Prima della stagione 2013, i Diamondbacks e Goldschmidt hanno concordato un contratto da 32 milioni di dollari che copre le stagioni 2014-2018 con un'opzione per la stagione 2019 del valore di 14,5 milioni di dollari. Non sarebbe stato ammissibile all'arbitrato salariale fino alla stagione 2014/15 e alla free agency fino alla stagione 2017/18. Goldschmidt è stato selezionato nella squadra della National League nel 2013 Major League Baseball All-Star Game
- No, no. Goldschmidt ha raddoppiato con due out nel nono inning, uno dei soli tre colpi per la National League, e l'unico colpo extra-base. Il 13 agosto, ha colpito un fuoricampo contro i Baltimore Orioles nella parte bassa del nono inning per inviare la partita in extra innings. Goldschmidt poi ha colpito un walk-off home run nella parte inferiore dell'undicesimo. Goldschmidt ha colpito un terzo Grand Slam il 20 agosto 2013, contro J. J. Hoover dei Cincinnati Reds. In 160 partite in quella stagione, raggiunse una media di battuta di.302, 36 fuoricampo e 125 RBI. Goldschmidt è arrivato secondo nella votazione per il Most Valuable Player Award della National League, dietro all'outfielder dei Pittsburgh Pirates Andrew McCutchen. Ha guidato la MLB con quattro walk-off nel 2013.