Vuonna 1994 Unser voitti jälleen Indyn.
Tällä kertaa Penske Racingilla. Hänen joukkuetoverinsa olivat Emerson Fittipaldi, mies, jonka kanssa hän taisteli viisi vuotta aiemmin, ja Paul Tracy. Unser oli hallitseva koko kauden ajan, voittaen kahdeksan kisoja 16:sta matkalla toiseen CART-mestaruuteensa, ja hänet nimitettiin ABC: n Wide World of Sports -urheilijaksi. Vuonna 1995 Unser, joukkuetoverinsa Emerson Fittipaldin kanssa, epäonnistui pääsemään Indianapolisissa, ja hän viittasi myöhemmin tähän tapahtumaan, joka laukaisi hänen laskeutumisensa alkoholismiin ja avioliittonsa hajoamiseen. Hän pääsi toiseksi Jacques Villeneuve'n jälkeen CART-mestaruuspisteissä vuonna 1995. Hän oli neljäs vuonna 1996, vaikka hänellä oli mahdollisuus voittaa mestaruus kauden loppuun asti.