Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Es va unir a la Força Aèria Sudanesa el 1973,.Hussein es va graduar a la prestigiosa Universitat de Cranfield al Regne Unit amb un màster en enginyeria aeronàutica el 1982. Va jugar un paper important en el cop d'estat sudanès de 1989.
, i després, el 1990, va esdevenir secretari general del Consell de Comandament Revolucionari per a la Salvació Nacional; l'autoritat governant del Sudan entre 1989 i 1993.