Bigarren Mundu Gerra hasi zen Poloniako Alemaniaren inbasioan, 1939ko irailaren 13an, Leżajsk Wehrmachtek hartu zuen. Ondoren, Alemaniako "Einsatzgruppe I"a sartu zen herrian, herritarren aurka hainbat krudelkeria egiteko. 1939ko azaroaren 3an, segurtasun polizia alemaniarrak bertako poloniarren atxiloketa masiboak egin zituen "Intelligenzaktion"ren barruan. Gero, poloniarrak bertako espetxean atxilotu zituzten edo hilerrian sarraskitu zituzten. Eraildako poloniarren artean irakasleak, eskola zuzendariak, apaizak eta ofizial militarrak zeuden. 1940ko apirila eta maiatzean errusiarrek Katyneko sarraski handiaren biktimen artean ere Leżajskeko poloniarrak zeuden. Okupazio garaian.
, bertako armada oso aktiboa zen eremuan. 1940ko maiatzaz geroztik, "Odwet" egunkari poloniar clandestinoa Leżajsk-en banatu zuen Poloniako erresistentzia mugimenduak. 1943ko maiatzaren 28an, alemaniarrek 43 herritar fusilatu zituzten. Leżajsk 1944ko uztailaren 27an hartu zuen Armada Nazionalak.