Scrivi una continuazione per questo paragrafo - L'ufficiale al comando più longevo del No. 3 Squadron durante la guerra fu il capo squadrone Bobby Gibbes, il cui tour durò da febbraio 1942 ad aprile 1943. Gibbes fu sostituito dal capo squadrone Brian Eaton, che guidò l'unità fino a febbraio 1944. Durante questo periodo, il No. 3 Squadron ha preso parte alle invasioni alleate della Sicilia
e l'Italia. Fu riequipaggiato con P-51 Mustang nel novembre 1944 e continuò ad operare in Italia e Jugoslavia fino alla fine della guerra europea nel maggio 1945. Il record del No. 3 Squadron di 25.663 ore di volo operativo e 217,5 aerei nemici distrutti lo ha reso il più alto squadrone di caccia della RAAF.