Osatu esaldi hau: "Konfederazioaren hiri hazten zirenen artean, Lucerna oso ezaguna zen biztanle berriak erakartzeko". Batez ere katolikoa izanik, Lucernek bere urteko pasio-jokoa antolatu zuen 1453tik 1616ra, bi eguneko antzezlana, egunean 12 orduko antzezlana. Erreforma garaian konfederazioa desegin zenean, 1520tik aurrera, inguruko hiri gehienak protestanteak bihurtu ziren, baina Lucernek katoliko izaten jarraitu zuen. Katolikoek protestanteen aurka 1531ko Kappel-eko guduan lortu zuten garaipenaren ondoren, hiri katolikoek konfederazioan nagusitu zuten. Garai horretan izan zen 1567an lehenengoz jesuitak Lucernera iritsi ziren, Carlo Borromeo kardinalaren, Milanoko artzapezpikuaren, laguntza handiarekin. Lurraldea, ordea, hiri protestanteek menperatua izateko zorian zegoen, hala nola Zürich, Bern eta Basel, 1712an indar katolikoak garaitu zituztenak.
Toggenburgeko gerra. Luzernek konfederazioan zuen lehengo posizio nabarmena betiko galdu zen. XVI. eta XVII. mendeetan, gerrak eta izurriteak gero eta gutxiago izan ziren eta, ondorioz, herrialdeko biztanleria asko handitu zen.