Després de la guerra, després d'un breu retorn al periodisme, Young va tornar al Servei Secret d'Intel·ligència (SIS) com a cap de la seva estació de Viena, on va estar involucrat en l'ús d'agents al sud-est d'Europa. El 1949 va ser nomenat cap de la secció de requisits econòmics del SIS (R6), el seu punt de contacte amb el Tresor, la Cambra de Comerç i el Banc d'Anglaterra. El 1951 va ser nomenat controlador de les operacions del SIS a la "zona de l'Orient Mitjà" que s'estenia des de Marroc a l'Afganistan fins a Etiòpia. Aquí es va implicar en la implementació de la decisió anglo-americana per eliminar el líder iranià Mossadeq i restablir el Xà
- No. Segons Cavendish, el Xà va dir més tard de Young que "en temps de crisi és un home que pot prendre decisions i tirar la precaució als vents. Young és un home que creu que l'amistat és de doble sentit i que Gran Bretanya ha de mantenir als seus amics fins i tot en el risc d'ofendre a altres". El 1953 Young va ser cridat a Londres per assumir el càrrec de director de requisits del SIS i el 1956, durant la crisi de Suez, va ser posat de nou a càrrec de les operacions de l'Orient Mitjà. El 1959 va ser nomenat vicecap del Servei Secret. La seva insatisfacció amb el govern de Macmillan el va portar a dimitir com a diputat del MI6 el 1961 i entrar a la banca comercial.