Completa la següent frase: Enlistant-se en l'Exèrcit Confederat l'abril de 1861, Kennedy es va convertir en capità de la Companyia E, 2n Regiment d'Infanteria de Carolina del Sud, sota el col. Joseph Brevard Kershaw, resident de Camden. A la Primera Batalla de Manassas, va ser colpejat per una pilota de Minie i va resultar greument ferit. Recuperant-se, va ser ascendit a coronel quan Kershaw va ser ascendit a general de brigada. La primera acció de Kennedy al comandament d'un regiment va tenir lloc en una escaramuça a la carretera Nine-Mile Road prop de Richmond, Virginia, el juny de 1862 durant la Campanya de la Península. Després de lluitar a la
Batalla de l'Estació Savage, va quedar inhabilitat durant diverses setmanes per la febre. Va tornar al seu regiment a temps per a la Campanya de Maryland. Durant la invasió de Stonewall Jackson a Harpers Ferry, Kennedy va ser amb la brigada de Kershaw en la captura de l'important Maryland Heights. Va dirigir el seu regiment en el contraatac de Kershaw durant la Batalla d'Antietam, conduint una part del II Cos de la Unió davant seu. No obstant això, va caure dolorosament ferit en la primera càrrega, va ser colpejat en el peu i el tendó d'Aquil·les mentre creuava una tanca de fusta al llarg de Hagerstown Pike. Una vegada més, recuperant-se a temps per a una gran batalla, Kennedy va dirigir el 2n i el 8n de Carolina del Sud al suport del general Howell Cobb a Marye's Heights, el focus de la lluita més calenta a Fredericksburg.