Completa la següent frase: Nakajima va ser retingut per Williams per a la temporada 2009. En el Gran Premi d'Austràlia de 2009 va caure contra la paret a la curva sis, deixant-lo fora de la cursa. Nakajima va ser l'únic pilot a retirar-se a Bahrain, parant cinc voltes abans del final amb petroli sobreescalfat. També va caure en la penúltima volta del Gran Premi de Mònaco mentre corria en el 10è lloc. Va estar a punt de marcar en diversos Grans Premis, incloent-hi perdre un punt després de ser retardat en el pit lane al Gran Premi de Turquia. En el Gran Premi de Gran Bretanya, Nakajima va aconseguir la seva millor posició en la parrilla de la Fórmula 1, classificant-se en un impressionant cinquè lloc per davant del líder del campionat mundial Jenson Button. No obstant això, la seva cursa va ser compromesa per una mala estratègia de pit, i finalment va acabar fora dels punts. Nakajima una vegada més gairebé va marcar a la
Gran Premi d'Hongria, acabant només 0.7 segons darrere del vuitè Jarno Trulli. Va acabar novè de nou a Singapur. Al Brasil Nakajima va estar una vegada més en lluita pels punts fins que va ser eliminat pel novell i compatriota Kamui Kobayashi. Nakajima va acabar la temporada sense marcar punts, amb el seu company d'equip Nico Rosberg sent el responsable de cada punt del campionat aconseguit per l'equip de Williams, amb Nakajima sent l'únic no puntejador dels pilots que van participar en cada cursa el 2009.