Bigarren Koalizioaren Gerraren hasieran, 1799an, Cisalpineko Errepublikako ofiziala zen, Jean Victor Marie Moreau-ren Aide de Camp (ADC) gisa jardun zuena, ondoren Barthélemy Catherine Joubert-ek Ipar Italiako kanpainan. Joubert hil ondoren, Novi-ko batailan...
, Balabiok bere tropekin ihes egin zuen eta André Masséna-ren indarrekin bat egin zuen, 1800eko Genovako setioan ADC gisa nabarmendu zen, eta horregatik koronel izendatu zuten.