Nel 1968, Hayden si unì al Comitato Nazionale di Mobilitazione per porre fine alla guerra in Vietnam ("The Mob"), e giocò un ruolo importante nelle proteste fuori dalla Convenzione Nazionale Democratica
a Chicago, nell'Illinois. Le dimostrazioni furono disperse da quella che la Commissione nazionale statunitense sulle cause e la prevenzione della violenza descrisse in seguito come una rivolta della polizia. Sei mesi dopo il congresso, lui e altri sette manifestanti, tra cui Rennie Davis,