Quando il tenente governatore Thomas W. Wallace morì il 17 luglio 1943, Hanley divenne nuovamente tenente governatore ad interim. Nelle elezioni dello stato di New York del 1943, sconfisse il democratico William N. Haskell in un'elezione speciale per il vice governatore. Fu rieletto nel 1946 e rimase in carica fino alla fine del 1950. Fu delegato alla Convenzione Nazionale Repubblicana del 1944 e del 1948
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