Completa la frase seguente: La stagione successiva Nesta ha segnato il suo primo brace per il Milan in una vittoria di 2 a 1 su Chievo in Serie A. Ha iniziato a riemergere come titolare per il club ed è stato uno dei giocatori più coerenti del Milan per tutta la stagione 2009-10 sotto Leonardo. Nesta ha continuato la sua eccellente collaborazione con il compagno centrocampista Thiago Silva durante la stagione 2010-11 sotto Massimiliano Allegri, formando una formidabile coppia difensiva, ammesso solo 24 gol in 38 partite durante la vittoria del Milan
Una campagna in Serie A. Il Milan è anche riuscito a raggiungere le semifinali della Coppa Italia, ma è stato ancora una volta deludentemente eliminato nei 1/8 di Champions League. Durante la stagione 2010/11, le speculazioni indicavano che Nesta si sarebbe ritirato alla fine della stagione. Tuttavia, in seguito ha confermato che voleva giocare un'altra stagione al Milan prima di ritirarsi e ha firmato un'estensione del contratto il 18 maggio 2011, che lo ha tenuto nella squadra del Milan fino all'estate 2012. Nesta è stato eletto per far parte della squadra dell'anno della Serie A per le sue prestazioni durante la riuscita corsa al titolo del Milan in quella stagione.