По нареждане на министъра на транспорта и съобщенията е обявен за национален превозвач през ноември 2002 г. Bulgaria Air започва да извършва полети под името "Balkan Air Tour". Авиокомпанията е известна с това име само за кратък период от време. Името "Bulgaria Air" и първоначалното лого са определени чрез публичен конкурс. Air Bulgaria е приватизирана през 2006 г.; въпреки че се говори, че правителството иска да продаде превозвача на голям чуждестранен инвеститор, група местни компании, водени от Hemus Air, се очертава като купувач, като италианската авиокомпания Air One е единственият друг претендент.
През 2006 г.