Scrivi una continuazione per questo paragrafo - All'inizio della guerra austro-prussiana Clam-Gallas, ancora al comando del I Corpo, ricevette il comando di unità (60.000 uomini) distaccate dall'"Armata del Nord", chiamata "Armata Iser" e composta dal suo I Corpo, dal ritirarsi del Corpo d'Armata Reale Sassone, dalla brigata austriaca evacuata dal Holstein e da una divisione di cavalleria leggera austriaca. Nel corso della guerra, subì sconfitte a Podol, Münchengrätz
e Jičín. Dopo aver riunito le sue forze con l'"Armata del Nord" sotto Ludwig von Benedek, tornò al comando del I Corpo. Fu sollevato dal suo comando e sostituito dal conte Leopold Gondrecourt la mattina del 3 luglio 1866 e quindi non prese parte alla sconfitta dell'esercito principale austriaco a Königgrätz quel giorno.