Huolimatta spekuloinnista, että GP2-mestari Nico Rosbergille annettaisiin mahdollisuus kauden kahdessa viimeisessä kisoissa, Pizzonia teki kauden loppuun Williamsille. Hän vetäytyi Japanin Grand Prix -kilpailusta ajoissa, ja vetäytyi (mutta luokiteltiin lopulliseksi)
Kiinan Grand Prix -kilpailun jälkeen. Vuonna 2006 Pizzonian Formula 1 -uran loppu oli Nico Rosbergin korvaaminen.