Jansen jokalari-entrenatzaile gisa itzuli zen Pazifikoko Kostako Ligara. Seattle-rekin (1955 eta 1957) eta Portland-ekin (1958-1960). Alvin Dark taldekide ohiaren dei baten ondoren, Jansen Liga Nagusira itzuli zen San Francisco Giants taldeko entrenatzaile gisa, Dark manager gisa. Jansenek hamaika denboraldi eman zituen pitching entrenatzaile gisa, eta Juan Marichal eta Gaylord Perry etorkizuneko Hall of Famerrak garatzen lagundu zuen. Bere agintaldian, Giants-ek 1962ko Munduko Seriean eta 1971ko Liga Nazionalaren Txapelketako Seriean parte hartu zuen.
-Ez da izango. Ondoren, MLBko bere azken entrenatzaile lanpostuari ekin zion, Chicago Cubs-en pitcherrak kudeatuz 1973an, bere Giants-eko entrenatzaile zaharrarentzat, Leo Durocher, eta ondoren Whitey Lockman taldekide ohiarentzat lan eginez.