Osatu hurrengo esaldia: Eskola-ume gisa bere jaioterriko &lt;a href="Latin%20school"&gt;Latin eskola (eskola klasikoa / gramatikala) &lt;/a&gt; Kerner, fisikoki txikia eta ahula zena, aitaren gogortasuna eta ikaskideen bullying-a pairatzen zituen. Hala ere, bere kontrako izpirituak bere horretan jarraitu zuen, bere aitak 1779an Stuttgarteko Karlsschule (akademia militarra eta orokorra) elite-an onartua izan ondoren ere, iturri batek deskribatua "dukaren institutu ospetsu gisa, gobernuaren funtzionario leialak hornitzeko asmoa zuena, erdi barnetegia, erdi unibertsitatea". Beste ikasle batzuk Friedrich Schiller izan zen. Akademian egon arren, Kernerrek ez zuen sekula lortu intelektualki berak nahi zuena egitea. Akademiaren sortzailearen izenaren egunean, Württembergeko agure Karl Eugen dukearen hitzaldian, Kernerrek behartsuen ongizate-sistema bat ezartzeko eskatu zuen. Schillerrek akademiatik irten zen 1782an, antzerkian ibiltzearen alde, baina Kerner oraindik ikaslea zen 1789an. Frantziako Iraultza babesteko klub politiko bat sortu zuen akademian. Beste kide batzuen artean Christian Heinrich Pfaff eta Joseph Anton Koch zeuden. 1790eko uztailaren 14an ospakizun sekretu bat egin zuten
Bastilla erasotzea. Kernerrek eta bere lagunek egindako ekintza horiek eta antzeko beste batzuek Wurtemberg kontserbadorean erreakzio negatiboa eragin zuten herritarren artean eta bihotzean hartu zituzten Frantziako emigrante aristokraten artean. Lagunen laguntzarekin, Kernerrek bere ikasketak amaitzeko eta 1791ko Aste Santuan mediku titulua lortzeko disertazio bat idatzi zuen. Orain, bere bizitzako lehen maitasun serioarekin batera, Strasbourgera joan zen unibertsitatean medikuntza hobetu nahi zuelako aitzakian.