Woffordek aurretik secesioaren kontra bozkatu zuen... baina Estatuari eta Konfederatuen armadari zerbitzua eskaini zien. Georgiako Estatuko Miliziako koronel izendatu zuten, eta gero Georgiako 18. infanteriako kapitaina 1861eko apirilean. Apirilaren 25ean, Wofford koronela izendatu zuten, eta Ipar Karolinako eta Virginiako zerbitzuan aritu zen John Bell Hood brigada jeneralaren Texasko brigadan jarri aurretik. Borrokaldiak izan zituen Yorktownen, Eltham Landing-en eta Seven Pines-en.
Penintsulako kanpainan. Wofford eta 18.a Bigarren Bull Run eta Antietamen ere borrokatu ziren, non Texasko brigada agindu zuen.