Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Panis aveva il potenziale per una grande stagione in mentre guidava per Alain Prost, che aveva acquistato Ligier. Con i pneumatici Bridgestone, ha conquistato il primo podio della compagnia di pneumatici in Brasile. Era secondo in Argentina prima di andare in pensione. Dopo 6 gare, è arrivato terzo nel campionato grazie a un altro podio con il secondo posto in Spagna. Una vittoria avrebbe potuto essere possibile in quella gara se non fosse stato trattenuto per sette giri, perdendo un totale di 6 secondi al leader Jacques Villeneuve. Al Gran Premio del Canada del 1997, si ruppe entrambe le gambe in un incidente ad alta velocità, causandogli la perdita delle sette gare successive della stagione. Il suo posto nella squadra è stato preso da Jarno Trulli, fino a quando non è tornato per le ultime tre gare della stagione. Ha ottenuto il sesto posto a Lussemburgo
E sembrava che si fosse completamente ripreso dall'incidente, guidando bene come prima dell'incidente. Nonostante abbia perso la metà dell'anno, è riuscito comunque al nono posto nel campionato con 16 punti.