Escriure una continuació per a aquest paràgraf - A principis de 1863, el regiment va ser transferit al Gran Riu Negre, on va vigilar un pont. Al març, el regiment es va traslladar a Grand Gulf, Mississippi, on els homes van construir fortificacions, reforçant les defenses de Vicksburg, Mississippi. El 5 d'abril, el 3r Missouri Infantry, com a part d'una força més gran, va ser traslladat a través del riu Mississipí a Louisiana, on van acampar prop de Bayou Vidal a Tensas Parish. El 8 d'abril, la unitat va lluitar en una petita acció a la plantació de James a prop. Un intent de la força de reconeixement per fer un gran cop contra les forces de la Unió que ocupaven la zona el 15 d'abril va fracassar quan es va perdre l'element de sorpresa per a un atac planificat. El 17 d'abril, l'arribada de vaixells de la Marina de la Unió va forçar els confederats a tornar a Mississipí. El regiment es va unir a les defenses a Grand Gulf. A la Batalla del Gran Golf
El 29 d'abril, el 3r de Infanteria de Missouri va defensar una línia de fossos de fusells que s'estenia entre les dues principals fortificacions confederades. La posició de la unitat va permetre als homes disparar a les portelles dels vaixells de la Marina de la Unió que bombardejaven la posició confederada. El regiment va perdre un home mort i tres ferits en la batalla. La victòria confederada va impedir que el major general de la Unió Ulysses S. Grant desembarqués una força en aquest punt, tot i que Grant va poder desembarcar una força forta al sud de la posició. El general de brigada John S. Bowen, el comandant confederat a Grand Gulf, va respondre al desembarcament de la Unió enviant una força a Port Gibson, Mississipí per interceptar Grant.