En 1986, Colón de Carvajal i el seu conductor personal van ser assassinats pel grup separatista basc Euskadi Ta Askatasuna (ETA), que havia obert foc contra el cotxe en el qual viatjaven i havia llançat una granada de mà dins, prop del Paseo de la Castellana a Madrid, Espanya. Amb l'assassinat de Carrero Blanco
El 1973, va ser la figura més destacada assassinada per l'organització.