Malagridaren eragina Lisboako Gortean Carvalho lehen ministroaren aurkako etsaitasun handiaz bete zen, Pombaldeko markesaren etorkizuna. Carvalho Lisboa berreraikitzen saiatu zen 1755eko lurrikararen ondoren.
Malagriden ustez, Jainkoak gizon gaiztoak zigortzen zituen. Carvalho haserre zegoen gobernuaren kritika inplizituarekin, eta José erregea konbentzitu zuen Malagrida Setubaldera erbesteratzea 1756ko azaroan eta jesuita guztiak Gortetik kentzea.