Juntaren ordezkari gisa, Paraguaieko kanpaina zoritxarrekoaren buru izan zen. Bere tropak Bernardo de Velascok garaitu zituen Campichuelo eta Paraguaríko guduetan.
-Ez da izango. Garaitua izan bazen ere, kanpainak Paraguaiko Independentzia 1811ko maiatzean ekarri zuen gertaera-kateari hasiera eman zion. Rosario ingurura erretiratu zen, Uruguay ibaiaren ekialdeko banda batetik eraso errealista baten aurka gotortzeko. Han, Argentinako bandera sortu zuen. Lehen Triunviratuak ez zuen bandera onartu, baina komunikazio motela zela eta, Belgrano aste batzuk geroago jakin zuen, Jujuy-n Iparraldeko Armada indartzen ari zela. Bertan, Peruko Goialdetik zetorren armada errealistaren aurka desabantaila estrategikoan zegoela jakinda, Belgrano Jujuy Exodusa agindu zuen, Jujuy probintziako biztanle guztiak San Miguel de Tucumanera ebakuatu zituena. Tucumáneko guduan egindako kontraerasoak garaipen estrategiko garrantzitsu bat ekarri zuen, eta laster Pío Tristánen armada errealistaren aurkako garaipen osoa izan zuen Salta-ko guduan. Hala ere, Peruko Goialdean egindako sarekadak Vilcapugio eta Ayohumako porrotetara eraman zuen, eta Bigarren Triunviratuak José de San Martín iritsi berriak Iparraldeko Armadaren Komandante gisa ordezkatu zuen. Ordurako, Asamblea del Año XIII-k Belgrano-ko bandera gerra-bandera nazional gisa erabiltzea onartu zuen.