Escriu una continuació per a aquest paràgraf - En el moment en què Margaret, el seu fill i la seva nora (Anne) estaven preparats per seguir Warwick de tornada a Anglaterra, les taules s'havien tornat a girar en favor dels iorkistes, i el comte va ser derrotat i mort pel retorn del rei Eduard IV a la Batalla de Barnet
el 14 d'abril de 1471. Margarida va ser forçada a dirigir el seu propi exèrcit a la Batalla de Tewkesbury el 4 de maig de 1471, en la qual les forces de Lancaster van ser derrotades i el seu fill de disset anys, Eduard de Westminster, va morir. Les circumstàncies de la mort d'Eduard mai han estat aclarides; no se sap si va morir en la lluita real o va ser executat després de la batalla pel duc de Clarence. Durant els deu anys anteriors, Margaret s'havia guanyat una reputació d'agressivitat i crueltat, però després de la seva derrota a Tewkesbury i la mort del seu únic fill, es va trencar completament en l'esperit. Després de ser capturada per William Stanley al final de la batalla, Margaret va ser empresonada per ordre del rei Eduard. Va ser enviada primer al Castell de Wallingford i després va ser transferida a la Torre de Londres, més segura. Enric VI també va ser empresonat a la Torre després de Tewkesbury i va morir allà la nit del 21 de maig; la causa de la seva mort és desconeguda, encara que es sospitava de regicidi. El 1472 va ser posada sota la custòdia de la seva ex dama d'espera Alice Chaucer, duquessa de Suffolk, on va romandre fins que va ser rescatada per Lluís XI el 1475.