Hiru hilabete geroago, dena aldatu zen. 1906ko apirilaren 18an, San Franciscoko lurrikarak...
Hiriaren kontra amiltzen... eraikinak eraitsi... milaka lagun hil, Leavitt-en apaizartea suntsitu eta eliza suntsitzen dute. Lurrikarak elizaren kanpaia bere dorretik astindu zuen, teilatutik behera botaz, eta erlijio zerbitzuak aldi batez eteten zituen. Lurrikarak komunikatzaile askoren etxeak ere suntsitu zituen, eta beste batzuk hiri suntsitua utzi zuten. Hurrengo urteetan, Leavitt-en presentzia pastorala nabaria izan zen Bay Area suntsituan zehar. 1907an, Leavitt Palo Altoko Leland Stanford Junior Unibertsitateko Memorial Elizako unibertsitateko predikarietako bat izendatu zuten. (Leavitt geroago sermolari berezia izan zen unibertsitatean, sermoia ematen zuen ikasturte akademikoan zehar beste igande batzuetan, eta hainbat batxilergoko sermoia eman zituen Stanfordeko graduazio zerbitzuetan Lehen Unitarioen Elizan jardun zuen bitartean).