Hegaldi-bonbardaketa hegalak "Generalfeldmarschall" Erwin Rommel-en Afrika Korpsari lagundu zion bere bi urteko kanpainan Afrikako iparraldean; bere beste zeregin nagusia Aliatuen itsasontziak erasotzea zen. 1941ean, Ju 87ren Ipar Afrikako operazioetan Tobrukeko setioa nagusitu zen, zazpi hilabete baino gehiago iraun zuena. Gazalako guduan eta El Alameineko lehen guduan zerbitzatu zuen, baita El Alameineko bigarren guduan ere, Rommel Tunisiara itzuli zena. 1942ko udazkenean, aliatuen aireko indarra handitu zenean, Ju 87 oso zaurgarria bihurtu zen eta galerak handiak izan ziren. Amerikarrek Ipar Afrikako lurretan sartu zirenean, Torch operazioan.
egoera askoz okerrago bihurtu zen; Stuka desagertu egin zen gerra-bonbardaketa batean. Bf-109 eta Fw-190ek gutxienez baldintza berdinean aurre egin zezaketen etsaiaren borrokalariei artilleria bota ondoren baina Stukak ezin izan zuen. Ju 87-ren ahultasuna 1942ko azaroaren 11n erakutsi zen, 15 Ju 87D-k Estatu Batuetako Armadaren Aireko Indarrek (USAAF) Curtiss P-40F-ek minutu batzuetan jaurti zituztenean. (Ring/Shoresen arabera, 15 Ju 87 zeuden misioan, 2.SAAF Eskuadroiak 8 lurreratu zituen, 4 probable eta 3 57. Fighter Group-ek. Bi afrikar eta estatubatuar soldadu galdu ditugu. Hiru preso, zauritu bat. Hildakorik ez.