1945eko abuztuaren 29an, "Missouri"n ontziratu ondoren, Halsey almiranteak Japoniako hirugarren flota gidatu zuen Tokioko badiaraino. 1945eko irailaren 2an Japoniako Inperioaren errendizio dokumentuak agertu ziren.
Missouri itsasontziaren hondartzan. Hirugarren flota Japoniako uretan egon zen 1945eko irailaren amaiera arte, bere itsasontziek Estatu Batuetako Mendebaldeko Kostaldera joateko agindu zioten arte. 1945eko urriaren 7an, Hirugarren flota erreserbako flota izendatu zuten eta estatus aktibotik kanporatu zuten.