1861eko martxoan, Ferguson kapitain izendatu zuten Hego Carolinako milizian, ondoren teniente izendatu zuten eta SS Armadako brigadier-generalaren laguntzaile P. G. T. Beauregard. Fort Sumter-en Robert Anderson AEBetako armadako maiorraren errendizio formala jaso zuen ofizialetako bat izan zen, lehen Estatu Konfederatuen bandera altxatu zuen eta lehenengo guardia jarri zituen Fort Sumter-en. Setioaren ondoren, etsaiaren tiro batek jotako lehen bandera konfederatua konfederatuen estatuen behin-behineko kongresuan aurkezteko bidali zuten. Teniente koronela eta Beauregard jeneralaren laguntzailea izan zen Shilohko guduan.
-Ez da izango. Farmingtongo guduan, Mississippi zalditeriako 28. erregimentuan izan zen. Vicksburg defendatzen zuen bitartean unitatearen agintea hartu zuen, eta William T. Sherman eta David Porter komandantearen erasoak geldiarazten lagundu zuen.