През януари 1942 г. Хоутън става втори командир на 40-то командване и участва в неуспешното нападение на Съюзниците над Германия.
Нападение над Диеп на 19 август 1942 г. Като повечето от неговия отряд, е заловен от германците в фиаското. Като военнопленник, Хоутон е окован в продължение на 411 дни и остава в плен до края на войната. Впоследствие е награден с военен кръст за храбростта си в Диеп и за издръжливостта си като военнопленник.