Escriu una continuació per a aquest paràgraf - El 1282 Skopje va ser capturat pel rei serbi Stefan Milutin. Sota l'estabilitat política del govern de Nemanjić, l'assentament s'ha estès fora dels murs de la fortalesa, cap al turó de Gazi Baba. Es van construir esglésies, monestirs i mercats i comerciants de Venècia i Dubrovnik van obrir botigues. La ciutat es va beneficiar enormement de la seva ubicació propera al mercat europeu, de l'Orient Mitjà i africà. Al segle XIV, Skopje es va convertir en una ciutat tan important que el rei Stefan Dušan la va fer la capital de l'Imperi Serbi. El 1346, va ser coronat "Emperador dels serbis i grecs" a Skopje. Després de la seva mort, l'Imperi Sèrbi es va esfondrar en diversos principats que no van poder defensar-se contra els turcs. Skopje va ser primer heretat pel senyorat de Prilep i finalment va ser presa per Vuk Branković després de la Batalla de Maritsa
(1371) abans de formar part de l'Imperi Otomà el 1392.