1979ko urriaren 15ean, Gobernu Iraultzailearen Juntak (JRG) El Salvadorreko kontrola hartu zuen, Carlos Humberto Romero presidentea kargutik kenduz. Estatu Batuetako gerra zibilaren hasiera da.
-Ez da izango. Duarte 1980ko martxoaren 3an El Salvadorera itzuli zen eta Juntan sartu zen, El Salvadorreko atzerri ministro bihurtuz.