Filippiinien kukistumisen jälkeen - diviisioni alkoi harjoitella hyökkäystä Japania vastaan.
Antautuminen tuli ensin. Divisioona siirrettiin Japanille, jossa se miehitti Honshun saaren muutamaksi kuukaudeksi. 41. jalkaväkidivisioona purettiin Kure-Hirossa, Japanissa 31. joulukuuta 1945.