El Ministeri va ser creat originalment com "Ministeri Imperial i Reial de l'Interior", servint com el ministeri de l'interior de l'imperi d'Àustria-Hongria. Va ser succeït per l'"oficina estatal de l'Interior" ("Staatsamt des Innern") de la Primera República el 1918, i més tard va ser renomenat en "Ministeri Federal de l'Interior". Després de la dissolució de l'Alemanya nazi el 1945
el Ministeri es va restablir en la seva forma actual.