Inicialment, l'Assemblea Nacional no es va inaugurar, ja que el president Yahya Khan i el president del PPP, Zulfikar Ali Bhutto, no volien un partit del Pakistan Oriental en el govern federal. En lloc d'això, Yahya va nomenar el veterà polític bengalí Nurul Amin com a primer ministre, demanant-li que arribés a un compromís entre el PPP i la Lliga Awami. No obstant això, aquest moviment va fracassar ja que el retard en la inauguració ja havia causat disturbis significatius al Pakistan Oriental. La situació va escalar en una guerra civil.
que va conduir a la formació de l'estat independent de Bangladesh. L'Assemblea va ser inaugurada el 1972 després que Yahya renunciés i donés el poder a Zulfikar Ali Bhutto. Bhutto va esdevenir primer ministre el 1973 després que el càrrec fos recreat per una nova constitució.