Ligak ahuldu egin zuen urteetan zehar gatazka politikoen barne desadostasunak, batez ere Israel eta palestinarrei buruzkoak eta geroago Golkoko hiru gerrak. 1979ko martxoaren 26an Egiptok Israelekin bake itun berezi bat sinatu ondoren, Arabako Ligako beste kide batzuk Bagdaden bildu ziren eta Egiptoko kide izatea bertan behera uztea eta Ligako egoitza Kairretik Tunisera aldatzea bozkatu zuten. 1989ko maiatzean, bederatzi urte geroago, Egiptori onarpen berria eman zitzaion eta kide izateari ekin zion. Egoitza Kairora itzuli zen 1990ean. Urrats hau oso eztabaidagarria izan zen, Ligan kideak Kuwaiteko krisiaren inguruan oso banatuta zeudelako.
eta Arabia Sauditaren gonbidapenaz Estatu Batuetara, zeinak ahalbidetu baitzuen atzerriko indar militarra ekialdeko probintzietan ezartzea. Golkoko krisiaren agerraldiaren ondorioz, Liga funtsean paralizatu zen, eta eskualdeko erakunde gisa duen etorkizuna oso zalantzazkoa bihurtu zen.