Gerraren hasieran, Cowdin Massachusettseko 2. erregimentuko koronela zen eta 1861eko maiatzaren 25ean Massachusettseko 1. infanteriako koronela izendatu zuten. Bere erregimentuaren buru izan zen Blackburn's Ford-eko guduan 1861eko uztailaren 18an, eta Israel B. Richardson-en Daniel Tyler-en Dibisioko brigadako kide izan zen Bull Run-eko lehen guduan, non bere zaldia hil zen. Gerra eremura joan zen Williamsburg eta Fair Oaks-era.
Glendale, Malvern Hill eta Chantilly.