Homologoak ez diren errekombinazio ez-homologikoak kaltegarriak izan daitezke zeluletan, translokazio kromosomikoak eta anormalitate genetikoak sor ditzakete. Errekombinazioaren lehen urratsa enzima batek katalizatzen du, rekombinazio gisa ezagutzen direnak, adibidez RAD51. Errekombinazioaren lehen urratsa bikoitza da, nukleaze batek eragindakoa, edo DNA-aren mendebaldeko muturrak kaltetuta.
Bi dira.