1656. urtean, protestanteen eta katolikoen arteko tentsioak berriro agertu ziren eta Villmergeneko Lehen Gerraren izurritea eragin zuten. Katolikoak garaile atera ziren eta euren nagusitasun politikoa mantentzeko gai izan ziren. Toggenburgeko gerra
1712an sortu zen, protestanteen eta katolikoen arteko gatazka batean. 1712ko abuztuaren 11ko Aarau Bakearen eta 1718ko ekainaren 16ko Baden Bakearen arabera, gerra amaitu zen hegemonia katolikoaren amaierarekin. 1847ko Sonderbund gerra ere erlijioaren araberakoa izan zen.