Pacino ha avuto una relazione con Diane Keaton, la sua co-protagonista nei tre film del Padrino, che si è conclusa dopo le riprese di The Godfather Part II. Ha avuto relazioni con Tuesday Weld, Jill Clayburgh, Marthe Keller, Kathleen Quinlan e Lyndall Hobbs.Pacino ha avuto una relazione di dieci anni con l'attrice argentina Polak dal 2008 al 2018.
Non si è mai sposato.