Schumacher jatkoi Williamsia vuonna 2000 - ja hänen kumppaninsa oli aloittelija-Jenson Button. Hänen kautensa alkoi hyvin: hän onnistui ottamaan kolmannen sijan Australian avajaiskilpailussa, ja hän saavutti viidennen sijan
Brasiliaan. Hän joutui vetäytymään San Marinon Grand Prix -kilpailusta polttoainejärjestelmän ongelman vuoksi, mutta onnistui saamaan peräkkäiset neljännen sijan seuraavissa kahdessa kilpailussa. Schumacher joutui kuitenkin taas eläkkeelle, kun hän jäi kiinni törmäyksessä, johon osallistui Eddie Irvine ja Jos Verstappen Euroopan Grand Prix -kilpailussa, ja toinen eläkkeelle siirtyminen seurasi Monakossa onnettomuuden vuoksi, jossa hän kärsi 3 tuuman leikkauksesta vasikansa poikki.