Dopo l'invasione nazista del 1941, la Società Filarmonica cessò le sue attività e la maggior parte dei suoi preziosi archivi fu distrutta. Durante l'occupazione tedesca di Kiev, l'edificio della Società fu trasformato in un "Club degli Ufficiali Tedeschi". Questo è stato uno dei motivi importanti per cui l'edificio non è stato distrutto, rimanendo uno dei pochissimi edifici sopravvissuti di pre-guerra sulla strada Khreshchatyk. Dopo la liberazione di Kiev
, l'edificio della Società Filarmonica riprese le sue operazioni nel 1944 non appena le ostilità si allontanarono da Kiev.