Kanouté ha giocato per la squadra nazionale under 18 del Mali al Campionato africano FIBA Under 18 di Bamako nel 2018. Ha ottenuto una media di 14,3 punti, 5,4 assist e 4,4 rimbalzi per partita, portando la sua squadra alla sua prima medaglia d'oro al torneo. Kanouté ha segnato 10 punti, sei rimbalzi e cinque assist contro il Senegal nelle finali ed è stato nominato MVP del torneo. In seguito ha partecipato alla FIBA Under-19 World Cup 2019
a Heraklion, in Grecia. In sette partite, Kanouté ha avuto una media di 15,4 punti, 5,1 assist e 2,4 rubati per partita, aiutando il Mali a conquistare un'improbabile medaglia d'argento, la migliore prestazione di una squadra africana al torneo. È stato nominato All-Star Five con il compagno di squadra Oumar Ballo.