Scríobh leanúint ar aghaidh don mhír seo - Tar éis séasúr 2012, d'aontaigh Scutaro agus na Giants le conradh 3 bliana, $ 20 milliún a tháinig go hoifigiúil ar 7 Nollaig, 2012. Sa bhliain 2013, bhí Scutaro mar an dara baseman tosaigh, le Tony Abreu agus Nick Noonan mar a phríomh-chomhchláir. I 81 cluiche sa chéad leath, bhuail Scutaro.316/.367/.400 le 2 HR, 22 RBI agus 37 R, agus ainmníodh é chuig 2013 MLB All-Star Game
. D'imir Scutaro a chluiche deireanach de 2013 an 15 Meán Fómhair, agus dúnadh é go hoifigiúil an 24 Meán Fómhair. Rinne sé máinliacht ar an 27 Meán Fómhair a chuir pin isteach ina pinkie chlé ag ceartaithe a mhéar, gorta a d'fhulaing sé ar an 11 Meitheamh i gcoinne na Pirates nuair a bhuail Tony Watson é. I 127 cluiche in 2013, bhuail sé.297/.357/.369 le 2 HR, 31 RBI agus 57 R.