En F1, després del seu prometedor començament l'any anterior, 1966 va ser un mal any per a Stewart; els H16 BRM de 3 litres no eren fiables, tot i que Stewart va guanyar el Gran Premi de Mònaco en un cotxe de 2 litres. L'esdeveniment més significatiu d'aquell any va ser el seu accident al Gran Premi de Bèlgica
a Spa-Francorchamps, el que va provocar la seva campanya per millorar la seguretat en la F1 i el va fer perdre el Gran Premi de França a Reims.