2011ko martxoaren 12an Japonia ipar-ekialdean lurrikara eta tsunamiaren ondoren
, Kanek helikoptero batean hegan egin zuen Fukushima I.a zentral nuklearra behatzeko eta Fukushima Daiichi hondamendi nuklearrari eraginkortasunez erantzuteko ahaleginetan parte hartu zuen. Naoto Kanek gero eta jarrera anti-nuklearra gehiago hartu zuen Fukushimako hondamendiaren ondorengo hilabeteetan. Maiatzean, Hamaokako zentral nuklearra itxi zuen lurrikara eta tsunamiaren beldurrez, eta erreaktore berriak eraikitzeko planak izoztuko zituen.