1799年底至1799年初, 第二次世界大戰爆發. 大概喺成立之後嘅一年 軍隊嘅數量大概增加到一萬個 但當反法聯盟進攻義大利 而唔再有人支持拿破<unk> 喺埃及嘅法國精英部隊時 新一輪嘅戰鬥變得更加困難 1799年,法國軍團嘅損失好大. 1799年中期,第一軍團領導大將Dąbrowski在Trebbia (17<unk>19年6月1799年) 戰鬥俄羅斯人,在那裡它遭受了沉重的傷亡 (五個大隊中只有兩個在戰鬥中幸存下來,Dąbrowski受傷). 1799年7月15日,波兰军团在诺维战役 (Novi) 以及第二次苏黎世战役 (Zurich Battle) 中作战.
九月廿六日