Independentzia gerren ondoren, gatazka batzuek nazioarentzat itsas armadaren garrantzia erakutsi zuten. Konfederazioaren gerra izan zen.
(1836<unk>1839), Chincha uharteetako gerra (1864<unk>1866), eta Ozeano Bareko gerra (1879<unk>1883). Fuerte Bulnesen sorrera Magellan itsasartean, Txileko Itsas Armadaren esplorazio sorta baten abiapuntua izan zen, Francisco Vidal Gormaz eta Francisco Hudson bezalako itsas armadako hidrografoek zuzenduta, Magellan itsasartea eta Chiloé arteko eremu ezezagunetan. Jarduera eremu berri honi aurre egiteko, itsas armadak 1874an Hydrographic Office sortu zuen, bere lehen zuzendaria Francisco Vidal Gormaz izan zena.