Latimerrek bigarren ikasturtean, Gerra Zibila hasi zen eta Latimerrek VMI utzi zuen Hegoaldeko Konfederazioaren alde lan egiteko. 1861eko udaberrian eta udan Richmond Hampden Artilleriako kadete tailerraren maisu izan zen. Udazkenean, lehen teniente izendatu zuten eta Richard S. Ewell jeneralaren dibisioa ikusi zuen 1862ko Shenandoah Haraneko kanpainan. Lehenengo Winchesterren batailan bere bateriarekin ospetsua izan ondoren,
Latimer A.R. Courtneyren batailoiaren buru izendatu zuten. 1862ko abenduan Fredericksburgeko batailoiaren agintea hartu ondoren, 1863ko martxoan maiore izendatu zuten Latimer. Ewell-ek "Napoleon Gaztea" deitu zion, baina bere garaikideek bere gaztetasuna eta altuera txikia nabarmendu zuten "Mutil Maiorra" deituz. Richard Snowden Andrews maiorraren batailoian ofizial bihurtu zen, Edward "Allegheny" Johnson maior-generalaren dibisioko.