1988an idatzi zuen bere lehen antivirus programa, lehen ordenagailu birusa agertu eta bi urtera. Negozioan hasi zen bere lagun Eduard Kucerarekin batera 1989an erregimen komunistaren amaieran.
, Alwil sortu zuenean. 1990eko hamarkadaren hasieran, enpresak Avast Software izena hartu zuen, bere produktu ezagunenean oinarrituta, Avast Antivirus. Laster lehiaketa gogorrari aurre egin behar izan zion, batez ere Symantec-en aldetik, prezioen politika agresiboa erabili zuena merkatuan liderra izateko. Erantzun gisa, Baudiš eta Kucerak defentsa estrategia erradikala hartu zuten, bere produktua doan eskainiz. Ondorioz, Avast munduko antibirus enpresa handiena bihurtu zen.