1944ko abenduan, Filipinetako eta Estatu Batuetako indar bateratuek Filipinak Japoniako indarretatik askatzeko aurrera egiten jarraitu zutenean, Filipinetako Bigarren Errepublikako gobernua, Aquino barne, Baguiora lekualdatu zuten. Ondoren, Japoniara hegan egin zuten, eta han atxilotu eta espetxeratu zituzten Sugamoko espetxean, bertako beste funtzionario batzuekin batera, japoniarrek amore eman zutenean.
-Ez da izango. 1946ko abuztuaren 25ean, Aquino Filipinetara itzuli zen hegazkinez Herri Auzitegiak traizio karguengatik egindako epaiketarako; aste batzuk geroago fidantzaz askatu zuten.