Críochnaigh an abairt seo a leanas: Nuair a athnuaitear an cogadh i 1799, bhí Jourdan i gceannas ar an arm ar an Ríne, ach d'fhulaing sé defeat arís ag lámha an Archduke Charles ag cathanna na
Ostrach agus Stockach ag deireadh mhí an Mhárta. Díomá air agus a shláinte briste, thug sé an ceannasacht ar láimh don Ghinearál André Masséna. D'fhill sé ar a dhualgais pholaitiúla agus bhí sé ina fhreasúraí suntasach ar Chuairt 18 Brumaire, agus ina dhiaidh sin díbríodh é as Chomhairle na Cúig Cheud. Go gairid, áfach, tháinig sé le chéile go foirmiúil leis an "régime" nua, agus ghlac sé le fostaíocht nua míleata agus sibhialta ó Napoleon. Sa bhliain 1800, rinneadh Jourdan ina iniúchóir ginearálta ar chaibalraíocht agus ar choisitheacht agus ina ionadaí ar leasanna na Fraince i bPoblacht Cisalpine.