Toisen maailmansodan aikana Fort VII sai pahamaineisuuden natsien keskitysleiriksi, jossa kuoli jopa 20 000 puolalaista. Vuosina 1940-1945 Fort Grolman ja Fort Rauch muodostivat Stalag XXI-D - sotavankien leirin ytimen. Sodan loppupuolella Poznań julistettiin yhdeksi linnoituskaupungeista ("Festungen"), joita natsit aikoivat puolustaa hinnalla millä hyvänsä, joten nimi "Festung Posen" herätettiin. Ulkoisia linnoituksia käytettiin kaupungin puolustamiseen Poznanin taistelussa (1945)
Fort Winiary oli puolustajien viimeinen vastarintapaikka. Sodan jälkeen Fort Winiarin alue muutettiin Cytadelan puistoksi.