Non molto tempo dopo che Ken Holland ricevette la proroga del suo contratto, Craig Leipold, proprietario dei Minnesota Wild, e Jeffrey Vinik, il nuovo proprietario dei Tampa Bay Lightning, cercarono di assumere Yzerman come direttore generale. Dopo aver rifiutato il lavoro nel Minnesota prima della conclusione della stagione 2009-10, Yzerman accettò il lavoro del Lightning e fu nominato nuovo vicepresidente e direttore generale della squadra il 25 maggio 2010. Durante l'off-season, e all'inizio del suo nuovo regno, ha ri-firmato con Martin St. Louis, ha firmato il difensore Pavel Kubina per il suo secondo mandato con la squadra, ha firmato il portiere free agent Dan Ellis per un contratto di due anni, ha firmato il difensore Brett Clark e ha portato l'ala sinistra Simon Gagné in uno scambio che ha visto Matt Walker e una scelta del quarto turno nel 2011
partono da Tampa Bay. A metà stagione, ha anche scambiato per il portiere Dwayne Roloson mentre i Lightning sono andati alle finali della Eastern Conference solo un anno dopo che la squadra non si era nemmeno qualificata per i playoff del 2010. Da parte sua, Yzerman è stato nominato per il premio NHL General Manager of the Year Award, perdendo contro Mike Gillis di Vancouver.