Nyt komennossa Brig. Gen. William W. Burns, se oli sitten osoitettu Army of Potomacin II Corps kuin 2. prikaati, 2. divisioona. Se taisteli Peninsula Campaignissa, jonka aikana kenraalimajuri Joseph Hooker uskoi, että 69th teki "sota ensimmäisen menestyksekkään baionettimurhan" Glendalen taistelussa. Se taisteli myös seitsemän päivän taisteluissa, mukaan lukien Allenin maatilalla ja Savage Stationilla.
Malvern Hillissä se oli Unionin puolella II-joukon kanssa, eikä sitä käytetty taistelussa.