Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Rebić es va unir a l'Eintracht Frankfurt en un préstec d'una temporada l'11 de juliol de 2016, reunint-se amb l'ex entrenador de l'equip nacional Niko Kovač. Després d'una curta batalla contra la mononucleosi, Rebić va debutar el 17 de setembre contra el Bayer Leverkusen, entrant com a substitut i ajudant a Marco Fabián per al gol guanyador en una victòria de 2-1. El 5 de febrer de 2017 va marcar el seu primer gol per al seu nou equip per concloure una victòria de 2 a 0 sobre l'equip de Hesse SV Darmstadt 98 a la Commerzbank Arena. El 27 de maig, va igualar a la final de la DFB-Pokal de 2017.
, tot i que Frankfurt va perdre 2 a 1 contra el Borussia Dortmund.