Ondorengo esaldia osatu: Red Bull Salzburg Austriako klubean amaitu zuen bere ibilbidea, non erreserba taldeko entrenatzailearen ez-jokatzeko papera hartu zuen eta azkenean Ricardo Moniz taldeko kudeatzailearen laguntzaile bihurtu zen. 2013ko urtarrilean, Kovač Kroaziako 21 urtez azpiko selekzio nazionala hartu zuen eta 2013ko urrian Kroaziako senior selekzioa hartu zuen Igor Štimac kaleratu ondoren. Kovač Kroaziaren entrenatzailea izan zen 2014ko FIFA Munduko Txapelketan, eta gero Eintracht Frankfurteko entrenatzaile nagusi bihurtu zen 2016an,
2018ko DFB-Pokal finala klubarekin. Bayern-en, Kovač-ek 2019ko etxeko bikoitza irabazi zuen denboraldiari amaiera ona eman ondoren, baina bere lana galdu zuen udazkenean. 2020ko udan, Kovač Monakoren entrenatzaile izendatu zuten.