Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Khan ha chiesto pubblicamente una scusa pakistana al popolo del Bangladesh per le atrocità commesse nel 1971
, ha definito l'operazione del 1971 un "errore" e l'ha paragonata al trattamento odierno dei Pashtun nella guerra al terrorismo. Tuttavia, ha ripetutamente criticato i processi per crimini di guerra in Bangladesh a favore dei condannati. Khan è spesso deriso come "Taliban Khan" a causa della sua posizione pacifista riguardo alla guerra nel nord-ovest del Pakistan. Egli crede nei negoziati con i talebani e nel ritiro dell'esercito pakistano dalle aree tribali sotto amministrazione federale (FATA). È contrario agli attacchi dei droni statunitensi e intende disimpegnare il Pakistan dalla guerra contro il terrorismo guidata dagli Stati Uniti. Khan si oppone anche a quasi tutte le operazioni militari, incluso l'assedio di Lal Masjid.