Durant la crisi política tailandesa del 2013 al 2014, Prayut va intentar portar els partits rivals a un acord. Quan això va fracassar, va organitzar un cop d'estat.
contra el govern de transició de Yingluck Shinawatra el 22 de maig de 2014. La mateixa Yingluck ja havia estat destituïda del seu càrrec el 7 de maig pel Tribunal Constitucional, sobre la controvertida transferència d'un oficial de seguretat superior el 2011, i Niwatthamrong Boonsongpaisan actuava en el seu lloc. Després del cop d'estat, Prayut va abrogar la constitució de 2007 i va establir el NCPO per governar la nació, amb ell mateix com a cap. Prayut va reprimir ràpidament la dissidència. Va posar controls als mitjans de comunicació, va imposar la censura d'Internet, va declarar un cop d'estat a tot el país (levant-se 3 setmanes després), va prohibir les reunions de cinc o més persones i va arrestar tant polítics com activistes contra el cop, alguns dels quals van ser acusats de sedició i jutjats en tribunals militars. Aquestes restriccions a la llibertat d'expressió es van justificar sobre la base de la promoció de la reconciliació nacional.