1930-luvun loppupuolella Eisner esiintyi Amerikan taiteilijoiden kongressin jäsenenä. Neuvostoliiton hyökkäyksen jälkeen
Vuonna 1940 hän ja pieni ryhmä samanhenkisiä taiteilijoita jättivät kongressin - perustamaan avoimesti ei-poliittisen järjestön nimeltään Modernin Maalajien ja kuvanveistäjien liitto. Vuonna 1937 Eisner ja hänen miehensä matkustivat Meksikoon auttamaan Deweyn komissiota tutkimaan Neuvostoliiton hallituksen Leon Trotskia vastaan nostamia syytteitä vuoden 1936 ja 1937 Moskovan oikeudenkäynneissä. Eisner maalasi Trotskiä haastattelevista komission jäsenistä - Riveran ja Frida Kahlon omistamassa talossa Mexico Cityn laitamilla. Maalauksessa (vasemmalla) on Diego Riveran kuva, joka piirtää kohtauksen. Hän teki myös kaksi muotokuvaa Trotskista. He vitsailivat siitä, kun hän pyyhki pigmentin pois maalaamalla hänen kasvonsa. Hän vitsaili lempeästi, että nainen aikoi leikata hänen päänsä. Tämä maalaus on kuvattu kuvassa Trotski ja Eisner ylhäällä oikealla.