1941eko ekainaren 22an hasi zen Barbarossa operazioa, Alemaniak Sobietar Batasuna inbaditu ondoren, Yermolkinek Hego-mendebaldeko Frontean borrokatu zuen bere unitatearekin. 26. Armadaren zati gisa, dibisioa eta bere gorputzak gerra hasi zuten Drogobych inguruan. 1941eko ekainaren 25eko mugan gertatu zen batailan, dibisioa kontraerasoan hasi zen.
Brody eta Dubno inguruetan, eta gero, borroka gogorretan, Proskurov eta Vinnytsia aldera erretiratu ziren. Yermolkin maiorra metraila batek zauritu zuen ekainaren 28an Radzivilov-eko borroketan. Abuztuan, Kieveko guduan, 7. dibisio motorizatuaren 300. motorizatutako erregimentuaren komandante izendatu zuten, 26. armadaren barruan, Kieveko hegoaldean borroka gogorretan. Irailean inguratu egin zuten, baina urrian sobietarren lerroetara itzultzea lortu zuen, eta ondoren 169. errifle dibisioko 680 erregimentuaren agintea hartu zuen, Volchansk eskualdean Hego-mendebaldeko Frontearen 38. armadaren barruan borroka gogorretan parte hartu zuena. Abendutik aurrera, armadako 199. Errifle Dibisioko 584. Errifle Erregimentuko komandantea izan zen. 1942ko uztailean, Donbasseko operazio defensiboan, 304. fusil dibisioko komandanteordea izan zen.