Due ricercatori, Chris Bennett (1996) e David Peters (2000), hanno scoperto che i pterosauri erano protorosauri o strettamente correlati a loro. Peters ha utilizzato una tecnica chiamata DGS, che prevede l'applicazione delle caratteristiche di tracciamento digitale del software di fotoediting alle immagini di fossili di pterosauri. Bennett ha recuperato i pterosauri come parenti stretti dei protorosauri solo dopo aver rimosso le caratteristiche dell'arto posteriore dalla sua analisi, nel tentativo di testare l'idea che questi caratteri sono il risultato di un'evoluzione convergente tra pterosauri e dinosauri. Tuttavia, analisi successive di Dave Hone e Michael Benton (2007) non sono riuscite a riprodurre questo risultato. Hone e Benton hanno trovato che i pterosauri erano strettamente correlati ai dinosauri anche senza gli arti posteriori. Hanno anche criticato studi precedenti di David, sollevando domande sul fatto che le caratteristiche di tracciamento digitale del software di fotoediting siano state applicate alle immagini di fossili di pterosauri.
gruppo gemello di Scleromochlus o che si colloca tra esso e Lagosuchus sull'albero genealogico degli ornitodiri