Täytä seuraava lause: Hardee erosi Yhdysvaltain armeijasta 31. tammikuuta 1861, sen jälkeen kun hänen kotikaupunkinsa Georgia irtautui unionista. Hän liittyi Konfederaatioiden armeijaan everstiluutnanttina 7. maaliskuuta ja sai komennon Fort Morganista ja Gainesista Alabamassa. Myöhemmin hänet ylennettiin prikaattigeneraaliksi (17. kesäkuuta) ja kenraalimajuriin (7. lokakuuta). 10. lokakuuta 1862 hän oli yksi ensimmäisistä konfederaation luutnanttigeneraaleista. Hänen alkuperäinen tehtävänsä kenraalina oli organisoida Arkansasin rykmenttien prikaati, ja hän teki vaikutuksen miehilleen ja kollegoilleen ratkaisemalla hankalia varustusongelmia ja perusteellisesta koulutuksesta, jonka hän antoi prikaatilleen. Hän sai lempinimensä "Old Reliable", kun hän oli komennossa. Hardee toimi Arkansasissa, kunnes hänet kutsuttiin liittymään kenraali Albert Sidney Johnstonin Keski-Kentucky-armeijaan korpuskomentajana. Johnston vetäytyi Kentuckysta ja Tennesseestä Mississippiseen - ennen yllätyshyökkäystä
Shilohin taistelu keväällä 1862. Hardee haavoittui käteen 6. huhtikuuta 1862 taistelun ensimmäisenä päivänä. Johnston tapettiin Shilohissa ja Hardeen joukot liittyivät kenraali Braxton Braggin Tennesseen armeijaan ennen Corinthin, Mississipin piiritystä, kunnes osaston komentaja P.G.T. Beauregard evakuoi kaupungin ja vetäytyi Tupeloon. Beauregardin tilalle tuli Bragg, joka myöhemmin siirsi armeijansa Chattanoogalle ennen kuin hän ryhtyi Konfederaation Heartland-hyökkäykseen Kentuckyyn. Tämä kampanja päättyi Perryvillen taisteluun lokakuussa 1862, jossa Hardee komensi Braggin armeijan vasenta siipeä.