Successivamente, ha affermato l'acquisto di voti e altre irregolarità, e ha chiesto un completo riconteggio da parte dell'Istituto Elettorale Federale (IFE). L'IFE ha trovato alcune irregolarità, ma ha confermato i risultati il 6 luglio. López Obrador ha respinto questo annuncio, e il 12 luglio ha presentato una denuncia per l'invalidazione delle elezioni. Ha accusato di acquisto di voti, di spesa in eccesso dei regolamenti elettorali, di raccolta di fondi illegali e di frode elettorale. Ma il 30 agosto, il Tribunale Elettorale della Magistratura Federale ha respinto la sua denuncia.
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