Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Durante il suo servizio in guerra
, il 5 ° reggimento di fanteria stava perseguendo attivamente le forze dell'esercito repubblicano filippino. Le compagnie e i vari distaccamenti del reggimento marciarono per un totale di oltre 15.426 miglia e si impegnarono in trentotto scaramucce e azioni minori prima che le ostilità terminassero nel luglio del 1902. Nelle aree sotto il controllo americano, divenne necessario che l'esercito amministrasse la legge. Sigerfoos prestò servizio come giudice-avvocato in una serie di commissioni militari per tutto l'anno 1901. Una di queste commissioni si è riunita a Vigan, nella provincia di Ilocos Sur, a Luzon, nel mese di giugno. La commissione processò Noverto Pré, un ufficiale dell'esercito ribelle, per "omicidio in violazione delle leggi e delle usanze di guerra". Condannato "a essere impiccato per il collo fino a... morire", la condanna di Pré fu commutata in quindici anni di lavori forzati in una prigione di Manila. Il procedimento di questo caso, insieme ad altri nove processi per omicidi in cui Sigerfoos ha servito come giudice-avvocato, è stato pubblicato in un'ampia confutazione da parte del Dipartimento della Guerra in risposta alle accuse secondo cui l'esercito degli Stati Uniti stava commettendo atrocità contro i filippini durante la guerra. Il Dipartimento della Guerra ha definito le accuse "infundate o grossolanamente esagerate".