Martínez ha iniziato la stagione 2013/14 sulla panchina dei sostituti, sotto il nuovo manager Pep Guardiola. Il 30 agosto 2013, in quell'anno
Nel Supercoppa UEFA del 2008, è entrato in campo all'inizio del secondo tempo della partita contro il Chelsea, e ha segnato l'egalizzatore 2/2 nell'ultimo minuto del tempo supplementare, mentre i bavaresi hanno vinto il trofeo a Praga dopo una serie di rigori. Martínez ha concluso la stagione con un gol in 34 presenze.