Completare la frase seguente: Alpha è stata attiva durante la seconda guerra cecena iniziata nel 1999, nonché durante la successiva
Insurrezione nel Caucaso settentrionale. Durante la battaglia di Komsomolskoye del 2000, i cecchini Alfa assegnati al gruppo occidentale di Vladimir Shamanov delle forze federali, furono schierati nel tentativo di sopprimere i cecchini di Ruslan Gelayev nel villaggio. Secondo i veterani dell'unità, le operazioni a cui Alpha ha preso parte hanno portato all'arresto del comandante ceceno Salman Raduyev nel 2000, all'uccisione del comandante ceceno Arbi Barayev nel 2001, all'uccisione del presidente separatista ceceno Aslan Maskhadov nel 2005 e all'uccisione del leader militante straniero Abu Hafs nel Daghestan nel 2006. Dopo il trasferimento della responsabilità delle operazioni in Cecenia dal Ministero della Difesa all'FSB nel gennaio 2001 e prima della politica di "cecenizzazione" iniziata nel 2003, i membri di Alpha (insieme all'altro personale russo e alle milizie cecene filo-moscovite) hanno partecipato ad almeno 10 "gruppi speciali combinati" misti (SSG), considerati squadroni della morte da gruppi per i diritti umani e osservatori esterni. Si ritiene che gli SSG siano stati responsabili di molte delle numerose "purificazioni di nomi/indirizzi" ("imeny/adressny zachistki"): solitamente incursioni notturne di uomini mascherati in veicoli non contrassegnati, che hanno come bersaglio specifici combattenti ribelli attivi o ex, i loro sostenitori, i loro parenti o altri civili per sparizioni forzate o uccisioni stragiudiziali. Nel 2005, Human Rights Watch ha dichiarato che le sparizioni avevano raggiunto la scala di un crimine contro l'umanità, e che "la Russia ha la sfacciata distinzione di essere il leader mondiale nelle sparizioni forzate". L'UFSB cecena ha anche formato un'unità locale Alpha, che si ritiene sia simile nel suo ruolo agli SSG.