Gli studi suggeriscono che l'inquinamento luminoso intorno ai laghi impedisce allo zooplancton, come la Daphnia, di mangiare alghe superficiali, causando fioriture di alghe che possono uccidere le piante dei laghi e ridurre la qualità dell'acqua. L'inquinamento luminoso può anche influenzare gli ecosistemi in altri modi. Ad esempio, gli entomologi e gli esperti di biotecnologia hanno documentato che la luce notturna può interferire con la capacità di navigazione di farfalle e altri insetti notturni.
Inquinamento luminoso