Vuonna 1936 armeijan päällikköjärjestys uudistettiin. Vuonna 1940-1941 Kreikan ja Italian sodan aikana
Saksan hyökkäyksessä Kreikkaan armeijan kenraalipäälliköllä oli päämajan ydin entisen kenraalipäällikön, kenraaliluutnantti Alexander Papagoksen alaisuudessa. Kreikan asevoimat muodostettiin uudelleen Lähi-idässä kreikkalaisen maanpaossa olevan hallituksen ja armeijan kenraalipäällikön avulla.