Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Després d'això, Honner va assumir un paper d'entrenament, servint com a oficial comandant d'un batalló d'entrenament australià a l'Orient Mitjà, al qual va ser enviat a l'octubre de 1941. Honner va tornar a Austràlia el maig de 1942. Després de reunir-se breument amb la seva dona, va ser ascendit a tinent coronel i enviat a Papua, on li va ser donat el comandament del 39è Batalló, que estava involucrat en una campanya desesperada contra les forces japoneses que lluitaven al llarg de la pista de Kokoda.
- No. Amb instruccions per aturar l'avanç japonès a Isurava, Honner va arribar el 16 d'agost de 1942. En arribar a la posició del batalló, Honner va trobar que el seu nou comandament ja estava esgotat per les malalties tropicals i pels combats anteriors i era molt inferior en nombre.