Escriu una continuació per a aquest paràgraf - El 1966 Whetton va participar en els Jocs Europeus d'Indoor i va guanyar la seva primera gran medalla d'or quan va guanyar la cursa per gairebé tres segons sobre el segon Oleg Rayko. Whetton va aconseguir mantenir el títol europeu d'interior durant els dos anys següents, a Praga
i Madrid. Whetton va representar de nou Gran Bretanya en la competició d'altitud que va influir en els Jocs Olímpics d'estiu de 1968 a Ciutat de Mèxic, i de nou es va qualificar per a la final. A la final, Whetton va acabar cinquè, tot i que quatre segons fora de les places de la medalla. La seva última gran medalla va ser en el Campionat d'Europa d'Atletisme de 1969 quan va guanyar els 1500 metres a Atenes. En una final estreta, Whetton va vèncer a l'irlandès Francis Murphy per prendre l'or.