第二季開始於逃亡後八個小時,主要集中於八個逃亡者. 系列創作者Paul Scheuring描述第二季為"逃亡者八次"並將其比作"大逃亡的下半年".逃亡者分開,前往全國各地,當局緊緊跟著他們,他們各自追求各自的目標.Brad Bellick從佢作為主要警衛工作嘅監獄被解雇,並自己追捕囚犯為獲獎金.幾位逃亡者重新聯合尋找另一個福克斯河囚犯Charles Westmoreland埋咗好多錢.聯邦特工Alexander Mahone被派去追蹤並捕八個逃亡者,但被揭露自己係為The Company工作,希望八個男人全部死.當 Sara發現她的父親被綁架時,她被判處死刑.當前聯邦監獄總裁Michael T.
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