Il 29 giugno 2015 Kári è tornato nel suo paese di nascita, firmando un contratto di due anni e mezzo con la Malmö FF. La Malmö FF ha venduto i suoi due difensori centrali nella stessa finestra di trasferimento, e ha formato una nuova coppia di difensori centrali con Rasmus Bengtsson. La squadra ha continuato a lottare nella loro campagna di campionato, ma si è qualificata per la fase a gironi della UEFA Champions League 2015-16. In una squadra con molti giocatori appena firmati, Kári era rapidamente diventato un leader ed è stato nominato vice-capitano da Åge Hareide. La squadra è stata in grado di tornare alle sue vittorie durante la stagione 2016
- No, no. Con il capitano Markus Rosenberg infortunato, Kári ha indossato la fascia durante l'ultima corsa al titolo e ha guidato la squadra a garantire il titolo Allsvenskan con due partite da giocare.