1654年至1667年同俄羅斯嘅戰爭以及北方大戰 (1700年至1721年) 期間,梅爾基內受到俄羅斯和瑞典軍隊嘅嚴重傷害,並失去戰略和經濟上的重要地位. 梅爾基納喺1794年嘅起義中又一次被俄羅斯軍隊燒毀
想將波蘭-立陶宛聯邦從俄羅斯嘅影響下解放出嚟. 1794 年,城市清單提到尼穆納斯河嘅河口,尼穆納斯河同梅爾基斯河都被評為適合航行. 19 世紀嘅文獻提到梅爾基納係一個河流貿易中心,喺嗰度建造河流貿易船隻.