Com a delegat de la Junta, va liderar la malaurosa campanya al Paraguai. Les seves tropes van ser derrotades per Bernardo de Velasco a les batalles de Campichuelo i Paraguarí
- No. Tot i que va ser derrotat, la campanya va iniciar la cadena d'esdeveniments que va conduir a la Independència del Paraguai el maig de 1811. Es va retirar a les proximitats de Rosario, per fortificar-la contra un possible atac realista de la banda oriental del riu Uruguai. Allà va crear la bandera de l'Argentina. El Primer Triumvirat no va aprovar la bandera, però a causa de la lentitud de les comunicacions, Belgrano només s'assabentaria d'això moltes setmanes més tard, mentre reforçava l'Exèrcit del Nord a Jujuy. Allà, sabent que estava en desavantatge estratègic contra els exèrcits reialistes provinents de l'Alt Perú, Belgrano va ordenar l'Exode de Jujuy, que va evacuar tota la població de la província de Jujuy a San Miguel de Tucumán. La seva contraofensiva a la Batalla de Tucumán va resultar en una victòria estratègica clau, i aviat va ser seguida per una victòria completa sobre l'exèrcit realista de Pío Tristán a la Batalla de Salta. No obstant això, les seves incursions més profundes a l'Alt Perú van conduir a derrotes a Vilcapugio i Ayohuma, fent que el Segon Triumvirat ordenés la seva substitució com a Comandant de l'Exèrcit del Nord pel recentment arribat José de San Martín. En aquell moment, l'Asamblea del Año XIII havia aprovat l'ús de la bandera de Belgrano com a bandera de guerra nacional.