Les forces alemanyes van envair de nou el país el maig de 1940, i 40.690 belgues, més de la meitat d'ells jueus, van ser assassinats durant l'ocupació posterior i l'Holocaust. Des de setembre de 1944 fins a febrer de 1945 els aliats van alliberar
Bèlgica. Després de la Segona Guerra Mundial, una vaga general va obligar al rei Leopold III a abdicar el 1951, ja que molts belgues van pensar que havia col·laborat amb Alemanya durant la guerra. El Congo belga va obtenir la independència el 1960 durant la Crisi del Congo; Ruanda-Urundi va seguir amb la seva independència dos anys més tard. Bèlgica es va unir a l'OTAN com a membre fundador i va formar el grup de nacions Benelux amb els Països Baixos i Luxemburg.