La implementació de la constitució de la Federació de Malàisia basada en les Propostes Constitucionals Revisades l'1 de febrer de 1948 i la decisió del MCP de llançar una rebel·lió armada va marcar el començament del final per a la coalició PUTERA-AMCJA i AMCJA en el seu conjunt. Amb la declaració d'emergència nacional
, les organitzacions constituents es van retirar de la coalició, van anar a la clandestinitat, o en el cas de la MDU, es van dissoldre voluntàriament i l'AMCJA va deixar d'existir com a cos.