Proteinaren egitura bere sekuentzia baino askoz ere gehiago ematen du. Horregatik, hainbat metodo garatu dira proteinen egitura bere sekuentziatik aurreikusteko. Ab initio aurreikuspen metodoek proteinen sekuentzia bakarrik erabiltzen dute. Zuzentze eta homologia modelatzeko metodoek proteina familiaren egitura esperimentaletatik egitura ezezaguneko proteina baten 3D eredua eraiki dezakete. Galdera: Proteinen zein zatiak ematen du informazio baliotsua bere funtzioari buruz?
egitura