1793an Frantziarekin gerra hasi zenean, Hothamen itsasontzi nagusiko komandante izendatu zuten, 100 kanoi zituena, eta Touloneko setioan parte hartu zuen. 1794ko amaieran Samuel Hood almirantea berreskuratu ondoren, Hotham Mediterraneoko Flotako Komandante Nagusi bihurtu zen, eta Holloway Flotako Kapitaina. Horrela hartu zuen parte
Genoako bataila 1795eko martxoan eta Hyères uharteetako bataila uztailean. Urtearen amaieran, Sir John Jervis almiranteak ordezkatu zuen Hotham, eta Holloway 98 kanoien agintaritzarako izendatu zuten. 1797ko maiatzean Spithead mutiny-an parte hartu zuen, eta ondoren, Channel Fleet-en agintea hartu zuen.