2015eko urtarrilaren 27an, Suediako txapeldunak, Malmö FF, Yotúnekin hiru urteko kontratua sinatu zuela iragarri zuen. Malmöra ezkerreko atzelari gisa iritsi zen, eta bertan jokatu zuen 2015eko denboraldian. 2016ko denboraldian Behrang Safari eta Pa Konate berriak atzean utzi dituen hirugarren aukera izan ondoren.
, Yotún erdiguneko hainbat posiziotan jokatu zen, non bikain aritu zen. Yotún 2017ko denboraldiko lehenengo zatian jokalari garrantzitsu gisa agertu zen, eta Malmö FFko hileko jokalari izendatu zuten zaleek uztailean.