Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - In 1991 was Barghouti 'n afgevaardigde by die Madrid-konferensie
, wat gehou is met die doel om die Israeliese-Palestynse konflik en die Eerste Intifada te beëindig. In 1996 het hy sonder sukses as kandidaat vir 'n wetgewende setel in die eerste Palestynse Owerheid verkiesings. In 2002 het Barghouti die Palestynse Volksparty verlaat. In Junie 2002 het Barghouti, Haidar Abdel-Shafi, Ibrahim Dakkak en Edward Said die Palestynse Nasionale Inisiatief ("al-Mubadara al-Wataniyya al-Filistiniyya") gestig, 'n poging om 'n reformistiese, inklusiewe alternatief vir beide die gevestigde Palestynse Bevrydingsorganisasie en Islamitiese militante groepe soos Hamas te bou. Barghouti dien tans as die inisiatief se sekretaris-generaal.