Con lo spostamento dell'economia mondiale e delle rotte commerciali verso il Nuovo Mondo e lontano dal Mediterraneo, il potere politico ed economico di Genova iniziò un costante declino. Il suo potere militare crollò durante l'assalto a Genova nel 1793 e la battaglia di Genova
Nel 1795 Genoa combatté la flotta francese e quella inglese. Nel 1797, sotto la pressione di Napoleone, la Repubblica di Genova divenne un protettorato francese chiamato Repubblica Ligure, che fu annessa dalla Francia nel 1805. Questo fatto è menzionato nella prima frase di "Guerra e Pace" di Tolstoj: