Nonostante la negazione iniziale da parte di Porsche dell'esistenza della 9R3, circolarono voci sulla sua cancellazione, tra cui: gli ingegneri sono stati deviati al progetto del SUV Porsche Cayenne; per evitare di competere con la sua compagna di squadra Audi R8 che ha vinto il
2000 24 Ore di Le Mans; insufficiente concorrenza dopo il ritiro di BMW, Toyota, Nissan e Mercedes-Benz. Il motore dell'auto è stato utilizzato nella concept car Porsche Carrera GT ed è stato disattivato per la versione di produzione.