1900. urtean, San Juan muinoan bizi ziren afroamerikar gehienak. San Juan muinoan bizi zirela esaten zuten, afrikar-amerikar soldaduen oroimenez.
Kubako San Juan muinoan Espainiar-Amerikar gudan. 1960rako, etxebizitza pisuz osatutako auzo gogorra zen, eta horien eraistea atzeratu egin zen "West Side Story" film musikalako kanpoko planoak egiteko. Ondoren, hiri-berritzeak Lincoln Center for the Performing Arts eta Lincoln Towers apartamentuak eraikitzea ekarri zuen 1962-1968 bitartean.