喺南北戰爭開始時,海斯重新加入第63賓夕法尼亞志願步兵連隊嘅上校,佢亦喺 1861 年 5 月 14 日起喺美國正規軍隊嘅第16步兵隊擔任隊長. 佢嘅部下都知道佢有"獅子般嘅勇氣". 喺半島戰役期間,佢同佢一隊被派到Heintzelman嘅第三軍團 Kearny嘅第一個旅隊. 佢係約克敦,威廉斯堡,七棵松,薩維奇火車站嘅戰鬥場上
同埋馬爾文山. 七日戰爭結束時,佢被任命為常規軍隊嘅中校, 因為佢喺戰鬥中表現出勇氣, 因為海斯帶領隊伍用 bayonets 擊入敵方陣線,掩蓋隊伍嘅後退. 一個月之後,海斯病假咗一段時間, 部分盲,左手臂<unk>, 因為戰鬥中受傷.