Manekshaw oli jo johtanut joukkoja divisioonan, korpuksen ja alueellisen tason tasolla. Hänestä tuli seitsemäs armeijan päällikkö vuonna 1969. Hänen johdollaan Intian joukot johtivat voittoisia kampanjoita Pakistania vastaan Intian ja Pakistanin välisessä sodassa vuonna 1971, joka johti Bangladeshin perustamiseen.
Joulukuussa 1971. Hänelle myönnettiin Padma Vibhushan ja Padma Bhushan, Intian toiseksi ja kolmanneksi korkein siviilipalkinto.