Honnerrek entrenamendu-lan bat egin zuen, Ekialde Hurbilean Australiako entrenamendu-batailoi baten komandante gisa, eta 1941eko urrian bidali zuten. Honner 1942ko maiatzean itzuli zen Australiara. Bere emaztearekin berriz elkartu ondoren, teniente koronela izendatu zuten eta Papura bidali zuten, non 39. batailoiaren agintea eman zioten, Kokoda errepidean zehar borrokatzen ari ziren indar japoniarren aurkako kanpaina desesperatu batean parte hartu zutenak.
-Ez da izango. Honner 1942ko abuztuaren 16an iritsi zen, Japoniako aurrerapena Isuravan geldiarazteko aginduekin. Batailoiaren posiziora iritsitakoan, Honnerrek aurkitu zuen bere aginte berria dagoeneko gaixotasun tropikalek eta aurreko borrokek ahulduta zegoela eta askoz gutxiago zela.