Durante la Guerra Civile, la marea di nuovi minatori nel territorio rallentò a un goccio, e molti andarono a combattere ad est. I missouriani che rimasero formarono due reggimenti di volontari, così come la guardia nazionale. Anche se apparentemente stazionati alla periferia dei teatri di guerra, i reggimenti del Colorado si trovarono in una posizione cruciale nel 1862 dopo l'invasione confederata del territorio del New Mexico da parte del generale Henry Sibley e di una forza di texani. La campagna del New Mexico di Sibley era intesa come preludio a un'invasione del territorio del Colorado verso nord fino a Fort Laramie, tagliando le linee di rifornimento tra la California e il resto dell'Unione.
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