Zelula eukariotikoak duela 1.600.000.000.000 urte agertu ziren. Zelula eukariotikoen egituran hurrengo aldaketa nagusia bakterioak zelula eukariotikoek irentsi zituztenean gertatu zen, endosimbiosia izeneko elkarte kooperatibo batean. Bakterio irentsiak eta zelula hartzaileak koeboluzioa jasan zuten, bakterioak mitohondrietan edo hidrogenozomoetan eboluzionatuz.
Ez dago aldaketa nabarmenik ez morfologian, ez zelula-antolamenduan.