Uganda va debutar als Jocs Paralímpics d'estiu de 1972 a Heidelberg, Alemanya Occidental. Després de competir als Paralímpics de Toronto de 1976, van estar absents dels Paralímpics d'Estiu fins als Jocs d'Atlanta de 1996
, i han participat en tots els Jocs Paralímpics d'Estiu des de llavors. Aquests Jocs de Rio de Janeiro van ser la vuitena aparició de la nació en una Paralímpia d'Estiu. Uganda no havia guanyat la seva primera medalla paralímpica abans de l'edició de Rio de Janeiro. Els Jocs Paralímpics d'estiu de 2016 es van celebrar del 7 al 18 de setembre de 2016 amb un total de 4.328 atletes que representaven 159 Comitès Paralímpics Nacionals que van participar. L'atlètic David Emong va ser l'únic competidor d'Uganda a Rio de Janeiro. Tres altres atletes, Christine Akullo, Emmanuel Vukoja i Bashir Bwanga, no van poder formar part de l'equip a causa de que van perdre les seves últimes jornades de qualificació. Emong va ser escollit com a portador de la bandera per a la desfilada de nacions durant la cerimònia d'obertura.