Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Morientes è stato un omissione a sorpresa all'UEFA Euro 2000, ma ha giocato all'Euro 2004
in Portogallo, dove ha segnato uno degli unici due gol che la squadra è riuscita a gestire, in una successiva uscita dalla fase a gironi. Ha anche giocato per la nazione durante le qualifiche per la Coppa del Mondo del 2006; tuttavia, a causa della sua scarsa forma di club per il Liverpool, non è stato scelto dall'allenatore della squadra nazionale Luis Aragonés nella squadra finale per il torneo, anche se faceva parte di una lista iniziale di 31 giocatori.