Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Cowdin era colonnello del 2° Reggimento di Milizia del Massachusetts all'inizio della guerra, e fu nominato colonnello del 1° Reggimento di Fanteria del Massachusetts il 25 maggio 1861. Guidò il suo reggimento nella battaglia di Blackburn's Ford il 18 luglio 1861, faceva parte della brigata di Israel B. Richardson della divisione di Daniel Tyler nella prima battaglia di Bull Run, dove il suo cavallo fu ucciso. Ha anche combattuto a Williamsburg, Fair Oaks,
Glendale, Malvern Hill e Chantilly.