Fritz Kühnin Bohnsdorfin studio tuhoutui täysin brittiläisten pommituksissa 23. joulukuuta 1943. Valokuvat, piirustukset ja suunnitelmat tuhoutuivat. Sota päättyi.
toukokuussa 1945: ajan myötä Kühn pystyi rakentamaan uudelleen ja myöhemmin laajentamaan studion-työpaikkaa, jota auttoivat ennen sotaa häntä auttaneet työväenpojat, jotka palasivat hitaasti rintamalta tai vankileiristä. Kun tila oli taas käytettävissä, hän keskittyi osallistumaan joidenkin Berliinin tärkeiden rakennusten uudelleen luomiseen ja tarjosi uusia kaiteita Berliinin 1700-luvun Arsenal-rakennuksen laajalle uudelleenrakentamiselle. Hän varasi myös uudet kaiteet Oopperatalon sisä- ja ulkoseinään. Berliinin itäosa oli lopettanut sodan Neuvostoliiton miehitysvyöhykkeellä. Sota oli aiheuttanut Saksalle epätoivoisen ammattitaitoisen työvoiman puutteen. Neuvostoliiton alueen tapauksessa tämä oli pahentunut massiivisella muuttoliikkeellä amerikkalaisiin, brittiläisiin ja ranskalaisiin alueisiin. Kun hän rakensi uudelleen ja laajensi studion, hän osallistui ratkaisun etsimiseen palkkaamalla ja kouluttamalla huomattavan määrän oppisopimuskouluttajia.