Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Bonucci het die seisoen begin deur die 2012 Supercoppa Italiana te wen
met Juventus. Hy het sy Champions League-debuut teen Chelsea in die groepsfase gemaak en sy eerste doel in die kompetisie teen Shaktar Donetsk in Oktober 2012 in 'n 1<unk>1 trekking aangeteken. In Desember 2012 is Bonucci gekritiseer vir 'n duik in 'n ligawedstryd teen Palermo wat deur 'n aantal joernaliste beskryf is as "die slegste duik ooit". Hy is deur die skeidsregter tydens die wedstryd geboek en daarna 'n eenwedstrydverbod en 'n boete van € 2000 deur die owerhede gegee. Juventus het die seisoen voltooi deur die 2012-13 Serie A-titel te wen.