Samaan aikaan Bambergin kartano tuhoutui Kolmekymmentävuotissodassa. Piispa Johann Georg pakeni syrjäisiin Kärnten omaisuuksiinsa vuonna 1631 ja hänen seuraajansa Franz von Hatzfeld karkotettiin samalla tavoin, kun Bambergin ja Würzburgin piispat asetettiin Sachsen-Weimarin prinssi Bernardin lainkäyttövaltaan, joka sai "Franconia-herttuan" arvonimen ruotsalaisen kanslerin Axel Oxenstiernan kädestä vuonna 1633. Piispat saivat takaisin omaisuutensa Bernardin tappion jälkeen Nördlingenissä
1634-luvulla.