През 1958 г. той активно участва в Бхадра Абагия Андалон, (Движение за гражданско неподчинение), стартирано от Непалския конгрес. През 1959 г. той активно се включва в целта на партията за провеждане на демократични избори. Изборите видяха Бишвешвар Прасад Койрала да стане първият избран министър-председател на страната. Въпреки това, кралят Махендра планира и осъществява преврат през декември 1960 г. и прогонва Бишвешвар Прасад Койрала. Това доведе до изгнанието на няколко членове на Непалския конгрес в Индия, включително Сушил Койрала. Той остава в политическо изгнание в Индия в продължение на 16 години след превземането на Непалския конгрес през 1960 г. Той също така прекарва три години в изгнание в индийските затвори за участието си в отвличането на самолет в 1973 г.
16 години