El 2005 no va ser un any fantàstic per a Groot amb un 4è lloc en els 4×100 m estil lliure i un 9è en els 50 m papallona durant els Campionats del Món d'Aquàtica de 2005 a Montreal, Quebec, Canadà. Al final de l'any va guanyar la medalla d'or per tercera vegada consecutiva en els 4 × 50 m d'estil lliure al Campionat Europeu de Natació de Curta Cursa 2005. El 2006 va començar amb els Campionats del Món de Cursa Corta de la FINA de 2006 a Xangai. Juntament amb Inge Dekker, Hinkelien Schreuder i Marleen Veldhuis, Groot va establir un rècord mundial i va guanyar una medalla d'or en el releu de 4×100 m d'estil lliure en un temps de 3:33.32. A l'estiu va participar en el Campionat d'Europa d'Aquàtica de 2006
a Budapest, Hongria, on va afegir una medalla de plata, en els 4×100 m estil lliure amb Dekker, Veldhuis i Ranomi Kromowidjojo, i una medalla de bronze, per quarta vegada en la seva carrera, en els 50 m papallona a la seva impressionant col·lecció de medalles. A Helsinki va guanyar una medalla de plata en els 4 × 50 m d'estil lliure en el Campionat Europeu de Natació de Curta Cursa 2006. El seu següent gran torneig va ser el Campionat Mundial d'Aquàtica de 2007 a Melbourne, Austràlia, on va ser eliminada de l'equip de 4×100 m estil lliure per la seva companya d'equip Femke Heemskerk mentre era membre regular de l'equip en les finals durant tants anys. Individualment va acabar 13a i 20a en els 50 m i 100 m papallona fent-ho un torneig decebedor per a Groot. Un cinquè lloc en el Campionat Europeu de Natació de Cursa Corta 2007 va ser el seu millor resultat d'un any decebedor.