Va tornar a Norfolk per a reparacions l'1 de gener de 1847, després va arribar a Veracruz el 21 de març de 1847, portant Perry per prendre el comandament de la flota nord-americana. De seguida ella i els seus homes es van llançar en operacions amfibes contra Veracruz.
, subministrant canons i les seves tripulacions per ser portades a terra per a la bateria que va lluitar contra la ciutat per rendir-se en quatre dies. Durant la resta de la guerra, el "Mississippi" va contribuir amb armes, homes i vaixells a una sèrie de atacs costaners a la costa est de Mèxic, participant en la captura de Tabasco el juny de 1847.