Durante la seconda guerra mondiale, tre battaglioni del reggimento nigeriano combatterono nella campagna dell'Africa orientale. Le unità nigeriane contribuirono anche a due divisioni che servirono con le forze britanniche in Palestina, Marocco, Sicilia
e in Birmania. Le esperienze di guerra hanno fornito un nuovo quadro di riferimento per molti soldati, che hanno interagito oltre i confini etnici in modi che erano insoliti in Nigeria. All'interno della Nigeria, l'appartenenza al sindacato è aumentata di sei volte durante la guerra a 30.000. Questa rapida crescita del lavoro organizzato ha portato nuove forze politiche in gioco. La guerra fece anche rivedere agli inglesi il futuro politico della Nigeria. Nel 1944, Herbert Macaulay e Nnamdi Azikiwe fondarono il Consiglio nazionale della Nigeria e del Camerun, un partito politico nazionalista e filo-lavoratore che sosteneva l'indipendenza nigeriana.