Ishii erretiratu ondoren, 1999an Kashima Antlers taldeko entrenatzaile egin zen. Entrenatzaile fisikoa izan zen. 2015eko uztailean, Toninho Cerezo entrenatzailea kaleratu zuten eta Ishii bihurtu zen entrenatzaile berria. Klubaren zuzendari japoniarra izan zen lehen aldiz 21 urtean, 1994an Masakatsu Miyamoto izan zenetik (Takashi Sekizuka 1998an eta 1999an izan zen). Urrian, klubak 2015eko J.League Cup txapelketa irabazi zuen. 2016an, klubak J1 Liga irabazi zuen eta 2016ko Munduko Kluben Txapelketarako sailkatu zen.
-Ez da izango. J.League Urteko Zuzendari izendatu zuten. Kluben Munduko Txapelketan, klubak Asiako lehen taldea izan zen Kluben Munduko Txapelketako finala iristeko. Finalean, 90 minuturen ondoren 2x2ko berdinketa egin ondoren, Europako txapeldun Real Madrilen aurka, 4x2ko porrota izan zuten luzapenaren ondoren. Hala ere, klubaren errendimendua txarra da 2017an, 2017ko maiatzean kaleratu zuten.