Baineann an chuid is mó de na baictéir isteach sna scamhóga trí mhion-aspirations d'orgánaigh a chónaíonn sa throat nó sa chraiceann. Tá na mion-aspirations seo ag leath na ndaoine gnáth le linn codlata. Cé go bhfuil baictéir i gcónaí sa throat, ní chónaíonn na cinn ionfhabhtacha ann ach ag amanna áirithe agus faoi choinníollacha áirithe. Tagann mionlach de chineálacha baictéir cosúil le Mycobacterium tuberculosis agus Legionella pneumophila isteach sna scamhóga trí thriomláin éillithe san aer. Is féidir le baictéir scaipeadh tríd an fhuil freisin. Nuair a bhíonn siad sna scamhóga, d'fhéadfadh baictéir ionradh a dhéanamh ar na spásanna idir cealla agus idir alveoli, áit a ndéanann na macrophages agus na neutrophils (cealla fola bána cosanta) iarracht na baictéir a neamhghníomhachtú. Scaoileann na neutrophils citokines freisin, ag cur le gníomhachtú ginearálta an chórais imdhíonachta
déanann na macrophages agus na neutrophils (cealla fola bána cosanta) iarracht na baictéir a dhíghníomhachtú