Gerra ostean, Ančerl-ek Radio Pragan zuzendu zuen 1950 arte, Txekiar Filarmonikoaren zuzendari artistikoa bihurtu zenean, hamazortzi urtez arrakastaz bete zuen kargua. Jarraian
1968an Txekoslovakiako inbasioan, Ančerl Torontora emigratu zen, Kanadara, eta bertan Torontoko Orkestra Sinfonikoaren musika zuzendari gisa lan egin zuen 1973an hil zen arte.