1861年,霍金斯幫助成立第九紐約步兵隊,一個以祖亞夫風格嘅連隊,俗稱為"霍金斯祖亞夫" (Hawkins Zouaves) 於南北戰爭服役. 霍金斯喺 1861 年 5 月 4 日被任命為軍團上校,喺戰爭初期喺北卡羅萊納州出色地服務. 佢係班傑明·巴特勒嘅隊員 喺攻佔哈特拉斯堡嘅途中
喺 1861 年 因為佢喺哈特拉斯堡嘅功績,佢希望 升到大將嘅位置 但佢反而因為 insubordination 而被<unk>咗下 1861 年 10 月 8 日,霍金斯喺一個憤怒嘅信度寫道: "今時今日嘅旅長將軍, 佢哋嘅形象好奇怪, 我唔覺得成為一個旅長將軍 係一個好榮幸". 事實上,霍金斯喺1866年被升為大將,從1865年3月13日開始. 儘管佢好<unk>,霍金斯早就發出一篇 引起林肯總統嘅關注嘅文章. 霍金斯被邀請到白宮 同總統兼最高司令官 George B. McClellan 傾偈. 喺嗰度,佢幫助過聯邦最高指揮部 相信北卡羅萊納州帕米洛海<unk>嘅聯合行動係可能嘅