1813ko uztailean, federalisten aurkako garaipenak bultzatuta, Nariño jeneralak kanpaina militarra hasi zuen gainerako espainiar eta errege-indarrei aurre egiteko hegoaldean, Pasto eta, azkenean, Quitora iristeko asmoz. Nariñoren indarrak, Hegoaldeko Armada izenarekin ezagutzen direnak, 1500 eta 2000 gizon artekoak, Popayán harrapatzea lortu zuten 1814ko urtarrilean, baina erabat garaitua izan zen Pasto-n 1814ko maiatzean, eta Nariño atxilotu eta ondoren Kitotik Cadizeko Errege espetxera bidali zuten. Federazionalistek hau aprobetxatu zuten Bogotari eraso egiteko, eta horrek baimendu zion Simón Bolívar Probintzia Batuetako jeneralari 1814ko abenduan baldintzak behartzea. 1815ean, ordea, Pablo Morillo espainiar indar handi batekin iritsi zen eta eskualdea berreskuratu zuen.
Geroago Fernando zaharberritua. 1816ko maiatzaren 6an, Santafé hartuta, gailendu zen Morilloren kanpaina.