Askatu zutenean, Allen New Hampshirera itzuli zen, 1777. urtean independentzia aldarrikatu zuten lurraldeetara, eta jarduera politikoak berreskuratu zituen lurraldean, New Yorkek lurraldearen gaineko kontrola berreskuratzeko ahaleginei aurre egiten jarraituz. Allenek Kongresua irabazi du
Vermont estatu ofizial gisa aitortzeko, eta britainiarrekin negoziazio eztabaidatuetan parte hartu zuen, Vermont probintzia britainiar bereizgarri bihurtzeko aukeraren inguruan.