Anche nel 1896, Armand Peugeot si staccò da Les Fils de Peugeot Frères per formare la propria società, Société Anonyme des Automobiles Peugeot, costruendo una nuova fabbrica ad Audincourt per concentrarsi interamente sulle automobili. Nel 1899, le vendite raggiunsero i 300; le vendite totali di automobili per tutta la Francia quell'anno erano 1.200. Lo stesso anno, Lemaître vinse il Rally di Nizza-Castellane-Nizza in uno speciale 5.850 cc (357 cu in) 20 hp (14.9 kW) racer. Al Salon di Parigi del 1901, Peugeot debuttò un piccolo motore a trazione a fusto 652 cc (40 in) 5 hp (3.7 kW) monocilindrico, soprannominato "Bébé" ("baby"), e abbandonò il suo stile conservatore, diventando un leader di immagine. Dopo il 19 ° posto a Parigi-Vienna nel 1902 equipaggiato con una motocicletta da 50 hp (33 cu) in tutta la Francia, le vendite totali di automobili per tutta la Francia quell'anno erano 1.200.
Il 1896