1939 年 9 月,德國同蘇聯聯聯合入侵波蘭,第二次世界大戰開始後,奧古斯托夫被佔領
蘇聯統治到1941年 好多居民被送到哈薩克流亡,喺六年之後,有些人返到家. 1941年6月22日,就喺德國人佔領奧古斯托夫之前,蘇聯喺奧古斯托夫屠殺咗大約30到34名波蘭囚犯. 納粹德軍佔領奧古斯托夫直到1944年,並喺城鎮開設強制勞動營. 第二次世界大戰摧毀咗大約70%嘅城鎮,大部分居民都被殺或逃離,其中包括成千上萬嘅猶太人被囚喺運河同河之間嘅貧民窟. 德國人離開之前幾乎全部人被射殺 1945 年,蘇聯軍喺附近嘅奧古斯托夫 (Augustów) 圍捕前國軍反共戰士