1940ko ekainaren 10ean Italiak gerran sartu ondoren, Waller Afrikako iparraldean minak aurkitzeko bilaketan aritu zen. Tiratzaile trebea zen, eta pertsonalki lehertu egiten zituen mina flotatzaileak errifle batekin eta armadura zulatzeko balaz. Ekainaren 21ean, Stuartek Bardia hiria bonbardatu zuen. Hurrengo hilabetean, bere 10. destroierra flota Calabriako guduan parte hartu zuen. Wallerren itsasontziek Capuzzo gotorlekua bonbardatu zuten abuztuaren 17an eta Italiako itsasontzi base bat Bomba Golkoan aste bat geroago. Irailean, Distinguished Service Order (DSO) saria eman zioten "adoretsu, ekintzaile eta azken borroketan betebeharrari emandako konpromisoagatik", bereziki, etsaiaren mina-eremuak zehazteagatik. Hilabete berean, HMAS "Vampire" ontzira transferitu zen eta "Stuart" konponketara joan zen. 1940ko abenduan Aliatuen armadak Italiako indarrei kontraerasoa egiten hasi zirenean, Mediterraneoko Flotaren Komandante Nagusiak, Sir Andrew Cunningham almiranteak, Wallerri Inshore Eskuadroi berriaren agintea eman zion, destruktoreak, minak garbitzeko itsasontziak eta laguntzaileak osatuta. Cunningham-en ofizial nagusia zela, Waller-ek Bardia-ko erasoaren itsas laguntzaz arduratzen zen.
1941eko urtarrilaren 5ean Aliatuen eskuetan erori zena. Handik gutxira, Inshore Eskuadroiaren agintea utzi eta Stuart ontzira itzuli zen.