Scríobh leanúnachas don mhír seo - Ar 16 Eanáir 2013, fógraíodh go dtógfadh Guardiola mar bhainisteoir ar chlub Bundesliga Bayern Munich tar éis séasúr 2012-13, ag malartú Jupp Heynckes don séasúr ina dhiaidh sin. Thug sé aghaidh ar a chéad chomhdháil phreas mar bhainisteoir Bayern, an 24 Meitheamh 2013, sa Ghearmáinis, agus bhí a chéad seisiún oiliúna aige dhá lá ina dhiaidh sin. Ba é a chéad chluiche oifigiúil an Super Cup Gearmánach i gcoinne Borussia Dortmund, agus chaill Bayern 4<unk>2. Ba é an chéad trofeu a bhuaigh sé le Bayern an Super Cup UEFA 2013.
, ag bualadh ar a namhaid fadtéarmach José Mourinho, a bhí díreach tar éis filleadh ar an traenáil ag Chelsea. Bhuaigh Bayern Chelsea deich-fhear i shoot-out tar éis do Manuel Neuer cion Romelu Lukaku a shábháil.