Amb l'entrada del Japó a la guerra al desembre de 1941, la Campanya de Malàisia i la caiguda de Singapur, la situació estratègica va empitjorar significativament. 7 El general Coy va ser cridat al servei de temps complet a Austràlia el maig de 1942. Més tard, 7 Fld Coy va ser re-gazetted com una unitat AIF. La unitat va servir a Papua Nova Guinea i va lluitar contra els japonesos al llarg del Kokoda Track
i a Bougainville fins al final de la guerra.