Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Op 16 September 2008 het Puyol sy 400ste verskyning vir Barcelona gemaak in 'n Champions League-groepfasewedstryd teen Sporting CP. In die liga seisoen, ten spyte van beseringsprobleme, het hy in 28 wedstryde verskyn en hulle gehelp om nog 'n liga-titel te wen. Sy enigste doel was teen Real Madrid in "El Clásico" by die Santiago Bernabéu op 2 Mei 2009 wat geëindig het met 'n geweldige 6<unk>2 oorwinning, en hy het sy doel gevier deur sy Katalaanse vlag-armband voor die woedende Madrid-aanhangers te soen. Hy was noodsaaklik vir die span wat ook die 2009 Copa del Rey, die 2009 Champions League, die 2009 UEFA Superbeker gewen het.
en die 2009 FIFA-wêreldkampioenskap vir klubs om 'n ongekende sesvoudige te voltooi, wat in byna 100 amptelike wedstryde verskyn.