1900eko ekainean Boxerren matxinada piztu zen Txinan. Chaffee koronela Txinara bidali zuten uztailean laguntzeko espedizioaren buru bezala. Mendebaldeko herritarrak erreskatatzera eta matxinada geldiaraztera bidali zen nazioarteko indarraren parte zen espedizioa. Chaffik Gaselee espedizioan parte hartu zuen eta, ondoren, Pekingo guduan.
, legatuak kendu zizkioten. 1900-1901ean, Estatu Batuetako indarrak Pekingo (Beijing) okupazio aliatuan sartu ziren. Komandante estatubatuar gisa, Chaffeek laguntza ofiziala eta polizia-operazioak hasi zituen Txinako gobernuarekin lankidetzan. Chaffek ondorioztatu zuen asiarrek botere nagusia bakarrik errespetatzen zutela. Filipinetara bidali zuten, eta han aplikatu zituen ikasketak, onginahia eta osasun publikoko neurriak indarrarekin eta tokiko funtzionarioekin lankidetzarekin uztartuz.