Il 18 gennaio 2016 è stato annunciato che Safari sarebbe tornato al Malmö FF quando il suo contratto con il FC Basilea sarebbe scaduto alla fine della stagione 2015/16. Safari ha firmato un contratto con Malmö che si estende per la stagione 2020 e gli consente di unirsi alla squadra a metà della stagione 2016.
- No, no. Ha segnato un gol in Allsvenskan l'11 aprile 2017 contro GIF Sundsvall ed è stato nominato vice-capitano dopo Markus Rosenberg. Ha vinto il suo decimo titolo di campionato dopo aver vinto l'Allsvenskan 2017, rendendo Zlatan Ibrahimović l'unico svedese con più titoli di campionato. Safari è diventato un titolare regolare per il MFF quando si è qualificato per la UEFA Europa League 2018-19 il 30 agosto 2018. Il 28 settembre 2020, Safari ha annunciato che si ritirerebbe dal calcio professionistico dopo la stagione 2020. L'8 novembre 2020, Safari e Malmö hanno vinto l'Allsvenskan 2020. Safari ha giocato la sua ultima partita professionale il 6 dicembre 2020 in una vittoria per 4 a 0 contro Östersund, alzando il Lennart Johansson Trophy e ricevendo un omaggio da Walter Samuel e Roger Federer.