Scrivi una continuazione di questo paragrafo - Dopo aver ascoltato la richiesta di aiuto di William B. Travis all'Alamo
, Burnet si recò a Washington-on-the-Brazos per reclutare aiuto dalla Convenzione del 1836. Rimase al congresso e fu eletto presidente ad interim il 17 marzo 1836. Su suo ordine, il governo fuggì da Washington-on-the-Brazos per Harrisburg, ispirando così il Runaway Scrape. Il mese successivo, Burnet evitava di poco di essere catturato dalle truppe messicane.