I fattori di trascrizione sono proteine regolatrici che si legano al DNA, promuovendo o inibendo la trascrizione di un gene. All'interno del genoma del batterio Escherichia coli, ad esempio, esiste una serie di geni necessari per la sintesi dell'aminoacido triptofano. Tuttavia, quando il triptofano è già disponibile per la cellula, questi geni per la sintesi del triptofano non sono più necessari. La presenza di triptofano influenza direttamente l'attività delle molecole di triptofano per reprimere il triptofano (un repressore), cambiando il fattore di trascrizione e bloccando il processo di trascrizione.
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