Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Lyons è stato al Boston College solo per un breve periodo, prima di essere nominato rettore del Gonzaga College. Assunse la posizione il 27 dicembre 1908, succedendo a Joseph J. Himmel. Poco dopo essere entrato in carica, un terremoto
ha colpito Messina, in Italia, e la scuola ha offerto una solenne alta messa di requiem per le vittime, che è stata celebrata dal vescovo Diomede Falconio e cantata da Bonaventura Cerretti. Erano presenti il vescovo Denis J. O'Connell, il procuratore generale Charles Joseph Bonaparte, l'ambasciatore italiano negli Stati Uniti Joseph Himmel e sacerdoti degli ordini domenicano, francescano e paulista. Il 10 febbraio si tenne un banchetto in onore del nuovo presidente, a cui partecipò il deputato William Bourke Cockran. Il mandato di Lyons terminò l'8 luglio 1909, quando fu succeduto da Eugene DeL. - McDonnell. - Cosa?