Ameriketako Estatu Batuak 1917ko udaberrian Europan gerran sartu ondoren, Magnesek bere arreta osoa bideratu zuen gerraren aurkako kanpaina egitera. Mugimenduaren buruzagi garrantzitsuetako bat bihurtu zen. Bere buruzagi gehienak bezala, langile klasearen aldekoak ziren. Eugene Debs bezalako pertsonak, hamar urteko kartzela zigorra jaso zuena bere jarduerengatik; Norman Thomas; Roger Nash Baldwin; Scott Nearing; Morris Hillquit, New Yorkeko alkate hauteskundeetan botoen % 22 lortu zuena gerraren aurkako plataforma batean; eta Oswald Garrison Villard. Gizon horietako gehienak Amerikako Demokraziaren eta Bakearen aldeko Kontseilu Popularrean parte hartu zuten Magnes izan zenean lehen lehendakaria. 1917ko maiatzaren 30ean, Madison Square Gardensen, hamabost mila lagun biltzen ziren eta hitzaldi nagusia eman zuen.
-Ez da izango. Minneapoliseko bilera debekatu egin zuten eta Chicagon bildu ziren berriz, baina militarren indarrak mehatxatu zituen. Magnes Connecticuteko etxera joan zen bizilagunen aurka egiteagatik eta Justizia Saileko agente batek elkarrizketatu zuen. "Joint"eko bere lankideetako bat, B. D. Bogen, Fiskal Nagusiak Magnesen jarduerari buruz galdetu zion. Magnesek askatasun zibilaren bulego berriarekin lan egin zuen, bakezaleak eta kontzientziazko objezioak defendatzen zituena. Ameriketan, 2.000 auzi baino gehiago jarri ziren gerra-erresistentziaren aurka Kontserbazio Legearen edo Espioitza Legearen arabera; Magnesek epaiketak saihestu zituen, soldadutzara joateko adina gainditu zuelako.