Bigarren Mundu Gerraren amaieran, Japoniara ihes egin zuen... eta Japoniara joan zen bizitzera.
Japoniak 1945eko irailaren 9an errenditu zenean, Txinako ordezkariak, He Yingqin jeneralak, Japoniako ordezkariari, Okamura Yasuji jeneralari, Chen Gongbo Txinara entregatzeko eskatu zion, traizioagatik epaitu zezaten. Eskaria onartu zuen okupazio indar estatubatuarrak, eta Chen Txinara eskoltatzen zuten urriaren 3an. Epaiketan, gogor defendatu zuen bere burua, presidente gisa hainbat gai garrantzitsuetan japoniarrekin lankidetzan aritzeari uko egin ziola eta Wang Jingwei lagunari izan zion leialtasunagatik bakarrik jokatu zuela argudiatuz. Hala ere, traizio delituaz akusatu zuten, eta heriotza zigorra ezarri zioten. Bere patua lasai onartu zuen, esanez "laster elkartuko naiz Wang Jingwei-rekin hurrengo munduan". Chen fusilatu egin zuten Suzhoun, Jiangsu, 1946ko ekainaren 3an.