Yli vuoden jälkeen pataljoona oli sitoutunut sodan viimeiseen kampanjaan. Se kulki Morotai-saaren kautta, kun se liittyi Borneon taisteluun. D-komppania tuki 26. prikaatin hyökkäystä Tarakanin saarelle toukokuussa, kun taas loput pataljoonasta tukivat laskeutumista Labuan saarelle.
ja Bruneinlahden ympärillä Pohjois-Borneon taistelun aikana. Se oli lyhyt, mutta terävä kampanja. Tänä aikana konekiväärejä käytettiin usein jalkaväkeen. He suorittivat laajoja partioita etsien japanilaisia jäljelläjääneitä, mikä johti useisiin yhteenottoihin, sekä suoritti puolustustehtäviä soluttautujia ja hyökkääjiä vastaan. Pohjois-Borneossa useat pataljoonan jäsenet auttoivat myös kapea rautatien käytössä, joka oli palautettu käyttöön Australian toimituslinjan ylläpitämiseksi. Elokuun alussa Hiroshimaan ja Nagaskaiin pudotettiin atomipommeja, mikä lopetti sodan. Pataljoonan tappiot Borneon kampanjassa olivat yhteensä viisi kuollutta ja kuusi haavoittunutta, kun taas Tarakanin tappiot olivat viisi sotilasta kuollut tai haavoittunut.