Junípero Serra 用八年時間建造教堂 直到1770年 隨著各種歷史事件發生 包括清真寺嘅驅逐 令我哋不得不放弃傳教 塞拉搬到加州. 當塞拉離開嘅時候 傳教團就落咗喺傳教士嘅手裏面 喺墨西哥獨立戰爭同墨西哥革命期間
任務遭到搶劫同摧毀 任務教堂嘅外部修復工作喺 1980 年代開始. 1991年到1997年, 修改咗內部嘅祭壇,合唱團,風琴同埋畫作. 1997年至2002年间, 國家又贊助咗更多嘅工作. 九十年代嘅工作亦包括喺周圍嘅廣場同紀念碑嘅工作. 2000年開始將遺跡列入世界遺產嘅努力,到2003年終於成功,當時係世界遺產委員會第二十七次會議上加入遺跡.