Is cosúil le go leor ailseacha eile, tosaítear ailse scamhóg trí ghníomhachtú oncogenes nó trí neamhghníomhachtú géin choscáin tumoir. Is cúis le mutations sna géiní seo a spreagann forbairt ailse. Is cúis le mutations sa K-ras proto-oncogene thart ar 10<unk>30% d'adenocarcinomas scamhóg. Cuimsíonn beagnach 4% de carcinomas scamhóg neamh-ghnéasach neamh-ghnéasach carcinomas EML4-ALK tyrosine kinase fusion gene. Is féidir le hathruithe epigenetic mar athruithe i meitiliú DNA, tail histone tail, nó microRNA modhnú rialaithe a bheith mar thoradh ar neamhghníomhachtú géiní coscáin tumoir. Tá sé tábhachtach, is féidir le cealla cansair resistance a dhéanamh ar strus ocsaídiúcháin, a chuireann ar a gcumas mothúchán a dhéanamh agus a mhúscairt a mhúscaíonn coinníollacha athlastacha gníomhaíocht imdhíonachta an chórais imdhíonachta. Is féidir le mutations sa K-ras proto-on
c-MET, NKX2-1, LKB1, PIK3CA, agus BRAF