1940ko irailean, Aboulkerrek erresistentzia-sarea sortu zuen Aljerren, bere lehengusu Roger Carcassonne-rekin batera, Oran-en gauza bera egin zuena, eta Aboulker, ondoren, Vichy Aljeriako pro-nazi erresistentzia-mugimenduaren buruzagi nagusietako bat bihurtu zen. Bi lehengusuek Henri d'Astier de la Vigerie ezagutu zuten, eta harekin prestatu ziren Afrikako iparraldean aliatuen lehorreratzeak laguntzeko.
Germain Jousse koronelarekin eta Robert Murphy kontsulararekin, Roosevelt presidentearen ordezkaria Aljerren. Bere aitaren etxean kokatu zuten, Rue Michelet kaleko 26an.