Nel febbraio 1567, la residenza di Darnley fu distrutta da un'esplosione e fu trovato ucciso nel giardino. James Hepburn, 4 ° conte di Bothwell, era generalmente ritenuto di aver orchestrato la morte di Darnley, ma fu assolto dall'accusa nell'aprile 1567, e il mese successivo sposò Mary. In seguito a una rivolta contro la coppia, Mary fu imprigionata nel castello di Loch Leven. Il 24 luglio 1567, fu costretta ad abdicare in favore di suo figlio di un anno. Dopo un fallito tentativo di riconquistare il trono, fuggì verso sud cercando la protezione della sua prima cugina una volta rimossa, la regina Elisabetta I d'Inghilterra.
- Mary.