Completate la seguente frase: Il 9 febbraio 1995, Desjardins fu scambiato con i Philadelphia Flyers insieme a John LeClair e Gilbert Dionne in cambio di Mark Recchi e una scelta del 3° round nel
1995 NHL Entry Draft (Martin Hohenberger). Venne portato per solidificare la difesa dei Flyers e lo fece vincendo il primo dei sette Barry Ashbee Trophies, un premio assegnato annualmente al miglior giocatore dei Flyers. Ha giocato il resto della sua carriera con i Flyers, ottenendo due selezioni all'All-Star della seconda squadra della NHL (1999, 2000) e altre due apparizioni all'All-Star Game (1996, 2000). I suoi 396 punti con i Flyers sono al secondo posto tra i difensori, solo dietro ai 480 di Mark Howe nella storia della squadra. Durante la stagione 1999-2000, Desjardins divenne il capitano dei Flyers dopo che Eric Lindros fu privato della capitaneria per le sue lamentele sul personale medico dei Flyers.