Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Poco dopo l'invasione italiana dell'Albania
nell'aprile del 1939, Krasniqi fu arrestato e internato per un breve periodo nel campo di "Porto Palermo" a causa delle sue opinioni nazionaliste. Al suo ritorno in Albania, fu inviato in Kosovo (all'epoca parte del Regno albanese) e nominato direttore della prima scuola di lingua albanese (nuovamente istituita) a Prishtina. Lì divenne amico di Xhafer Deva e Rexhep Mitrovica. Krasniqi divenne parte della leadership della Seconda Lega di Prizren. Continuò ulteriormente in politica, diventando membro del Parlamento albanese nel 1943. In seguito è stato nominato ministro dell'Istruzione nel gabinetto di Fiqri Dine, servendo anche come vicepresidente del Parlamento.