Scríobh leanúint ar aghaidh don mhír seo - tháinig Kroos ar ais go folláine le haghaidh tús shéasúr 2013-14 agus, d'imir sé i gCorn Super na Gearmáine agus i gCorn Super UEFA
. Ar an 4 Deireadh Fómhair 2013, scóráil sé a chéad sprioc den séasúr i dtrá 1<unk>1 i gcoinne an iar-chlub Bayer Leverkusen sa Bundesliga. Thosaigh sé dhá chluiche don Bayern i gCorn Domhanda Clubaí FIFA 2013. An chéad cheann i gcoinne Guangzhou Evergrande sa 3 <unk> 0 bua leath-chríochnaithe ar 17 Nollaig 2013, agus sa chluiche ceannais mar bhuail an fhoireann Raja Casablanca 2 <unk> 0.