Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Nel 2000, è stato assunto per dirigere la nazionale turca di calcio. La Turchia si è qualificata per la Coppa del Mondo FIFA 2002 e ha terminato terzo. Güneş ha vinto il premio UEFA Coach of the Year per il 2002. Dopo la Coppa del Mondo, ha ricevuto molte offerte da Grecia, Brasile e Spagna, ma voleva rimanere con la Turchia. Dopo che la squadra nazionale non si è qualificata per l' UEFA Euro 2004
, Güneş è stato licenziato come manager.