Грийли първоначално не подкрепя Линкълн за номинация през 1864 г., като се обръща към други кандидати. През февруари той пише в "Трибун", че Линкълн не може да бъде избран за втори мандат. Независимо от това, никой от кандидатите не е направил сериозно предизвикателство към Линкълн и Линкълн е номиниран през юни, което "Трибун" леко аплодира. През август, страхувайки се от победа на демократите и приемането на Конфедерацията, Грийли се ангажира с заговор, за да накара нов конгрес да номинира друг кандидат, като Линкълн се оттегля. Заговорът се провали. Веднъж.
След като Атланта е превзета от силите на Съюза на 3 септември, Грийли става пламенен поддръжник на Линкълн. Грийли е доволен от преизбирането на Линкълн и продължаващите победи на Съюза.