Kapitain izendatu zuten 1805eko martxoan. 1805eko uztailean, 22 kanoiak Mediterraneoan zerbitzatzeko berriz kontratatu zituen, eta 1806ko urrian 36 kanoien agintea hartu zuen. Elliot-ek sei urtez agindu zuen, eta 1807ko otsailaren 15ean Ekialdeko Indietarako eta Txinarako itsasoratu zen. 1808ko urriaren 8an 18 kanoi zituen "Iéna" frantziar korbeta harrapatu zuen Bengalako Golkoan zegoela, eta 1809ko uztailaren 15ean "Modeste" ontziak harrapatu eta 8 kanoi zituen "Tuijneelar" ontzia Sunda itsasartean harrapatu zuen. Orduan, Elliotek parte hartu zuen Javako batailan.
1811ko abuztu eta irailaren artean. 1813an 38 kanoien agintea hartu zuen eta ekainean Borneoko piraten zapalketan parte hartu zuen. Kanpaina horietan egindako ekintzek bere agintarien arreta erakarri zuten, baita McGregor koronelari Palembangeko sultana berreskuratzeko egindako laguntzak ere. Napoleondar Gerren amaierak ez zuen aginpiderik eman, nahiz eta "Victory" HMS-aren agintea lortu zuen, ondoren, 1827ko maiatzaren 1etik 1832ko urtarrilaren 24ra arte Portsmouth-en guardia ontzi gisa zerbitzatu zuen. Garai hartan egindako zerbitzuengatik, Elliot Clarence-ko dukearen, William IV.a errege izango zenaren, laudorioak jaso zituen.