Ondorengo esaldia osatu: Hamšíkek Gökhan Inlerrek abenduaren 7an Villarreal-en aurkako lehen gola egin zuen eta gero gola erabakigarria egin zuen, Napolik 2 eta 0ko garaipena eskuratu zuen Espainian. Garaipenak 16ko finalera sailkatzea lortu zuen talde oso zail batean, Bayern Munich eta Manchester City barne. Hamšíkek Napoliri lagundu zion 2011-12ko kanpainaren lehen zatia bikain amaitzen, abenduaren 21ean Genoaren aurkako partida batean gol bikaina sartuz. Hamšíkek Goran Pandev eta Walter Gargano-ren strikeak ere lagundu zituen partidan. 2011-12ko kanpainaren lehen erdian, Hamšík 16 filmetan agertu zen.
Serie Ako partiduetan, bost gol sartu eta bost assist egin ditu. Napoliko Europako kanpainan, Hamšík talde fasean jokatu zituen sei partiduetan aritu zen eta bi gol eta assist bat egin zituen.