Mathias Flückiger (syntynyt 27. syyskuuta 1988) on sveitsiläinen vuoristopyöräilijä. Hän ratsasti radan yli.
Hän voitti olympialaiset 2016 ja 2020, joissa hän voitti hopeamitalin. Hänen veljensä Lukas on myös pyöräilijä.