Tá naoi n-eicrígiún foraoise ag an tSeapáin a léiríonn aeráid agus tíreolaíocht na n-oileáin. Tá siad ó fhoraoisí leathléithe taise subtrópaiceacha sna hOileáin Ryūkyū agus Bonin, go foraoisí leathléithe agus measctha measartha i réigiúin aeráide measartha na bpríomh-oileáin, go foraoisí cónaiféireacha measartha i gcodanna fuar, geimhridh na n-oileáin thuaidh. Tá níos mó ná 90,000 speiceas fiadhúlra ag an tSeapáin, lena n-áirítear an t-éireaball donn, an macac Seapánach, an madra racoon Seapánach, an luch feirme mór Seapánach, agus an salamander ollmhór Seapánach. Bunaíodh líonra mór páirceanna náisiúnta chun limistéir thábhachtacha d'fhlóra agus ainmhithe a chosaint chomh maith le tríocha seacht suíomh Ramsar. Tá ceithre shuíomh cláraithe ar Liosta Oidhreachta Domhanda UNESCO mar gheall ar a luach nádúrtha leathan
na hOileáin Ryūkyū agus Bonin