GP:n jälkeen, kun Honda oli vahva pisteiden sarja ja etenkin Jenson Button voitti
Unkarin Grand Prix. Button teki kuudessa viimeisessä kisan kilpailussa enemmän pisteitä kuin kukaan muu kuljettaja auttaakseen Hondan pääsemään neljänneksi valmistajien mestaruudessa.