1855eko abenduaren 18an, Stephenson Royal Navy-n sartu zen, "St Jean d'Acre" HMS-n kadete itsasoko bat bihurtuz, bere osaba Henry Keppel-ek aginduta, eta Itsaso Beltzean zerbitzatuz Krimeako Gerran. 1856ko irailetik 1857ko apirilera bitartean, Stephensonek Keppel-en agindupean lan egin zuen "Raleigh" ontzian kadete gisa, Ekialdeko Indietan eta Txinan, Bigarren Anglo-Txinako Gerran.
Baina bere espazio-ontzia Macaotik gertu galdu zen. Eskifaia salbatu egin zen. 1857ko ekainean HMS "Pearl" itsasontzian zerbitzatu zuen, "Pearl" itsas brigadan 1857ko Indiako Matxinadan. 1861eko ekainean teniente izendatu zuten HMS "Emerald" ontzian, Kanal Eskuadran zerbitzatuz.