Escriu una continuació per a aquest paràgraf - En el primer partit de la Serie A de la temporada 2011-12
, Milito va marcar dos gols en una derrota de 4 a 3 contra el Palerme. Després d'una actuació impressionant, Milito va tornar a la fitxa amb un gol el 24 de setembre contra el Bologna i el 2 de novembre, va registrar el seu gol número 200 amb el club en un partit de la Lliga de Campions guanyat 2 a 1 contra el Lille OSC.