喺1949年,布拉格嘅猶太社區委員會 代表捷克嘅剩餘嘅猶太社區 將博物館嘅管理權交畀共產主義政權 1950 年 4 月 4 日,呢個博物館改名為國家猶太博物館,一個文化機構擴展到六個會堂,一個儀式廳同埋一座墓地,設立為"一個紀念碑,一個歷史保存機構同埋一個研究機構". 共産主義者壓制猶太教, 禁止同外國研究員有聯繫, 唯一被允許嘅展覽係來自特雷辛嘅兒童繪畫. 1968 年蘇聯入侵之後
很少有新展覽. 雖然呢個博物館係捷克斯洛伐克最大嘅旅遊景點 每年吸引七十萬人參觀 只有專業學者知道呢個博物館嘅藏品