Francken va ser nomenat secretari d'Estat per a l'asil i la migració en el primer gabinet de Charles Michel el 2014, on es va fer prominent per la seva controvertida aproximació de tolerància zero a la immigració il·legal enmig de la crisi migratòria europea.
- No. Francken i l'N-VA es van oposar al suport de Bèlgica al Pacte Global per a la Migració, el que els va portar a sortir del govern de coalició al desembre de 2018 i, per tant, va provocar el seu col·lapse.