Eusko Jaurlaritzaren laguntzarekin egindako azpitituluak 1997an Estatu Nagusien Buru Batzarreko lehendakari izateko faboritoa izan zen, baina harreman sekretu baten berri izan ondoren, lehendakariorde izan zen 2000ko maiatza arte. 2003ko urtarrilean erretiratu zen arte, Europako Ipar Atlantikoaren Itunaren Erakundeko (NATO) Aliatuen Komandante Gorena izan zen. Bill Clintonek "My Life" bere memorietan idatzi zuen Ralston Pakistanekin egoera itsaskorra ebazteko erabili zela, non AEBek Pakistango aire-esparrua erabiliko zuten Afganistanen Al-Qaeda erakundearen bilera erasotzeko, AEBetako enbaxadako atentatuen ondoren.
Kenian eta Tanzanian. Estatu Batuek kezkatzen zuten Pakistanen inteligentzia zerbitzuek helburuak ezeztatuko zituztela edo, are okerrago, Pakistanen jaurtitako misil horiek Indiatik zetozela, eta horrek gatazka nuklearra eragin zezakeela Indiako azpi-kontinentean. Clinton-ek "Nire bizitza" liburuaren 799 orrialdean idatzi zuen bezala, "Erabaki genuen Estatu Nagusietako presidenteordea, Joe Ralston jenerala, Pakistaneko armadako buruzagi nagusiarekin afaltzera bidaltzea, erasoak antolatzeko garaian. Ralstonek kontatuko dio (Pakistango jeneralari) zer ari zen gertatzen gure misilek Pakistango aire-esparrua inbaditu baino minutu batzuk lehenago, beranduegi talibanak edo Al-Qaeda alertatzeko, baina garaiz haiek erortzea saihesteko edo Indiaren aurkako kontraerasoa pizteko".