Oltre all'impatto negativo sul gioco individuale di Bertuzzi, i media hanno ipotizzato che le conseguenze dell'incidente Moore fossero diventate una distrazione per l'organizzazione nel suo complesso. A complicare la situazione a Vancouver, i Canucks avevano perso i playoff per la prima volta in quattro anni. Come tale, il general manager Dave Nonis ha trascorso la bassa stagione facendo cambiamenti significativi alla formazione dei Canucks. Il 23 giugno 2006, ha scambiato Bertuzzi con i Florida Panthers, insieme al portiere Alex Auld e al difensore Bryan Allen, in cambio del portiere Roberto Luongo, del difensore Lukáš Krajíček e di una selezione del sesto turno nel Draft NHL 2006
(Sergei Shirokov). Dopo sette stagioni e mezza con i Canucks, Bertuzzi lasciò il club al settimo posto in assoluto tra i leader della franchigia con 449 punti.