Osatu esaldi hau: Pizarrok garaipen azkarra lortu zuen arren, indioen matxinadak hasi ziren, eta kolonia garaian zehar etengabe egin ziren. 1537an Manco Inca, espainiarrek txotxongilo enperadore gisa ezarri zutena, agintari berrien aurka matxinatu zen eta "neo-inka" estatu bat berreskuratu zuen. Estatu honek Espainiako aginteari erronka egiten jarraitu zuen, baita espainiarrek matxinada zapaldu eta Túpac Amaru buru moztu ondoren ere, Cuzcoko plaza publikoan, 1572an. Geroago, Boliviako mendilerroetako matxinadak komunitateko zaharrek antolatu ohi zituzten eta bertakoak izaten jarraitzen zuten, salbuespenak izanik
Tupac Amaru II.aren matxinada handia XVIII. mendean.