Després de tornar d'Espanya, on també va obtenir una llicència d'entrenador nacional, Cutillas va ser nomenat entrenador en cap de l'equip nacional filipí a finals de 1967, succeint Emilio Pacheco. Entre els seus resultats amb l'equip nacional en el seu primer període va ser la victòria per 2-1 sobre el club americà Dallas Tornado a casa el 1968 amb pràcticament la mateixa selecció que va jugar en el rècord de 0<unk>15 perdut contra el Japó en els qualificatius olímpics asiàtics. També va entrenar l'equip filipí que va participar en el Campionat de Joventut de l'AFC de 1968. Les Filipines van arribar als quarts de final, el seu millor resultat en el torneig. Florentino Broce va assumir com a entrenador en cap de l'equip nacional de 1993 a 1994. El mal rendiment de l'equip nacional als Jocs Asiàtics de 1974
va fer que l'Associació de Futbol de les Filipines nomenés de nou a Cutillas. Cutillas va ser entrenador fins al 1978.