Tá sé i ghleann torthúil i measc foill na cnoic ag 700 méadar (2,300 troigh) os cionn meánleibhéal na farraige. Tá scriosanna croí shuíomh na cathrach 1.6 ciliméadar (1 míle) ón sráidbhaile nua-aimseartha de Copán Ruinas, atá tógtha ar shuíomh ar casta mór a dhátú go dtí an tréimhse Chlasaiceach. Sa tréimhse Réamhlasaiceach bhí urlár Gleann Copán tonnta, swampy agus buailteach le tuileas séasúrach. Sa Chlasaiceach Luath, rinne na háitritheoirí urlár na gleann a phláintiú agus tionscadail tógála a dhéanamh chun éifeachtaí ailtireachta na cathrach a chosaint ar tuileas. Bhí tionchar mór ag Copán ar ionaid réigiúnacha ar fud an iarthair agus lár na Hondúrais, ag spreagadh saintréithe na n-eilíte Meis-Mheiriceánach a thabhairt isteach sa roinn áitiúil.
i roinn Copán