Varhaisimmat arkeologiset todisteet ihmissiirtokunnista Lahden alueella ovat peräisin 8000-10 000 eKr. Vuonna 1769 lahden alueella asui Ohlone-ihmisiä, kun Gaspar de Portolà johtama espanjalainen tutkimusryhmä saapui lahdelle - ensimmäinen dokumentoitu eurooppalainen vierailu lahden alueella. Sen jälkeen kun Meksiko itsenäistyi Espanjalta vuonna 1821, alue oli lyhyesti Meksikon hallituksen hallinnassa, kunnes Yhdysvallat otti alueen haltuunsa vuonna 1846 Meksikon-Amerikan sodan aikana. Pian sen jälkeen Kaliforniassa löydetty kulta veti puoleensa aarteenetsijöiden tulvan, ja monet käyttivät satamia lahden alueella lähtökohtana. Kalifornian osavaltion alkuvuosina osavaltion lainsäädäntötoiminta kiertyi kolmen sijainnin välillä Lahden alueella ennen kuin pysyvä osavaltion pääkaupunki perustettiin Sacramentoon. Vuonna 1906 suuri maanjäristys tuhosi San Franciscon ja sen lähialueen, mutta alue rakennettiin nopeasti uudelleen niin, että se pystyi järjestämään Panaman ja Tyynenmeren näyttelyn vuonna 1915
- Mitä? Toisen maailmansodan aikana Bay Area oli merkittävä osa Amerikan sotaponnisteluja Aasian ja Tyynenmeren alueella, ja San Franciscon Fort Mason toimi ensisijaisena lähtöpaikkana amerikkalaisille joukkoille. Vuonna 1945 allekirjoitettiin San Franciscossa Yhdistyneiden kansakuntien peruskirja, joka perusti Yhdistyneet kansakunnat, ja vuonna 1951 San Franciscon sopimus palautti rauhanomaiset suhteet Japanin ja liittoutuneiden valtojen välille. Sen jälkeen Bay Area on kokenut lukuisia poliittisia, kulttuurisia ja taiteellisia liikkeitä, kehittäen ainutlaatuisia paikallisia genrejä musiikissa ja taiteessa ja vakiinnuttaen itsensä progressiivisen politiikan lämmityspaikkana. Taloudellisesti sodan jälkeinen Bay Area näki valtavan kasvun rahoitus- ja teknologiateollisuudessa, luoden elinvoimaisen ja monipuolisen talouden, jonka bruttokansantuote oli yli 700 miljardia dollaria, ja jossa oli kolmanneksi suurin Fortune 500 -yritysten pitoisuus Yhdysvalloissa (vuodesta 2018).