2003年10月1日,三個組織合併形成新JAXA:日本太空與航天科學研究所 (ISAS),日本國家航空航天實驗室 (NAL),日本國家太空發展署 (NASDA).JAXA作為一個由教育,文化,體育,科學與技術部 (MEXT) 和內政部和通訊部 (MIC) 管理的獨立行政機構成立.合并之前,ISAS負責太空與行星研究,而NAL專注於航空研究.NASDA於1969年10月1日成立,已經開發發發射彈,衛星,並建造了舊的日本實驗模組.NASDA總部位於目前的田島太空中心,位于田島島島上.在2012年初,內閣通過了新的立法,由美國內閣通過,由日本總理帶領,由JAXS從美國太空總部移至日本太空政策局 (MEXT) 進行訓練,並通過了新的法律,包括日本太空戰略部 (MEXT) 通過.在美國內閣議會議長辦公室通過了新的
2003年10月1日