Sisäiset sekasorrot pysäyttivät pitkälti Kiinan laajentumisen 1800-luvulla. Vuonna 1867 Yakub Beg johti kapinaa, jossa Kashgar julisti itsenäisyytensä.
Nian-kapinat imperiumin sydämessä - esttivät kiinalaisia vahvistamasta valtaansa.