Kirjoita jatko tämän kappaleen - Vuoden 2014 Skotlannin itsenäisyyskansanäänestyksen valmisteluvaiheessa
Scott kannatti voimakkaasti "ei"-äänestystä ja sitä, että kansanäänestyksen tuloksesta riippumatta olisi tunnustettava "Pohjois-saarten oikeus päättää omasta tulevaisuudestaan". Vuonna 2013 hän esitti Liberaalidemokraattien puolueen konferenssissa liikkeen, jossa hänen kollegansa Liam McArthurin kanssa tunnustettiin, että saarilla on "erillinen itsemääräämisoikeus". Scott sanoi, että hänen suosima lopputuloksenaan oli, että Shetlandista tulisi Yhdistyneen kuningaskunnan kruunun riippuvainen alue, jolla on oma parlamentti, ja häntä tuki puolueiden välinen Wir Shetland -liike, joka kampanjoi kruunun riippuvuuden asemaa varten.