Baldini kalera bota zuten, emaitza lausoak izan arren. 2011ko abenduan, klubak lau entrenatzaile izan zituen 2009-10 denboralditik. Klubak Serie B estatusa mantendu zuen 2011-12an. Denboraldi txarraren ondoren, Empolik 18. postuan amaitu zuen, puntu bat segurtasunetik, eta horrek Vicenzaren aurkako jaitsiera play-off bat esan nahi zuen bi jardunaldietan. Lehen partidua gola gabe amaitu zen, eta Vicentzak 2 eta 0 irabazi zuen bigarren partidan, 30 minutu falta zirenean. Hala ere, bi minutuan bi golek berdindu zuten "Azzuri"k berdinketa, Massimo Maccaronek 3 eta 2ko garaipena lortu aurretik, lesioaren laugarren minutuan. 2012-13 denboraldian klubak laugarren postua lortu zuen, aurreko denboraldian egindako hobekuntza dramatikoa, baina promozioaren play-off finala galdu zuen Livornoren aurka. Hurrengo denboraldian Serie A-ra igo zen, Palermo-ren bigarren postuan amaituz eta bi denboralditan lehen mailakoan geratu zen, 2014an 15. postuan eta 2015ean 10. postuan amaituz.
-Ez da izango. 2016-17 Serie A denboraldiko azken partidan, Empoli Crotonen aurretik jaitsiera-gunearen gainetik zegoen, baina azkenean Serie B-ra jaitsi ziren Palermo garaitzea lortu ez zutelako, eta Crotonek Lazio garaitu zuen bitartean. 2017-18 Serie B garaipenaren ondoren, Empolik berehala berreskuratu zuen Serie A-ra igoera, Serie B irabazi ondoren 2018ko apirilaren 28an, lau partida aurretik. 2018/19 Serie A denboraldiko azken partidan, Empoli Genoaren aurretik jaitsiera-gunearen gainetik puntu bat zegoen, baina azkenean Serie B-ra jaitsi ziren Internazionalen garaitu ondoren, Genoa Fiorentinarekin berdindu zen bitartean, bi aldeek puntu kopuru berdinarekin amaitu zuten, baina Genoak gol-diferentzia bat handiagoa zuen. Hala ere, Empoli lehen postuan amaitu zen 2020/21 Serie B denboraldian, bere historiako hirugarren titulua izateko.