1996ko Estatu Departamentuaren abisu bat Bin Laden eta 1998ko Estatu Batuetako enbaxaden bonbardaketei buruz Ekialdeko Afrikan
Clinton-ek hainbat misio militar agindu zituen Bin Laden atzemateko edo hiltzeko, eta horiek guztiak porrot egin zuten. 1998ko abuztuan, Clintonek Afganistanen eta Sudanen terroristen helburuen aurkako kruzero misilen erasoak agindu zituen, Al-Shifa farmazeutikoaren lantegia Sudanen, bin Ladeni arma kimikoak egiten laguntzearen susmagarria zelako, eta bin Ladenen terroristen prestakuntza kanpalekuak Afganistanen.