Escriure una continuació per a aquest paràgraf - Ja debilitat durant el segle XVIII, a mitjans de la dècada de 1790, la Mancomunitat Polonesa-Lituana havia estat dividida dues vegades pels seus veïns: Rússia, l'imperi Habsburg i Prússia. El 1791, l'emperador austríac i del Sacre Imperi Romà, Josep II, va canviar l'estat de Kazimierz com una ciutat separada i la va convertir en un districte de Cracòvia. Les famílies jueves més riques van començar a marxar. No obstant això, a causa de la prohibició de viatjar el dissabte, la majoria de les famílies jueves es quedaven relativament a prop de les sinagoges històriques. El 1794, Tadeusz Kościuszko va iniciar una insurrecció sense èxit
en la plaça principal de la ciutat que, malgrat la seva victoriosa Batalla de Racławice contra un exèrcit rus superior en nombre, va resultar en la tercera i última partició de Polònia. El 1809, Napoleó Bonaparte va capturar els antics territoris polonesos d'Àustria i va fer de la ciutat part del Ducat de Varsòvia. Després de la derrota de Napoleó, el Congrés de Viena de 1815 va restaurar els límits d'abans de la guerra, però també va crear la ciutat lliure parcialment independent de Cracòvia. Una insurrecció el 1846 va fracassar, el que va resultar en la annexió de la ciutat per Àustria sota el nom de Gran Ducat de Cracòvia (, ).