2004ko irailean, Basajevek bere gain hartu zuen
Beslaneko eskolako setioan 350 pertsona hil ziren, gehienak haurrak, eta ehunka zauritu. Errusiako gobernuak 300 milioi errublo (10 milioi dolar) sari gisa jarri zituen bere atxiloketari buruzko informazioa emateagatik. Basayevek berak ez zuen ikastetxearen konfiskatzean parte hartu, baina erasoa antolatu eta finantzatzen zuela esan zuen, operazio osoak 8.000 euro bakarrik kostatu zuelako. 2004ko irailaren 17an, Basayevek adierazpen bat egin zuen eskolako setioaren erantzukizuna bere gain hartuz, bere Riyadus-Salihiin "Martir batailoiak" eraso hori eta beste batzuk egin zituela esanez. Bere mezuan, Basayevek Beslaneko sarraskia "tragedia izugarri" gisa deskribatu zuen eta errua Vladimir Putin Errusiako presidenteari egotzi zion.