Il 1o febbraio 2011, Jonathas ha spostato ancora una volta squadre e paesi, unendosi al Brescia Calcio in un contratto di un anno e mezzo per una commissione non divulgata, che si dice sia di € 300.000. È apparso in sei partite durante la sua campagna di debutto.
, mentre i "Biancoazzurri" erano retrocessi dalla Serie A. Ha segnato 16 gol nella Serie B 2011-12, il miglior marcatore della squadra.