Gertaera horren ostean, Ramiro de León Carpio Guatemalako giza eskubideen defendatzaileak lehendakari kargua hartu zuen, konstituzioaren arabera. Pérez bere presidentearen kabineteburu izendatu zuen, 1995era arte mantendu zuen kargua. Guatemalako Armadaren frakzioaren buruzagi gisa jotzen da, 30 urteko Guatemalako Gerra Zibilaren ebazpen negoziatuaren alde zegoena.
, Pérez militarrak ordezkatzen zituen gerrillariekin izandako negoziazioetan. 1996ko bake akordioak lortu zituzten.