1940年六月,當立陶宛被蘇聯佔領時,奧克斯圖利斯同其他高官喺考納斯機場迎接維雅切斯拉夫·莫洛托夫嘅副手,弗拉基米爾·德卡諾佐夫. 儘管佢老婆逃到阿根廷,佢仍然喺立陶宛,佢利用佢嘅外交聯繫幫 Martynas Yčas 逃到柏林. 蘇聯接管後,奧克斯圖利斯失去了部份嘅工作,但通過Justas Paleckis嘅推薦 (佢哋喺里加嘅立陶宛使館一齊工作) 佢喺Panevėžys嘅第1號中學任教俄語. 佢係六月被拉到西伯利亞嘅 17,500 個立陶宛人之中一個
喺 1941 年 Aukštuolis 同其他幾位立陶宛人,包括前總統 Aleksandras Stulginskis 同部長 Stasys Šilingas,最後都被送到 Kraslag, Krasnoyarsk Krai. 1942 年,佢同其他 16 位立陶宛人再次被捕,被指控犯有反蘇活動. NKVD 建議判死刑,但最後嘅判刑係25年嘅 判刑宣佈於1952年2月,即Aukštuolis 喺Dubravlag 死於結核同營養不良之後幾乎三年.