IndiGo è stata fondata nel 2006 come una società privata da Rahul Bhatia di InterGlobe Enterprises e Rakesh Gangwal, un NRI statunitense. InterGlobe aveva una partecipazione del 51,12% in IndiGo e il 47,88% era detenuto dalla società di Gangwal, con sede in Virginia, Caelum Investments. IndiGo ha effettuato un ordine fermo per 100 aerei Airbus A320-200 nel giugno 2005 con l'intenzione di iniziare le operazioni a metà del 2006. IndiGo ha preso la consegna del suo primo aereo il 28 luglio 2006, quasi un anno dopo aver effettuato l'ordine. Ha iniziato le operazioni il 4 agosto 2006 con un servizio da New Delhi a Imphal via Guwahati. Alla fine del 2006, la compagnia aerea a basso costo aveva sei aerei e nove aerei in più sono stati acquisiti nel 2007. Nel dicembre 2011, IndiGo ha annunciato che avrebbe sostituito la compagnia aerea statale India Air come la terza più grande compagnia aerea civile in India, superando la King Jet Airways e la King Jet Airways con una partecipazione del 51,12% in IndiGo, mentre la compagnia aerea
La società di Gangwal, Caelum Investments, con sede in Virginia.