Prolaina eta glizina batzuetan "helix breakers" izenez ezagutzen dira, α helical bizkarrezurraren konformazioaren erregulartasuna hautsi dutelako; hala ere, biek ezohiko konformazio gaitasunak dituzte eta ohikoak dira txandaka aurkitzen direnak. Proteinen konformazio helikoiak hartzea nahiago duten aminoazidoak metionina, alanina, leuzina, glutamatua eta lisina dira ("MALEK" aminoazidoaren 1 letrako kodeetan); kontrastean, hondakin aromatiko handiek (triptofano, tirosina eta fenilalanina) eta Cβ-adarkatutako aminoazidoek (isoleucina, valstronina eta threonina) beta- eta β-konformazioak hartzea nahiago dute. Hala ere, lehentasun horiek ez dira nahikoa indartsuak bigarren egitura sekuentziaren aurreikuspen metodo fidagarri bat lortzeko.
bigarren mailako egitura