При избухването на мексиканско-американската война през юни 1846 г. Ван Бюрен е назначен отново в армията като касиер с ранг майор. Ван Бюрен служи като помощник на генералите Закари Тейлър и Уинфилд Скот и участва в битката при Контрерас, битката при Монтерей,
Обсадата на Веракрус, битката при Серо Гордо и битката при Чурубуско.