Haznawi è stato l'unico dirottatore sottoposto a un controllo aggiuntivo da parte del Computer Assisted Passenger Prescreening System (CAPPS). La sua borsa registrata è stata sottoposta a un controllo aggiuntivo per esplosivi, senza alcun controllo aggiuntivo richiesto dal CAPPS al checkpoint di sicurezza dei passeggeri. Nessuno del personale del checkpoint di sicurezza ha segnalato nulla di insolito sui dirottatori. Haznawi e Ghamdi sono rimasti a bordo del volo alle 07:39 e si sono seduti nei posti di prima classe 6B e 3D. Haznawi ha effettuato il check-in senza bagaglio mentre Nami ha effettuato il check-in con due bagagli a partire dalle 09:41 alle 09:47 (il volo è iniziato alle 09:41 del giorno). Alle 09:43 Haznawi ha effettuato il check-in con un bagaglio e alle 07:39 Jarrah ha effettuato il check-in senza bagaglio. Haznawi è stato l'unico dirottatore sottoposto a un controllo aggiuntivo per esplosivi, senza alcun controllo aggiuntivo
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