Hurrengo denboraldian, Van Persik hiru urteko eta erdiko kontratua sinatu zuen Feyenoordekin, eta bost gol sartu zituen 2003ko otsailaren 6an AGOVV Apeldoorn-en aurkako KNVB Cup-eko partida batean. Hala ere, Bert van Marwijk bere managerrarekin izandako liskarrengatik, Van Persie erreserbako taldera jaitsi zuten. Feyenoord eta Ajax erreserben arteko partidan, Feyenoordeko hainbat jokalarietako bat izan zen eraso egin ziotena zelaira sartu ziren hooliganak. Van Persie-ren eta Van Marwijk-en arteko desadostasunak
2002ko UEFA Super Cup finala Realakiko, entrenatzailea Van Persiren gorputz hizkuntzarekin atsekabetuta zegoelako, Txapeldunen Ligako kanporaketa baterako berotzeko eskatu ondoren. Van Persik bere lehen denboraldi osoa amaitu zuen lehen taldearekin, zortzi gol sartu zituelarik, guztira 28 partidatan, KNVB Kopako bigarren postua lortuz.