Gerraren ondoren, Ančerl-ek Praga Irratirako zuzendari izan zen 1950era arte, orduan Txekiar Filarmonikoaren zuzendari artistikoa bihurtu zen, hamazortzi urtez arrakastaz bete zuen kargua. Txekoslovakiako 1968ko inbasioaren ondoren
1973an hil zen arte, Torontoko Orkestra Sinfonikoaren musika zuzendari gisa lan egin zuen.