1260an, Baybars eta bere Mamluk armada Nazareteko erasoan eliza suntsitu zuten. 1291ean, frantziskotar gutxi batzuk Nazareteko eliza berri bat eraikitzea lortu zuten. Ondorengo hiru mendeetan, frantziskotarrak Nazareten sartu eta irten ziren, tokiko egoera politikoaren arabera, etengabe aldatzen zena. Garai horretako frantziskotar kontuek 1363. urtean kanporatzea, 1468an itzultzea eta 1542an haien kide batzuen sarraskia dokumentatzen dute. Tokiko familia kristauek frantziskotarren laguntzarekin lagundu zuten eliza zaintzen garai horretan ere.
1954 urtea.