因為蛋白質太細,用光顯微鏡睇唔到,所以要用其他方法嚟決定佢哋嘅結構. 常見嘅實驗方法包括X射線結晶學同埋NMR光譜學,兩種方法都可以喺原子分辨率下生成結構信息. 不過,NMR實驗可以提供由距離估計原子對之間嘅距離嘅子集,同埋蛋白質嘅最終可能嘅 conformations係由距離幾何學問題決定嘅資訊. 兩極干預測學係一種量化分析方法嚟量度蛋白質嘅整體結構同埋因病毒嘅互動嘅變化而受到影響,即係藥物設計. 另一種方法通常用於製造蛋白質嘅蛋白質,特別係喺實驗室嘅高分辨率嘅蛋白質.
電子晶體學