Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Napoleó Bonaparte, quan es va convertir en Primer Cónsul el 1801, va signar un Concordat amb el Papa, acceptant restaurar les propietats de l'església anterior, incloent el Panteó. El Panteó estava sota la jurisdicció dels canons de la Catedral de Notre Dame de París. Celebracions d'esdeveniments importants, com la victòria de Napoleó a la Batalla d'Austerlitz
, es van celebrar allà. No obstant això, la cripta de l'església va mantenir la seva funció oficial com a lloc de descans per a il·lustres francesos. Es va crear una nova entrada directament a la cripta a través del porxo oriental (1809<unk>1811). L'artista Antoine-Jean Gros va ser encarregat de decorar l'interior de la cúpula. Combinava els aspectes seculars i religiosos de l'església; mostrava a la Geneviève conduïda al cel per àngels, en presència de grans líders de França, des de Clodoveu I i Carlemany fins a Napoleó i l'emperadriu Josepina.