Trumanek eskatu die Roosevelten kabineteko kideei... beren karguetan jarraitzeko. Bere administrazioaren oinarrizko printzipio bat azpimarratu zuen: berak hartuko lituzke erabakiak, eta haiek babestu egin beharko zuten. Bigarren Mundu Gerran, Japonia inbaditzeko zorian zegoela, bi bonba atomiko jaurtitzeko egutegia onartu zuen Japoniako kontinentean inbasio garestia saihesteko. Armadaren kalkuluen arabera, Japonia inbaditzeak urtebete iraungo zuen eta 250.000 eta 500.000 hildako estatubatuar izango zituen. Hiroshiman bonbak bota zituzten abuztuaren 6an eta Nagasakin hiru egun geroago. 105.000 hildako. Sobiet Batasunak gerra deklaratu zion Japoniari abuztuaren 9an eta Mantxuria inbaditu zuen. Japonia errenditu da.
Hurrengo egunean. Truman-ek esan zuen Japoniako bonba atomikoek... bi aldeetan bizitza asko salbatu zituztela. Bigarren Mundu Gerraren amaieran, Trumanek Marshall Plana ezarri zuen. 1948ko primarioak eta kanpainak alde batera utzita, Trumanek Berlineko blokeoari aurre egin zion, Gerra Hotzaren lehen krisi diplomatiko nagusitzat jotzen dena. Bere lehendakaritzan, Trumanen onarpen indizeak nabarmen jaitsi ziren, 1945eko hasieran %80tik 1947ko hasieran %30era. 1946ko erdiko hauteskundeek Truman larritu zuten, errepublikanoek Kongresuaren bi etxeen kontrola eskuratu zutenean, 1920ko hamarkadatik lehen aldiz. 1947an, Trumanek James Forrestal bere defentsa-idazkariari esan zion zerbitzuan ordainsariaz gain... ez zuela asebetetzerik lortzen lehendakari izatean.