L'inizio della guerra civile americana interruppe l'istruzione di Corson quando si arruolò nella Compagnia K della 4a fanteria della Pennsylvania nell'aprile del 1861 e fu arruolato come sergente nel luglio del 1861. Tornato alla Penn alla fine di quell'anno, servì come cadetto medico presso l'ospedale militare su Cherry e Brad Streets mentre studiava alla scuola. Si arruolò nella 6th Pennsylvania Reserves (35th Pennsylvania Volunteers) come assistente chirurgo nel marzo 1863 dopo la laurea in medicina, partecipando alle battaglie di Gettysburg, Falling Waters, Manassas Gap, Bristoe Station, Mine Run
Rappahannock Station, il Wilderness, Spotsylvania, North Anna, e la Chiesa di Bethesda. Maggiore brevettato per essersi distinto nella natura selvaggia, Corson si arruolò nuovamente nel giugno del 1864. Alla stazione di Bristoe il 14 ottobre, Corson e un assistente ospedaliero salvarono un soldato gravemente ferito lasciato tra le linee mentre era sotto il fuoco dell'artiglieria confederata. Per questa azione, gli fu assegnata la Medaglia d'Onore il 13 maggio 1899. Nel novembre 1864, divenne ufficiale medico al Camp Discharge, usato per radunare i soldati, a Filadelfia.