Completate la seguente frase: Nel 1798, Jourdan lo nominò capo di stato maggiore dell'esercito di osservazione. Ernouf era con l'Esercito di Osservazione quando attraversò il fiume Reno, in quella che gli storici britannici hanno definito una violazione del Trattato di Campo Formio, che portò alla Guerra della Seconda Coalizione. Il 2 marzo, l'esercito fu ribattezzato Esercito del Danubio, e marciò verso l'Alta Svevia, dove si scontrava con la forza asburgca dell'arciduca Carlo ad Ostrach il 21 marzo, e di nuovo il 25 marzo a Stockach. In entrambe le battaglie, la manodopera asburgica, superiore ai numeri francesi rispettivamente di tre a uno e due a uno, travolse le linee francesi; Jourdan, il comandante dell'esercito, non fu in grado di concentrare le sue forze sufficientemente per contrastare i numeri asburgici e si ritirò nella Foresta Nera alla fine di marzo. Ernouf prese il comando dell'esercito del Danubio mentre Jourdan tornò a Parigi per richiedere più truppe. Fu sostituito come comandante dell'esercito del Danubio da André Masséna, e servì come capo di stato maggiore di Massena nella campagna svizzera del 1799, durante la quale vide l'azione a Zurigo e nella Svizzera centrale; fu nuovamente a
Zurigo per la vittoria francese su Alexander Rimsky-Korsakov.