Завърши следното изречение: Вебер се записва да се бие в Гражданската война като полковник на 16 май 1861. Той създава германско-американска единица, известна като "Търнър Райфълс", рота, която в крайна сметка става част от 20-ти Нюйоркски пехотен полк. Уебър е бил в Форт Монро във Вирджиния. Той участва в
Завладяването на Форт Хатерас. От септември 1861 до май 1862 г. командва лагер Хамилтън, близо до Форт Монро, като е назначен за бригаден генерал на доброволците на 28 април 1862 г. Той е бил в Нюпорт Нюс по време на битката между "Монитор" и "Вирджиния" в очакване на атака на Конфедерацията от сушата. Участва в завземането на Норфолк, Вирджиния през май, а след това командва в Сафолк до септември, когато е изпратен в Армията на Потомак, където командва Трета бригада, Трета дивизия, Втори армейски корпус в Армията на Потомак.