Scrivi una continuazione per questo paragrafo - La fine della guerra civile nella primavera del 1865 diede un grande impulso ai Feniani, a causa del numero di soldati irlandesi-americani che erano stati sciolti e ansiosi di vedere il servizio altrove. Il denaro è stato versato nell'escaffo feniano; probabilmente $ 500.000 sono stati sottoscritti tra il 1860 e il 1867. Si verificarono molte differenze tra O'Mahony e James Stephens e il Consiglio centrale in relazione alla politica da perseguire per il raggiungimento del loro obiettivo, ma O'Mahony rimase presidente dell'organizzazione per diversi anni. Non ha preso parte personalmente al tentativo di insurrezione in Irlanda o alle incursioni in Canada.
, sebbene i suoi consigli contassero molto in queste imprese.