La città rimase sotto il controllo rumeno fino al 28 giugno 1940, quando fu occupata insieme alla Bessarabia e alla Bucovina settentrionale.
dall'Unione Sovietica. Nell'agosto 1940, i sovietici crearono l'Oblast di Chernivtsi e vi includettero l'area intorno a Khotyn, che divenne parte della Repubblica socialista sovietica ucraina, non della Repubblica socialista sovietica moldava, come il resto della Bessarabia. Dopo l'operazione Barbarossa, in cui la Romania ha agito come alleata della Germania, l'area è stata riconquistata dalla Romania all'inizio di luglio 1941. Nel marzo 1944, con la sconfitta delle forze dell'Asse, la città fu riconquistata dai sovietici e riattaccata all'Ucraina sovietica.