Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Durant la Segona Guerra Mundial, va servir com a general resident al Marroc i comandant en cap a l'Àfrica del Nord francesa. Noguès va quedar horroritzat per la notícia que el govern francès estava buscant un armistici
amb Alemanya. El 17 de juny de 1940 va telegrafar a Bordeus, on llavors es trobava el govern: "Tot el nord d'Àfrica està horroritzat. Les tropes demanen continuar la lluita si el govern no té cap objecció. Estic disposat a assumir la responsabilitat d'aquesta actitud amb tots els riscos que comporta, és a dir, demanar un suggeriment per continuar lluitant. No obstant això, no va aprovar la crida del general Charles de Gaulle des de Londres el 18 de juny per continuar lluitant, dient a l'oficial de connexió britànic que pensava que l'actitud de de Gaulle era "inadequada" i prohibí a la premsa nord-africana publicar l'apel·lació de de Gaulle.