Itsas Armadak, Sobietar Batasunaren inbasioa hasi zenean, prestakuntza osoa zuen armada sobietarraren atal bakarra izan zen. Ekainaren 19an 2. prestakuntzan jarri zuten, eta ekainaren 21eko gauerdian Kuznetsov almiranteak 1. prestakuntzara eraman zuen. Baltikoko Flotako kabineteburu bezala, Panteleyev-ek flota gerrarako prestatzeko lanetan parte hartu zuen. Abuztuaren amaieran, inbasioan, Tallinneko ebakuazioan parte hartu zuen.
, gerraontzi sobietarren segurtasun talde baten agintea hartu zuen, eta irailaren 1ean garraio flotilla baten, kanoi-ontzi eta beste itsasontzi batzuen agintea hartu zuen Koivistoko 50. errifle-korpusaren zati bat ebakuatzeko. Bere egunerokoan Tallinn-eko agertokia deskribatu zuen: Etsaiak taktikak aldatu ditu. Talde txikietan. Etsaiaren aireko erasoa! Gure hegazkinak ekialdera abiatu ziren. Flota eta hiria bonbardatzen ari dira. Pirita erretzen dago... Beste hiri-auzo batzuk ere supean daude. Sute handiak hirian. Portu ondoko sarreran oztopoak daude. Kea nonahi dago. Itsasontzien eta lehorreko baterien tiroa ez da moteltzen. Minna Harborreko gure basea supean dago.