Osatu esaldi hau: Madani-ren jarraibideen arabera, parte hartu zuen eta lider bihurtu zen Indiako independentzia mugimenduan. 1947an Indiaren zatiketaren ondoren, Chowdhury-k Pakistan sortu berriaren garapena babestu zuen, Jamiat Ulema-e-Hind erakundearen lidergoarekin batera lan eginez. Bangladeshen ondoren
1971n independentzia aldarrikatu zuen, eta saiatu zen Pakistango armadaren indarkeria saihesten. Ronokaliko berrogeita hamar senide armadaz inguraturik zeudenean, Chowdhuryk arrakastaz eskatu zien soldaduei haiek salbatzeko. Beste batean, egoera berean zeuden zazpi hinduen bizitzak salbatzeko gai izan zen. Ondoren, Chowdhuryk parte aktiboa hartu zuen Bangladesheko Khilafat mugimenduan, Hafezzi Huzuren gidaritzapean lan eginez eta bere konferentzia askotan buru izanik.