Marraskuussa 1943 Baker sai komentajaksi 493. hävittäjäryhmän, 48. hävittäjäryhmän, Tullahoma, Tennesse. Alkuvuodesta 1944 hän lähti Euroopan operaatiokentälle yhdeksännen ilmavoimien ryhmän kanssa. Hän lensi P-47 Thunderboltin lentokoneella ilmahyökkäyksissä Euroopassa, Normandiassa ja Rheinlandissa.
- Mitä? Hän sai hopeatähden urhoollisuudestaan ja myös tammilehden Distinguished Flying Crossin. Toisen eurooppalaisen palvelusmatkansa loppuun mennessä hän oli lentänyt yhteensä 523 tuntia 272 taistelutehtävässä brittiläisillä Spitfire- ja Thunderbolt-hävittäjillä.