O'Gorman muutti Meksikoon työskentelemään brittiläiselle kaivosyhtiölle vuonna 1895. Kaivosalueilla työskentelyn aiheuttaman sairauden jälkeen O'Gormanista tuli kemisti. Hän tapasi Meksikossa kaukaisen serkkunsa Encarnación O'Gormanin ja meni naimisiin hänen kanssaan. Heillä oli neljä lasta, arkkitehti Juan, historioitsija Edmundo, Margarita ja Tomás. Vuonna 1973 hänen poikansa Juan kertoi perheensä kokemuksista Meksikon vallankumouksesta.
O'Gormanin rohkeus ja hurskaus perheensä suojelemisessa.