XVI. mendean, Espainiak Guatemala konkistatu zuen garaian, lakuaren ertzean gudu bat izan zen. Bertan, espainiarrek eta Kaqchikel aliatuek Tz'utujils garaitu zituzten. Espainiarrek Guatemala konkistatu ondoren
, frantziskotarrek Panajachelen eliza eta monasterioa sortu zuten handik gutxira, eta hiria zentro gisa erabili zuten eskualdeko indigenak erromatar fede katolikoan bihurtzeko. Elizaren jatorrizko fatxada oraindik ere zutik dago eta Guatemalako estilo kolonialaren harribitxietako bat da.