1861eko apirilean, Gerra Zibila hasi zenean, Estatu Batuetako armadaren buru izendatu zuten. Abuztuan Benjamin F. Butler jeneralaren agindupean bidali zuten tropekin, Hatteras lurmuturretik gertu zeuden bi kostaldeko gotorlekuak hartzera. Bitartean...
Ondorengo batailan, gotorlekuak galdu gabe hartu zituzten, baina ez zailtasun batzuen ondorioz, eguraldiaren ondorioz, eta flota Fort Monroera itzuli zen ospe handiz. Hala ere, laster kritikak egin zizkioten Stringham-i bere itsasontziak gertuago ez hartzeagatik eta kostaldean zehar eraso egiten jarraitzeagatik. Bere itsasontziek ur gehiegi ateratzen zutela kostaldeko ur meheetan sartzeko, eta berehala itzultzeko agindua jaso zuela, azkenean agertu zen, baina, antza, beranduegi bere narritasuna baretzeko, hurrengo hilabetean, bere eskariz, bere aginteaz askatua izan baitzen. 1862ko abuztuaren 1ean, kalte-ordain txiki gisa, erretiratuen zerrendan kontradmiral mailara igo zuten.