Durante la Guerra Civile, il porto fu la base principale per i confederati e i corsari di blocco di proprietà privata, che consegnavano forniture tanto necessarie dall'Inghilterra. L'Unione impose un blocco per ridurre i beni ricevuti dal Sud. La città fu catturata dalle forze dell'Unione nella battaglia di Wilmington nel febbraio del 1865, circa un mese dopo la caduta di Fort Fisher.
aveva chiuso il porto. Poiché quasi tutte le azioni militari si sono svolte a una certa distanza dalla città, numerose case antebelliche e altri edifici sono sopravvissuti agli anni di guerra.