Osatu hurrengo esaldia: 1806an, Herbehereetako agintari okupatu frantsesek Utrechteko Unibertsitatea "école secondaire" izatera jaitsi zuten, baina 1813an Herbehereetako Erresuma Batua sortu ondoren, lehengo estatusa berreskuratu zuen. Leiden, Leuven, Groningen, Utrecht eta Ghent ziren estatu berriaren bost unibertsitateak. Unibertsitateetako bi (Leuven eta Ghent) Belgikako estatu berriaren parte bihurtu ziren, beren lurraldeak izan ondoren.
Herbehereetako Erresuma Batua 1830ean banatu zen. Ondorioz, Utrechteko Unibertsitatea hiru unibertsitate holandarretako bat izan zen. Frantziar okupazioaren garaian, Luis Napoleón erregeak jauregi bat eraikitzeko agindua eman zuen Utrecht erdigunean, azkenean Unibertsitate Liburutegiaren hirigunea bihurtu zena.