Okinawa berreskuratu ostean, Hirugarren flota Japonian barrena abiatu zen. 1945eko uztailaren 10etik 29ra, "Merrimack"ek indar handiko erasoak egin zituen Japoniako helburuen aurka, gerraren amaiera azkartu zuena. Jarraitzen
Japoniak 1945eko abuztuaren 15ean kapitulatu ondoren, "Merrimack" ontziak hainbat bidaia egin zituen Estatu Batuetako mendebaldeko kostaldearen eta Ekialdeko Asiaren artean, Japonia okupatzen laguntzen zuten itsasontzientzat petrolioa eramaten. Itsas garraio zerbitzu militarrera (MSTS) esleitu zuten 1949ko urrian, inaktibazio aurreko konponketa hasi baino lehen. Merrimack 1950eko otsailaren 8an itxi zen eta Atlantikoko Erreserbako Flotan sartu zen Orange-en, Texasen.