Queste caratteristiche contrastano anche con l'EBRT, in cui i raggi X ad alta energia (o occasionalmente i raggi gamma di un radioisotopo come il cobalto-60) sono diretti verso il tumore dall'esterno del corpo. La brachiterapia comporta invece il posizionamento preciso di fonti di radiazione a corto raggio (radioisotopi, come l'iodio-125 per esempio) direttamente sul sito del tumore. Questi sono racchiusi in una capsula o un filo protettivo, che consente alla radiazione ionizzante di sfuggire e di uccidere i tessuti circostanti, ma impedisce ai pazienti di muoversi all'interno di ogni tessuto circostante che richiede distruzione.
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