Osatu esaldi hau: Alemaniak Polonia inbaditu eta Bigarren Mundu Gerra hasi ondoren, 1939ko irailean, SS-Totenkopf-Standarte Brandenburg herrira sartu zen, herritarren aurkako hainbat delitu egiteko. 1939ko irailaren amaieran, alemaniarrek Kłodawako bahitu poloniarrak hil zituzten Rzuchóweko basoan, eta gerra aurreko alkateetako bat, Władysław Zalewski, 1939ko azaroan hil zuten Środa Wielkopolska-n. Bitartean
Alemaniako okupazio naziaren ondoren, herriak "Tonningen" izena hartu zuen (1940<unk>1945). Dagoeneko 1940an, Poloniako erresistentzia mugimendu clandestinoa sortu zen herrian, eta eskola poloniar sekretua ere antolatu zen. 1941ean, Alemaniar naziek Chełmno heriotza-esparruan 1.500 Kłodawan judu baino gehiago hil zituzten. 1943an, alemaniarrek bertako erresistentzia-kide poloniar batzuk atxilotu zituzten, eta orduan heriotza edo kartzela zigorra ezarri zieten. Kłodawako parrokiako apaiza, Aita Teofil Choynowski, Dachauko kontzentrazio esparruan hil zuten 1943an. Kłodawa 1945eko urtarrilaren 19an askatu zuen Armada Gorriak, eta Poloniara itzuli zen.