Idatzi jarraipena paragrafo honetarako - Saladinen anaia Al-Adil-ek zitadela erabat berreraiki zuen 1203 eta 1216 artean, kontrapisuaren trebuchetaren garapenari erantzunez. Bere heriotzaren ondoren, beste printze aiubideren arteko botere borrokak piztu ziren eta Damaskok hainbat aldiz eskuz aldatu bazen ere, hiritzarra behin bakarrik hartu zuten indarrez, 1239an. Zitadela Ayyubiden eskuetan egon zen, 1260an, Kitbuqa jeneralaren agindupean, mongoliarrek Damaskoko hiria hartu zuten arte, horrela, Siriako Ayyubiden aginteari amaiera emanez. Zitadelako matxinada batek porrot egin ondoren, mongoliarrek zati handi bat suntsitu zuten. 1260an mamelukoek mongolak garaitu eta gero, Damaskos mamelukoen menpe geratu zen. 1300 eta 1401 urteetako aldi laburrak izan ezik, mongoliarrek Damaskoa konkistatu zutenean, mamelukoek gotorlekua 1516ra arte kontrolatu zuten. Urte hartan, Siria Otomandar Inperioaren eskuetan erori zen. Damaskok borrokarik gabe amore eman zuen eta XVII. mendetik aurrera, zitadela janisarioen infanteriako unitate otomandarren kuartel gisa funtzionatu zuen. Zitadela XIX. mendean hondatzen hasi zen eta azkenekoz 1925ean erabili zen, soldadu frantsesek hiri zaharra bonbardatu zutenean, Siriako matxinada handiari erantzunez.
Siriako Frantziaren Mandatuaren kontrakoa. Zitadela barrakak eta espetxe gisa erabiltzen jarraitu zuen 1986ra arte, indusketa eta zaharberritze lanak hasi ziren arte. 2011 urterako, indusketa eta zaharberritze lanak jarraitzen dira.