Bere lan gehienak Italiara itzuli ondoren egin zituen, eta zalantzazko konposaketa batzuk bakarrik Alemanian bizi izan zen garaian egin zituen. Bere genero nagusia balleta izan zen, hala ere, zaila da bere produkzioaren kalitateari buruzko epaia egitea, bere musikaren gehienak ez baitira iraun eta bere garaiko kritikari epaia gutxi ezagutzen baitira. 1775 eta 1777 artean sei ballet idatzi zituen, eta 1778an bi ballet Florentziako Teatro Comunale-rentzat eta opera bat Stuttgart-erako. 1779an Teatro alla Scala-ko kontzertu-maisu eta zuzendari bihurtu zen, 23 urtez mantendu zuen kargua. 1783 eta 1788 artean zazpi ballet idatzi zituen La Scalarentzat, eta aldi berean Pio Istituto de' Professori di Musica-ko kontzertu zuzendaria ere izan zen. 1797an, okupazio frantziarrean,
Errepublikar inspirazioaren balleta idatzi zuen. 1802an, antzokiko zuzendaritzaren eta orkestraren arteko polemikan arbitroa izan zen. 1803an La Scalan utzi zuen bere postua, eta Alessandro Rollak ordezkatu zuen. Baillou Milanen hil zen 1804an eta San Gregorio hilerrian lurperatu zuten, XIX. mendearen amaieran eraitsi zuten. Bere azken balleta, "La disfatta di Abderamo", 1809an estreinatu zen, hil ondoren. Bere seme-alabak eta bilobak musikari bihurtu ziren eta La Scala-n lan egin zuten.