Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Quan les notícies de la Guerra Civil van arribar a Minnesota, Bloomer i els seus cosins es van unir a la Guàrdia de Stillwater, un grup de milícia local. Els Guàrdies van ser reclutats en el Primer Regiment d'Infanteria Voluntària de Minnesota a Fort Snelling el 29 d'abril de 1861, formant el nucli de la Companyia B. Bloomer va rebre inicialment el rang de caporal i va participar en tots els principals enfrontaments del regiment fins a la Batalla d'Antietam. Va ser ferit lleugerament al cap a la Batalla de Bull Run. Durant la Batalla de l'Estació Savage
El 29 de juny de 1862, que va ser part de la Campanya de la Península, Bloomer va ser ascendit a sergent de color. Enmig de l'enfrontament, el portador de l'estendard va morir. Bloomer va prendre els colors, i va ser separat del regiment durant cinc hores. Va tornar els colors al regiment i va ser ascendit per la seva valentia.