L'emperador Frederic II va nomenar un partidari local, el canónic de Bamberg, Enric de Bilversheim, bisbe. El bisbe Enric es va convertir en el primer príncep-bisbe; sota el seu govern, la diòcesi es va convertir gradualment en un principat territorial, i els seus bisbes van prendre la precedència secular després dels arquebisbes de Maguncia Des de prop de 1305, el castell d'Altenburg va ser utilitzat com a residència secundària. El 1390 l'església de Lamprecht, ex-canceller de l'emperador Carles V, també va adquirir la fortalesa de Giechburg. A principis del segle XV es van produir ferots conflictes amb els hussites
rebel·les, així com amb els ciutadans de Bamberg. Bisbe Heinrich Groß von Trockau (m. 1501) va entrar en diversos combats amb el príncep Hohenzollern Casimir de Brandenburg-Bayreuth.