Morales va ser enviat primer a la unitat de Cámus, el 3r Regiment de la Línia, que va estar al front de les campanyes de Xile durant gran part de la guerra. Tot i que oficialment no era una soldat i no se suposava que participés en combat, això no la va dissuadir de lluitar al costat dels homes del seu regiment. De fet, era coneguda per la seva gran habilitat amb el rifle. Va lluitar en l'aterratge amfibia i l'assalt feroç que va seguir a una posició peruana de la Batalla de Pisagua el 2 de novembre de 1879 i a la Batalla de San Francisco.
el 19 de novembre. Els homes de la seva unitat la admiraven per la seva cura desinteressada dels ferits després de les batalles. També es va posar en risc diverses vegades per salvar soldats peruans capturats de ser maltractats pels seus compatriotes.