Johnson 15 urterekin erreklutatu zen, Armadako kide. Hasiera batean H konpainian izena eman zuen Ohioko 43. infanteriar erregimentuan. Erregimentuari XVI. Korpusaren agintea esleitu zitzaion, baina 1864ko udaberrian, Johnson XVII. Korpuseko Lehen Dibisiora transferitu zuten. Han, John W. Sprague jeneralaren agindupean zerbitzatu zuen. 1864ko maiatzaren 1ean, Johnsonen erregimentuak William Tecumseh Sherman jeneralaren armadarekin bat egin zuen Chattanoogan. Johnsonek parte hartu zuen lehen bataila, eta bertan supean izan zen, Decaturko bataila izan zen. Johnsonek zauri txiki bat izan zuen hankan, ezkerreko belaunaren gainean, Resacako guduan.
-Ez da izango. Johnsonek, hala ere, Dallaseko guduan, Kennesaw mendiko guduan eta Peachtree Creekeko guduan parte hartu zuen. Atlanta erori ondoren, Johnson Sprague jeneralaren laguntzaile izan zen, gerra amaitzean kaleratu arte. Gerra ostean, Johnson Lorain konderrira itzuli zen, Ohiora.