Femke Heemskerk teki kansainvälisen debyyttinsä vuoden 2005 MM-kisoissa Montrealissa. Hän ui vain 4 × 100 m vapaasti ja 4 × 200 m vapaasti. Hän kilpaili Euroopan LC-mestaruudessa 2006
ja Euroopan lyhytaikainen uima- mestaruuskilpailu. Mutta hän ei edistynyt molemmissa kilpailuissa.