Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Dopo il suo ritorno negli Stati Uniti a metà del 1942, Wilkes frequentò il Naval War College, poi divenne ufficiale comandante del nuovo incrociatore leggero, portandolo nel Mar Mediterraneo per partecipare all'invasione della Sicilia nel luglio 1943. Dall'agosto 1943 il contrammiraglio Wilkes ebbe il comando delle forze anfibie in Inghilterra e Francia, giocando un ruolo importante nei preparativi per l'invasione della Normandia nel giugno 1944 e l'invasione della Francia meridionale.
due mesi dopo. Mentre l'offensiva terrestre alleata si spostava in Germania, Wilkes era responsabile dei porti e delle basi statunitensi in Francia, aiutando materialmente l'offensiva con la sua gestione della logistica.