Fletcher raggiunse Manus il 9 ottobre 1944 dalla baia di Humboldt per prepararsi all'invasione di Leyte, per la quale ordinò il 12 ottobre i trasporti di screening. Il 20 ottobre, la nave fece il suo primo sbarco e il giorno dopo partì per la Nuova Guinea, liberando così il golfo di Leyte prima della grande battaglia.
perché il suo controllo è scoppiato. Tornò a Leyte con i trasporti che portavano rinforzi il 23 novembre, e durante il mese successivo, continuò il suo sostegno alla prima fase della liberazione delle Filippine, scortando convogli, sparando bombardamenti pre-atterraggio a Ormoc Bay e Mindoro, e sparando contro gli aerei giapponesi in diversi attacchi.