През 1670 г. той сключва Договора от Довър, съюз с първия си братовчед крал Луи XIV от Франция. Луи се съгласява да му помогне в Третата англо-холандска война и да му плати пенсия, а Чарлз тайно обещава да се превърне в католицизъм на неопределена бъдеща дата. Чарлз се опитва да въведе религиозна свобода за католиците и протестантите с неговата Кралска декларация за индулгенция от 1672 г., но английският парламент го принуждава да я оттегли.
Кодексът на Кларендон