Durante la produzione, DuVernay ha chiesto a McBride di essere il più flessibile possibile sulle sequenze di effetti visivi per consentirle di apportare modifiche e incorporare nuove idee durante le riprese. Il regista ha deciso di inserire "un certo sito web di Stephen King" e una "colorata scena post-credits" in esso. Le riprese di A Wrinkle in Time si sono svolte in più luoghi tra cui Eureka, California, nella contea di Humboldt, a partire dal 29 novembre 2016. Le riprese si sono svolte anche al Sequoia's Park, vicino allo Sequoia Zoo.
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