Completa la seguente frase: Facendo un'alleanza politica con l'imperatrice vedova, e diventando un nemico duraturo dell'imperatore Guangxu, Yuan lasciò la capitale nel 1899 per la sua nuova nomina come governatore dello Shandong. Durante il suo mandato di tre anni scoppiò la ribellione dei Boxer (1899-1901); Yuan assicurò la soppressione dei Boxer nella provincia, anche se le sue truppe non presero parte attiva al di fuori dello stesso Shandong. Yuan prese le parti della fazione pro-straniera nella Corte Imperiale, insieme al principe Qing, Li Hongzhang e Ronglu. Si rifiutò di schierarsi con i Boxer e attaccare le forze dell'Alleanza delle otto nazioni, unendosi ad altri governatori cinesi che comandavano eserciti modernizzati sostanziali come Zhang Zhidong che non partecipavano alla ribellione dei Boxer. Lui e Zhang ignorarono la dichiarazione di guerra dell'imperatrice vedova Cixi contro le potenze straniere e continuarono a sopprimere i Boxer. Questa cricca era conosciuta come la Protezione Mutua del Sud-Est della Cina. Oltre a non combattere l'Alleanza delle Otto Nazioni e a sopprimere i Boxer nello Shandong, Yuan e il suo esercito (la Divisione di destra) aiutarono anche l'Alleanza delle Otto Nazioni a sopprimere i Boxer dopo
L'Alleanza catturò Pechino nell'agosto del 1900. Le forze di Yuan Shikai hanno massacrato decine di migliaia di persone nella loro campagna anti-Boxer a Zhili. Yuan operò da Baoding durante la campagna, che si concluse nel 1902.