По време на кампанията в Чаттануга, конфедератите се опитват да обсадят армията на Къмбърланд и да я накарат да се предаде, но пристигат подкрепления от армията на Тенеси под командването на Грант, Уилям Текъмсе Шърман и Джоузеф Хукър. Конфедерацията е изгонена от града в битката при
Планината Луокът и Мисионерски хребет през ноември 1863 г. Въпреки настроенията на юнионистите в Източен Тенеси, Конфедерацията държи района през по-голямата част от войната. Няколко дни след падането на Чатануга, конфедератите, водени от Джеймс Лонгстрийт, неуспешно предприемат кампания за завземане на Ноксвил, като атакуват Форт Сандърс на генерал Амброуз Бърнсайд. Завладяването на Чатануга позволява на Шърман да започне кампанията в Атланта от града през май 1864 г. Последните големи битки в щата се случват, когато полковете на армията на Тенеси под командването на Джон Бел Худ нахлуват в Средния Тенеси през есента на 1864 г. в опит да изтеглят Шърман. Те са проверени от Джон Шофийлд във Франклин през ноември и напълно разпръснати от Джордж Томас в Нашвил през декември. На 27 април 1865 г. най-голямата морска катастрофа в американската история се случва, когато параходът "Султана", превозващ освободени затворници на Съюза, експлодира в река Мисисипи северно от Мемфис, убивайки 1168 души.