Завърши следното изречение: Способността на бактериите да разграждат различни органични съединения е забележителна и е използвана при преработката на отпадъци и биоремедиацията. Бактериите, способни да разграждат въглеводородите в петрола, често се използват за почистване на петролни разливи. На някои от плажовете в залива Принц Уилям са били добавени торове в опит да се насърчи растежа на тези естествено срещащи се бактерии след 1989 г.
"Ексон Валдез" петролен разлив. Тези усилия били ефективни на плажовете, които не били твърде гъсто покрити с нефт. Бактериите се използват и за биоремедиация на промишлени токсични отпадъци. В химическата промишленост бактериите са най-важни при производството на енантиомерно чисти химикали за употреба като фармацевтични или агрохимикали.