Escriu una continuació per a aquest paràgraf - El 2013, l'AFP va aconseguir aturar els atacs del Front de Lliberança Nacional Moro a la crisi de la ciutat de Zamboanga quan van llançar un atac per proclamar la independència de la República de Bangsamoro. El 2016, l'AFP es va enfrontar amb el grup Maute a Butig el febrer i el novembre de 2016. El 2017, l'AFP també es va enfrontar amb militants de l'ISIS a Marawi
, cridant al president Duterte per declarar la llei marcial sota la proclamació núm. 216.