O'Malley è stato nominato vescovo coadiutore della diocesi di Saint Thomas il 30 maggio 1984 da Papa Giovanni Paolo II. Ha ricevuto la sua consacrazione episcopale il 2 agosto successivo dal vescovo Edward John Harper, con l'arcivescovo James Hickey e il vescovo Eugene Marino che fungono da co-consacratori. Domanda: Qual è il rango di James Hickey nella chiesa?
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