Historian zehar, Txinako hainbat dinastiak Xinjiang-eko zati batzuen gaineko kontrola izan dute. Eskualdea Txinaren mendean geratu zen mendebalderantz egin zuen hedapenaren ondorioz.
Qing dinastiaren mendeetan, 1700. urtean Txina, Tibet eta Mongolia konkistatu zituzten. Xinjiang Qing inperioaren zati periferikoa izan zen eta Dungan matxinadan (1862-1877) independentzia berreskuratu zuen.