Anson supervisionò la Marina per gran parte della Guerra dei Sette Anni, e stabilì un squadrone permanente a Devonport che poteva pattugliare gli approcci occidentali sia alla Gran Bretagna che alla Francia. Era particolarmente preoccupato per la prospettiva di un'invasione francese delle isole britanniche che lo ha portato a mantenere una grande forza nel Canale della Manica. Nel 1756 fu criticato per non aver inviato abbastanza navi con l'ammiraglio Byng per alleviare Minorca.
perché voleva proteggere la Gran Bretagna da una minacciosa invasione, solo per vedere Byng non riuscire a salvare Minorca mentre nessun tentativo di invasione si materializzò. Lasciò l'Ammiragliato quando il ministero di Newcastle cadde nel novembre 1756 e poi servì di nuovo come primo lord quando il ministero di Pitt-Newcastle fu creato nel giugno 1757.