Meksikon-Amerikan sodan syttyessä kesäkuussa 1846 Van Buren nimitettiin takaisin armeijaan majuriin. Van Buren toimi kenraalit Zachary Taylorin ja Winfield Scottin avustajana ja osallistui Contrerasin taisteluun, Monterreyn taisteluun, Veracruzin piiritykseen
Cerro Gordon ja Churubuscon taisteluissa.