Nel 1986, il Cockscomb Basin Wildlife Sanctuary è stato istituito in Belize come la prima area protetta al mondo per la conservazione del giaguaro. Considerata l'inaccessibilità di gran parte dell'area di distribuzione della specie, in particolare l'Amazzonia centrale, è difficile stimare il numero di giaguari. I ricercatori si concentrano tipicamente su particolari bioregioni, quindi l'analisi su tutta la specie è scarsa. Nel 1991, si stimava che 600.000 (il più alto totale) giaguari vivessero in Belize. Un anno prima, i giaguari erano stimati a vivere in un'area di 15.000-4.000 km2 del Messico.
giaguaro