1863an, erregimentu berriak Bigarren Mundu Gerran parte hartu zuen.
, Champion Hill-eko gudua, Big Black River Bridge-ko gudua, eta Vicksburgeko setioa, non erregimentua konfederatuen errendizioaren zati gisa harrapatu zuten. Erregimentuaren gizonek presoen trukea egin zuten eta Konfederatuen armadan sartu ziren berriro, oraindik ere 1. eta 4. Missouri Infanteriako Erregimentuaren (Konsolidatua) izenean. 1864an, New Hope elizako guduan, Kennesaw mendiko guduan, Atlantako setioan, Allatoonako guduan eta Franklineko guduan parte hartu zuen erregimentuak. 1865eko maiatzaren 9an, gerra amaitzear zela, 1. eta 4. Missouri Infanteriak (konsolidatuak) errenditu ziren Blakely gotorlekuaren guduan, unitatearen existentzia amaituz.