Изомери с различни медицински свойства са често срещани; например, разположението на метилни групи. В заместените ксантини, теоброминът, открит в шоколад, е вазодилататор с някои ефекти, общи с кофеина; но ако една от двете метилни групи е преместена в различна позиция на двуколесното ядро, изомерът е теофилин, който има разнообразни ефекти, включително бронходилация и противовъзпалително действие. Друг пример за това се появява в стимулиращите лекарства на основата на фенетиламин. Фентермин е нехирално съединение с по-слаб ефект от този на амфетамина.
теобромин