En les primàries republicanes de 2016, Estrosi també va donar suport a Sarkozy com a candidat del partit per a les eleccions presidencials franceses de 2017. Deu mesos abans de les eleccions, ell i altres conservadors locals van criticar agressivament el ministre de l'Interior Bernard Cazeneuve per la força de la presència de la força policial nacional la nit de l'atac de camió de Niça de 2016.
- No. Enmig de l'assumpte de Fillon, el març de 2017, Estrosi es va unir a Xavier Bertrand, Valérie Pécresse i altres per demanar que Alain Juppé substituís a François Fillon com a candidat del partit. També es va reunir amb Emmanuel Macron durant la seva campanya.