Elokuussa Butler komensi retkikuntajoukkoa, - joka yhdessä Yhdysvaltain laivaston kanssa valloitti Fort Hatterasin ja Clarkin.
Pohjois-Carolinassa. Tämä liike, ensimmäinen merkittävä liiton voitto ensimmäisen Bull Runin jälkeen, - oli ylistetty Washingtonissa ja voitti presidentti Lincolnin Butlerin kunnianosoitukset. Butler lähetettiin sen jälkeen takaisin Massachusettsiin keräämään uusia joukkoja. Tämä työnsi Butlerin vallankamppailuun kuvernööri Andrew'n kanssa, joka vaati säilyttämään valtuutensa nimittää rykmentin upseereja, kieltäytyen kommentoimasta (muiden joukossa) Butlerin veljeä Andrew'ta ja useita kenraalin läheisiä kumppaneita. Riita sai aikaan värväyssotaa Butlerin ja osavaltion miliisin välillä. Riita viivästytti Butlerin paluuta Virginian osavaltioon, mutta marraskuussa hänet nimitettiin maajoukkojen komentajaksi Louisianan operaatioissa.