Jones oli 14. valinta vuoden 2002 NBA-valinnassa Indiana Pacersilta. Isiah Thomas valitsi hänet. Hän pelasi harvoin tulokkaana, kun hän teki keskimäärin vain 1,2 pistettä per peli 19 ottelussa, kun hän pelasi Reggie Millerin takana. Pisteytyksen keskiarvo nousi lähes 5 pisteeseen ottelussa hänen toisena vuotenaan, kun hän esiintyi 81 ottelussa. Hän yli kaksinkertaisti keskiarvonsa kaudella 2004-05 (10,6 ppg), osittain siksi, että joukkuetoverinsa ja pienen hyökkääjän Ron Artestin keskeytettiin kaudella osallistumisestaan The Malice at The Palace -sarjaan.
-Tapahtuma. Jones teki uransa korkeimman 31 pistettä Orlando Magicia vastaan, mikä teki hänestä yhden joukkueen tärkeimmistä pisteyttäjistä.