La streptomicina è stata isolata per la prima volta il 19 ottobre 1943 da Albert Schatz, uno studente di dottorato nel laboratorio di Selman Abraham Waksman presso la Rutgers University in un progetto di ricerca finanziato da Merck and Co. Waksman e il suo personale di laboratorio hanno scoperto diversi antibiotici, tra cui l'actinomicina, la clavacina, la streptomicina, la streptomicina, la griseina, la neomicina, la fradicina, la candicidina e la candidina. Di questi, la streptomicina e la neomicina hanno trovato ampie applicazioni nel trattamento di numerose malattie infettive.
Nel 1943