當現代奧運會喺 1896 年開始嘅時候,開發者同主辦者都想舉辦一個令人熱愛嘅盛會, 令人想起古希臘嘅榮耀. 馬拉松賽事係由米歇爾·布雷爾 (Michel Bréal) 提出 佢希望呢個比賽可以喺 1896 年雅典舉辦嘅 第一個現代奧運會上出現 呢種諗法受到現代奧運會嘅創辦人皮埃爾·德庫伯廷 同埋希臘人好支持 1896年3月22日,希臘人舉辦奧運馬拉松競賽,馬拉松競賽由卡里拉奧斯·瓦西拉科斯 (Charilaos Vasilakos) 以3小時18分鐘的時間贏得 (奧運馬拉松競賽初賽後,斯皮里多斯·路易斯 (Spyridon "Spyros" Louis) 在兩週後的第二場比賽中奪得第五名). 1896年4月10日,第一場奧運馬拉松嘅冠軍係希臘嘅水手斯皮里多·路易斯 (Spyridon Louis) 用咗2個鐘58分50秒 2004年夏季奧運嘅馬拉松賽
賽事喺從馬拉松到雅典嘅傳統路線上進行 賽事喺1896年夏季奧運會嘅地點帕納西奈科體育場結束 意大利嘅Stefano Baldini 喺2個鐘10分55秒贏咗男子馬拉松賽, 呢個時間係馬拉松賽嘅新紀錄, 直到2014年奧運會以外嘅雅典馬拉松賽,