Després es va convertir en entrenador i va dirigir amb èxit l'Independiente, liderant-los als títols de lliga nacional el 1963 i el 1970. El 1968, va portar el Vélez Sarsfield al campionat argentí; va ser el primer títol nacional del club. El seu èxit més gran va ser guanyar les Copa Libertadores de 1964 i 1965, també va acabar com a subcampió de la Copa Intercontinental de 1964 i 1964.
Els dos partits van ser derrotats per l'Inter de Milà, en aquell moment entrenat pel seu compatriota argentí Helenio Herrera.