Arraseko Hitzarmenak Espainiako tropek beren lurrak uztea eskatzen zuen. Bien bitartean, Felipek bere erregetzaren pean Iberiar Penintsula osoa batzea zuen helburu, Espainiako erregeen helburu tradizionala. Aukera 1578an iritsi zen, Sebastián errege portugaldarrak Marokoren aurkako gurutzada abiatu zuenean. Espedizioa desastrez bukatu zen, eta Sebastian desagertu egin zen espedizioan.
Hiru Erregeen Gudua. Bere osaba Henrike zaharrak 1580an hil arte gobernatu zuen. Filipek Portugal hartzeko aspaldi prestatu bazuen ere, Alvako dukeak gidatutako okupazio militarra abiaraztea beharrezkoa ikusi zuen. Felipek Portugalgo errege titulua hartu zuen, baina, gainera, herrialdeak autonomia mantendu zuen, bere legeak, moneta eta erakundeak mantenduz. Hala ere, Portugalek kanpo politikan duen independentzia guztia eman zuen, eta bi herrialdeen arteko harremanak ez ziren inoiz beroak izan.