Weir i Lysacek havien dominat els Nacionals dels EUA durant els cinc anys anteriors, però el 2009
, Jeremy Abbott, que havia guanyat a la final del Gran Premi el desembre, va trencar aquest domini i va guanyar la medalla d'or. Weir no estava preparat per als Nacionals perquè estava "compromès" per la seva malaltia. En el programa curt, Abbott va acabar en primer lloc amb 86,40 punts, Lysacek va ser segon amb 83,59 punts, i Weir va arribar en setè lloc amb 70,76 punts. La puntuació general d'Abbott va ser la millor personal de 237,72 punts, quatre punts més que les millors puntuacions personals de Weir i Lysacek. Va ser el resultat més baix de Weir en el programa curt com a patinador sènior en un Nacional en la seva carrera.