Nel 1960, all'inizio del gioco, il protagonista, Jack, è un passeggero su un aereo che si abbatte nell'Oceano Atlantico. Come unico sopravvissuto, Jack si dirige verso un faro vicino che ospita un terminale battisfera che lo porta a Rapture. Jack viene contattato da Atlas via radio, ed è guidato in sicurezza dagli Splicers e dai pericoli della città in rovina. Atlas chiede aiuto a Jack per fermare Ryan, indirizzandolo verso una battisfera ormeggiata dove afferma che Ryan ha intrappolato la sua famiglia. Quando Jack incontra una sorellina vagabonda e il suo caduto Big Daddy, Atlas esorta Jack a uccidere la sorellina per raccogliere il suo ADAM per se stesso; il dottor Tenenbaum lo ascolta e intercetta Jack prima che lui tormenti la sorellina, esortandolo a risparmiare il bambino e qualsiasi altra sorellina che incontra, mentre lui lo porta a Rapture.
Jack, è un passeggero di un aereo che si affonda nell'Oceano Atlantico.