Toipumassa sairauksistaan hänet nimitettiin yhteyshenkilöksi 6. divisioonan päämajaan syyskuussa 1943 ja ylennettiin väliaikaiseksi majuriksi samana kuussa, mikä muuttui todeksi toukokuussa 1945. Myöhemmin hän osallistui Cabarlahin, Queenslandin, henkilökunnan kouluun, ja suoritettuaan kurssin hänet lähetettiin 1. Australian yhdistettyjen operaatioiden osastoon lokakuussa 1944. Hän oli 7. divisioonan päämajassa ja auttoi suunnittelemaan amfibialähteitä Morotaihin.
ja Balikpapan. Ferguson mainittiin hänen suunnitelmistaan.