Kelly-ren bigarren espazio bidaia STS-118 misioko komandante gisa izan zen, 12 eguneko espazio-itzulera misioa ISS-ra 2007ko abuztuan. Kelly-ren hirugarren espazio bidaia ISS-ko 25/26 espedizioko tripulazio kide gisa izan zen. 2010eko urriaren 9an iritsi zen ISS-ra Soyuz TMA-01M ontzian, eta hegazkin ingeniari gisa aritu zen 2010eko azaroaren 25ean estazioaren agintea hartu zuen arte 26. espedizioaren hasieran.
Urriak 9, 2010