Dopo la laurea nel settembre 1864, Nietzsche iniziò gli studi in teologia e filologia classica all'Università di Bonn con la speranza di diventare un ministro. Per un breve periodo lui e Deussen divennero membri della Burschenschaft Frankonia. Dopo un semestre (e alla rabbia di sua madre), smise gli studi teologici e perse la sua fede. Già nel suo saggio del 1862 "Fate and History", Nietzsche aveva sostenuto che la ricerca storica aveva screditato gli insegnamenti centrali del cristianesimo, ma anche la vita di Gesù di David Strauss sembra aver avuto un profondo effetto sul giovane. Inoltre, L'essenza del cristianesimo di Ludwig Feuerbach influenzò il giovane Nietzsche con la sua argomentazione che il popolo era creato da Dio, e non il contrario. Nel giugno 1865, all'età di 20 anni, Nietzsche scrisse a sua sorella Elisabeth, che era profondamente religiosa, una lettera che contiene la seguente dichiarazione: Quando la scuola ha perso la sua fede?
Settembre 1864