1862ko ekainaren 1ean, armadako brigada bati eraso zenionean,
Fair Oaks-en, Howard bi aldiz zauritu zuten eskuineko besoan, eta anputatu zioten. (Ohorezko domina jaso zuen 1893an Fair Oaks-en egindako heroismoagatik.) Philip Kearny brigada jenerala, ezkerreko besoa galdu zuena, Howard bisitatu zuen eta txantxetan esan zuen eskularruak elkarrekin erosiko zituztela. Howard nahikoa azkar sendatu zen Antietamko guduan armadan berriro sartzeko, eta II. Korpusean dibisioaren agintea hartu zuen. 1862ko azaroan generala izendatu zuten eta hurrengo apirilean XI Korpusuaren agintea hartu zuen, Franz Sigel jeneral nagusia ordezkatuz. Soldadu gehienak aleman etorkinak zirenez, eta haietako askok ez zekiten ingelesez, soldaduak haserre zeuden beren buruzagi berriarekin eta argi eta garbi eskatu zuten Sigel berrezartzea.