2012ko uztailaren 27an, Scutaro San Francisco Giants taldera joan zen Charlie Culberson jokalariaren truke. 2012ko abuztuaren 8an Busch Stadium-en St. Louis Cardinals taldearen aurkako partidan, Scutaro-k karrerako zazpi lasterketa egin zituen, Grand Slam bat barne. Denboraldi erregularrean 306 jaurtiketa egin zituen, horien artean 362 Giants-en, eta Giants-ek National League West titulua irabazten lagundu zuen. NLCSko MVP saria jaso zuen 14 kolperekin NLCSko errekorra berdindu eta.500-ko erronka bat egin ondoren (14 28koan) Cardinals taldearen aurkako zazpi partidetan.
-Ez da izango. Urriaren 28an, 2012ko World Serieseko 4. partiduaren hamargarren jardunaldian, Scutaro Ryan Theriot sartu zuen, Giantsek Detroit Tigers garaitu zutenean.