1983ko abenduaren 1ean, Juan Pablo II.a Aita Santuak Guatemala Hiriko XVII. Metropoli Artzapezpiku eta Esquipulaseko prelato izendatu zuen Penados. Guatemalako artzapezpiku gisa zerbitzatu zuen urteetan, Penadosek Eliza Katolikoaren ikuspegi kontserbadorea aldatu zuen nazioaren eszenatoki politikoarekiko, garai hartan Gerra Zibileko urte zailenetako batzuk pairatzen zituena.
-Ez da izango. Bake negoziazioetan funtsezko papera izan zuen, iraganeko erregimen militarrek eta Guatemalako armadak egindako giza eskubideen aurkako gehiegizko urraketak salatuz, eta giza eskubideen aldeko aktibismoa eta Guatemalako genozidioaren biktimei emandako babesaz. 1990ean "Oficina de Derechos Humanos del Arzobispado de Guatemala" (ODHA / Artzapezpikuordetzaren Giza Eskubideen Bulegoa) sortu zuen.