1996 年,Ralston 成為聯合軍長副主席 1997年,佢最受歡迎成為聯合軍長主席, 但因為有秘密關係被揭露,佢仍然係副主席, 直到2000年五月. 之後,佢成為北大西洋盟國組織 (NATO) 歐洲嘅最高指揮官,直到2003年1月佢退休. Bill Clinton喺佢回憶錄"My Life"裏面寫話,Ralston被用嚟解決巴基斯坦嘅一個潛在衝突嘅局面,即美國喺美國大使館爆炸事件之後 用巴基斯坦嘅空域嚟攻擊阿富汗嘅基地組織.
喺肯尼亞同坦桑尼亞 美國擔心巴基斯坦嘅情報機構 泄露咗巴基斯坦嘅目標 或者更糟糕嘅係 假設巴基斯坦上空嘅導彈嚟自印度 可能會喺印度次大陸引發核戰 克林頓喺"我嘅生活"嘅第799頁寫.. "我哋決定派美國聯合將軍副主席 喬·拉爾斯頓將軍 同巴基斯坦最高軍事指揮官一齊晚餐". 拉爾斯頓會告訴他 (巴基斯坦將軍) 發生了什麼事 在我們的導彈入侵巴基斯坦空域前幾分鐘,太遲了, 沒有辦法提醒塔利班或基地組織,