La família es va traslladar a la ciutat de Nova York el 1940. L'any següent, Eisuke va ser transferit de Nova York a Hanoi, i la família va tornar al Japó. Ono es va matricular a Keimei Gakuen, una escola primària cristiana exclusiva dirigida per la família Mitsui. Va romandre a Tòquio durant tota la Segona Guerra Mundial i el gran bombardeig de foc del 9 de març de 1945
, durant el qual es va refugiar amb altres membres de la família en un bunker especial al districte Azabu de Tòquio, lluny dels bombardejos pesats. Ono més tard va anar a la localitat de muntanya de Karuizawa amb membres de la seva família.