1939ko irailaren 1ean Alemaniak Polonia inbaditu zuen... Bigarren Mundu Gerra Europan hasi zedin... eta irailaren 17an, Molotov-Ribbentrop Akordioaren arabera, Sobietar Batasunak Polonia inbaditu zuen. Ondoren, Polonia berriro zatikatu zen bi botere horien artean eta okupazioan jarraitu zuen.
Gerra ia osoan zehar. Urriaren 1ean, Alemaniak eta Sobiet Batasunak erabat gainditu zuten Polonia, nahiz eta Poloniako gobernuak ez zuen sekula formalki amore eman, eta Poloniako Estatu Klandestinoa sortu zen, erbesteratutako gobernuaren menpekoa. Urriaren 8an, Alemaniako Naziak gerra aurreko Poloniako mendebaldeko eremuak anexionatu zituen eta, okupatutako eremuaren gainerakoan, Gobernantza Nagusia sortu zuen. Sobietar Batasunak aldi baterako utzi behar izan zituen 1939an lortutako lurralde irabaziak, Alemaniaren inbasioaren ondorioz, baina behin betiko berrezartutako lurralde hauetako asko 1944ko erdialdean berreskuratu ondoren. Gerraren zehar, Poloniak gerra aurreko biztanleriaren %20 baino gehiago galdu zuen Bigarren Poloniar Errepublikaren amaiera markatu zuen okupazioaren erdian.