Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Murray era inizialmente un sostenitore delle politiche robuste di Lord Lauderdale, prendendo parte a un raid del 1678 contro i Covenanti, ma poi perse temporaneamente il favore reale consigliando la moderazione riguardo alle misure prese contro di loro. Nel 1679, tuttavia, fu presente alla battaglia di Bothwell Bridge
; nel luglio 1680 fu nominato viceammiraglio di Scozia e nel 1681 presidente del parlamento.