Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Nel 1940, come conseguenza del Patto Molotov-Ribbentrop, la Romania fu costretta a cedere
parte del suo territorio all'Unione Sovietica, compresa Chișinău, dove è stata costituita la RSS di Moldavia. Le nuove autorità chiusero l'istituto di Kotsovsky. L'istituto fu riaperto quando, dopo lo scoppio della seconda guerra mondiale, Chișinău fu presa dalle forze dell'Asse. Kotsovsky continuò il suo attivo lavoro scientifico durante la seconda guerra mondiale. In questo periodo, ha pubblicato il suo lavoro principalmente in riviste scientifiche tedesche e austriache.