За първи път след дебюта си в международното състезание на Световната първенство през 2013 г., Ширай не се класира за японския мъжки национален отбор AG; следователно, невъзможността да се състезава на Световното първенство по художествена гимнастика 2019 г. в Щутгарт, Германия, на 4-13 октомври 2019 г. Изпълненията на Ширай са забавяни през по-голямата част от сезона 2019 г. от доста упорита и досадна контузия на лявия глезен, в резултат на което той не е в състояние да се състезава най-добре по време на Световното японско първенство по апаратура през 2019 г., че резултатите там и на NHK Trophy през 2019 г. определят допустимостта на гимнаст да се присъедини към японския национален отбор в
Клозето на 2019 г. Най-добрият шанс на Ширай беше да получи едно от двете свободни места на специалисти, по-конкретно на събитията на FX и VT. Въпреки това, Ширай успява да заеме 3-то място на FX и 5-то на VT, което го кара да не се класира за Световната купа и не е в състояние да защити световните си медали от 2018 г. Също така, тъй като Ширай не беше единственият отсъстващ от високо ниво (Кохеи Учимура също не беше там поради наранявания), японските мъже изпратиха доста неопитен отбор на Световното първенство през 2019 г., където мъжкото състезание беше доминирано от други страни. Ширай работи усилено, за да се върне в състезателна форма за продължителен период от време, опитвайки се да се възстанови от различни наранявания, а след това става доста ръждясал на всяко събитие.