Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Neljän vuosikymmenen lääketieteellisen uransa jälkeen Lowry - uuden vaimonsa, Beverly - avustamana siirtyi 1990-luvulla non-fiction-historiallisten teosten kirjoittamiseen. Hän on kirjoittanut tai ollut mukana kirjoittamassa yli 20 kirjaa tällä alalla, joista suurin osa käsittelee Amerikan sisällissodan aikaa. Suuri osa Lowryn tutkimuksista tehtiin Yhdysvaltain kansallisarkistossa Washingtonissa, jossa Lowrys kokoili vuosikymmenen aikana suuren luettelon tuhansista aiemmin luetteloimattomista sisällissodan asiakirjoista. Lowryn ensimmäinen ja tunnetuin kirja aiheesta, "The Story the Soldiers Wouldn't Tell" (1994), sai suotuisan arvostelun The New York Timesissa "ensimmäisenä sisällissotaan liittyvän seksuaalisen käyttäytymisen tutkimuksena" ja ylistettiin "Esquire" -lehdessä "viihdyttävänä ja kiehtovana". Kaksi myöhemmin sisällissodan sotaoikeuksia käsittelevää teosta, "Tarnished Eagles" (1998) ja "Tarnished Scalpels" (2000; Jack D. Welshin kanssa), arvosteltiin hyvin "Civil War Timesissa" ja "Kirkus Reviewsissa". Lowry on julkaissut toisinaan muita historiallisia tapahtumia, kuten Taranton taistelua.
ja "Titanicin" uppoamista. Hänen vuonna 2004 julkaistunsa kirja Lewis ja Clark Expedition sai hänelle palkinnon Lewis ja Clark Trail Heritage -säätiöstä.