Newtonen aita, Isaac Newton ere izenekoa, hiru hilabete lehenago hil zen. Garaiz jaio, Newton haur txikia zen; bere ama Hannah Ayscoughly-k kontatu zuenez, laurdeneko edukiontzi batean sartu zitekeen. Newtonek hiru urte zituenean, bere ama berriz ezkondu eta bere senar berriarekin, Barnabas Smith erreberendoarekin, bizitzera joan zen, bere ama ama amaz beste, Margery Ayscoughlerekin. Bere aitaginarrebak ez zuen gustuko eta etsaitasun batzuk mantendu zituen bere amarekin ezkontzeagatik. Bere gurasoak, Henry Newton, bere aitaginarrebak eta bere ama, Henry Newton, bere gurasoak eta bere aita, 1659ko ekainean, bere aita eskolatik bidali zioten, eta bere ama izan zen.
Bere ama konbentzitu zuen eskolara bidaltzeko.