Completa la seguente frase: Per il 1997-1998 ha avuto un posto in Formula Uno con la nuova squadra Stewart Grand Prix, di proprietà in parte del suo vecchio capo della F3, Paul Stewart. Il fondatore del team Jackie Stewart lo descrisse una volta come "il più talentuoso giovane pilota che sia emerso da Ayrton Senna", ma le sue prestazioni erano deludenti. Ha segnato il suo unico punto nel campionato nella sua ultima gara in F1,
Gran Premio del Canada del 1998; per il resto della stagione è stato sostituito da Jos Verstappen. Magnussen ha iniziato 24 GP, una in meno di quella in cui è entrato, perché la sua auto è stata danneggiata in un incidente durante la partenza del Gran Premio del Brasile del 1997 che lo ha costretto a ritirarsi prima della ripresa.