A Caltech ha stretto una stretta amicizia con Linus Pauling, e hanno pianificato di montare un attacco congiunto sulla natura del legame chimico, un campo in cui Pauling era un pioniere, con Oppenheimer che forniva la matematica e Paul che interpretava i risultati. Sia la collaborazione che la loro amicizia sono state tagliate nel budino quando Oppenheimer ha iniziato a sospettare che Oppenheimer fosse diventato troppo vicino a sua moglie, Helen Paul. Nonostante la moglie Ava Bridgman, una volta che Paul stava lavorando a Harvard, Oppenheimer era arrivato a Harvard, così è stato raggiunto un compromesso per cui ha diviso la sua borsa di studio per l'anno accademico 1927-1928 tra Harvard nel 1927 e Caltech nel 1928.
Istituto Tecnologico della California