1260 年,阿尤比德王朝入侵敘利亞,蒙古人帶領基特布卡喺 1260 年 3 月 1 日入侵城市,亞美尼亞國王赫圖姆一世同安提阿公爵波希蒙德六世一同入侵城市; 因此,大馬士革市民喺六個世紀之後第一次見到三位基督教君主喺街上騎馬勝利. 但係喺蒙古喺艾因加魯特嘅戰勝之後
1260年9月3日,大馬士革被俘,五日後成為由埃及統治嘅馬姆盧克蘇丹國嘅省首府. 喺瓦迪阿爾哈茲納達爾戰役嘅勝利之後 迦薩<unk>率領嘅蒙古人圍攻咗城市十日,城市喺 1299 年 12 月 30 日到 1300 年 1 月 6 日之間投降咗,雖然城堡抵抗咗. 甘<unk>喺二月份帶著大部份軍隊撤退,可能係因為蒙古馬需要飼料,佢留低大約一萬名馬兵喺蒙古將軍穆拉嘅指揮下. 大約喺 1300 年 3 月,穆拉伊帶著騎兵返去大馬士革,之後跟著加桑穿過伯拉河. 1300 年 5 月 埃及嘅馬姆魯克王朝從埃及返嚟 喺無任何戰鬥嘅情況下奪返整個地區 喺 1303 年 4 月,馬姆魯克人喺馬爾吉薩法爾戰役中擊敗咗由庫特魯沙和穆拉伊帶領嘅蒙古軍隊 同埋佢哋嘅亞美尼亞盟友,終結咗蒙古人入侵黎凡特. 1348年到1349年,黑死病 (Black Death) 襲擊到城市一半人口