Peiperrek Himmlerrekin hitz egin zuen azken aldiz otsailaren 4an... bere egoitzan. Haren ondoren, hegoaldeko haizeetan borrokatu zen. Bere unitateak
Udaberriko iratzargailua, porrot egin zuena. Peiperren unitateak hildako ugari eragin bazituen ere, bere aginte estilo agresiboagatik gizon asko galdu zituen. Maiatzaren 1ean, LSSAH Austriara behartuta sartu zenean, Peiperren gizonei Hitlerren heriotzaren berri eman zieten. Maiatzaren 8an, LSSAHk Enns ibaia gurutzatzeko eta tropen aurrean amore emateko agindua jaso zuen. Amore ematearen ordez, Peiperrek etxerako bidea aukeratu zuen. Maiatzaren 22an atxilotu zuten tropek.