1791eko irailean Vienara itzuli ondoren, Baudinek Indiako Ozeanoan eta Txinan inperioaren banderaren azpian espedizio bat egiteko bere kasua bultzatzen jarraitu zuen, eta 1792ko urtarrilean ontzidi inperialean kapitaina izendatu zuten horretarako. "Jardinière" izeneko itsasontzia eskuratu zen eta Franz Bredemeyer eta Joseph van der Schot botanikariak izendatu zituzten espediziora. Frantzia eta Austriaren arteko gerraren ondoren,
1792ko apirilean, "Jardinière" Espainiako Malagako portutik abiatu zen 1792ko urriaren 1ean. Esperantza Onaren Lurmuturretik, "Jardinière" Indiako Ozeanoan zehar New Hollandeko (Australia) kostaldera iritsi zen, baina bi zikloik jarraian eragotzi zioten espedizioari bertan lanik egitea eta Baudin behartu zuten itsasontzia Bombayra eramatera konponketak egiteko.