Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Ali Shkupi non fu attivo durante la seconda guerra mondiale, anche se era un oppositore dell'invasione italiana
, così come quello tedesco. I nazisti avrebbero bruciato la sua casa a Tirana. Dopo la guerra, si trasferì a Shkodër. Morì il 3 dicembre 1953 e fu sepolto a Shkoder. E' stato reinterrato a Tirana negli anni '80. Nel 1992, Ali Shefqet Shkupi è stato decorato per "Attività patriottica di prima classe" dal governo albanese.