Hernández tuomitsi World Seriesissä 2002 ja 2005, sekä All-Star -pelissä 1999, 2009 ja 2017. Hän on tuominnut seitsemän League Championship Series (2000, 2001, 2003, 2004, 2007, 2010
, 2016), ja yhdeksän League Division Series (1997, 1998, 2002, 2005, 2009, 2011, 2012, 2015, 2017, 2018, 2020). Hernández työskenteli myös vuoden 2008 ALCS:n pelissä seitsemäntenä Derryl Cousinsille. Vuoden 2011 baseball-kauden toisella puoliskolla Hernández siirrettiin Joe Westin tuomarin joukosta Gerry Davisin joukkoon.