Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Gli interessi di ricerca di Tauxe includono le malattie intestinali batteriche, l'epidemiologia e la patogenesi delle malattie infettive, le conseguenze epidemiologiche e cliniche dello scambio genetico batterico, l'uso di antimicrobici e la resistenza agli agenti antimicrobici e l'insegnamento dei metodi epidemiologici. Ha partecipato o supervisionato numerose indagini epidemiologiche nazionali ed estere in tutto il mondo, in particolare l'attacco bioterroristico del 1984 a Rajneeshee.
, l'epidemia di salmonellosi negli Stati Uniti nel 2008, l'epidemia di colera ad Haiti nel 2010-2013, la creazione di Pulsenet e l'epidemia di virus Ebola in Africa occidentale.