L'hospital va ser creat com l'Hospital Reial per a Mariners a Greenwich per instruccions de la reina Maria II, que s'havia inspirat en la vista de mariners ferits que tornaven de la Batalla de La Hogue.
el 1692. Va ordenar que l'ala del rei Carles del palau, originalment dissenyada per l'arquitecte John Webb per al rei Carles II el 1664, fos remodelada com a hospital naval per proporcionar una contrapartida per a l'hospital de Chelsea per als soldats. Sir Christopher Wren i el seu assistent Nicholas Hawksmoor van donar els seus serveis de forma gratuïta com a arquitectes del nou Hospital Reial. Sir John Vanbrugh va succeir a Wren com a arquitecte, completant el complex als plans originals de Wren.