Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Hy het na Hongkong gereis en op 7 Desember 1899 daar aan 'n hartaanval gesterf. Sy oorskot is in Hong Kong begrawe en in 1920 is uitgegrawe en in Andrés Luna se huis gehou, om later na 'n nis by die Crypt of San Agustin Church in die Filippyne oorgeplaas te word. Vyf jaar later sou Juan herstel word as 'n wêreldbekende kunstenaar en "Peuple et Rois", sy laaste groot werk, is geprys as die beste inskrywing op die Saint Louis Wêreldtentoonstelling
in St. Louis, Missouri. Sommige van sy skilderye is in die Tweede Wêreldoorlog deur vuur vernietig.