По време на нахлуването в Полша с ранг капитан участва в
Битката при Модлин. Той организира отделение на Służba Zwycięstwu Polski (по-късно преобразувано в Związek Walki Zbrojnej и след това в Armia Krajowa) в Поморце. Той играе важна роля в координирането на дейностите на различни полски организации за съпротива в областта на Поморце, докато повечето от тях не се сливат в Армия Кражова. След смъртта на Йозеф Ратайчак през май 1940 г., той е неофициален командир на полската съпротива в Поморце. От 1943 г. е командир на щаба на Komenda Okręgu Armii Krajowej Pomorze под командването на окръжния комендант Ян Палубицки (кодово име "Януш"). През това време той живее предимно в Торун, въпреки че на всеки няколко месеца пътува до Варшава за срещи с командири на АК (Стефан Ровецки и Тадеуш Коморовски).