De tornada a Guam, el 3r Batalló va començar a entrenar per desembarcar a Miyako Jima, una illa al sud d'Okinawa. Aquestes ordres van ser finalment cancel·lades, però el batalló encara va veure combat menor el 1945, participant en dues operacions a Guam dissenyades per capturar soldats japonesos que encara resistien a les muntanyes. Aquestes barrades van tenir lloc a l'abril i al desembre de 1945. El 3r Batalló també va començar a preparar-se per a l'Operació Olympic, on com a part del V Cos Amfibia, hauria aterrat a Kushikino, Kagoshima, a Kyūshū. Després del llançament de les bombes atòmiques a l'agost de 1945, i la rendició del Japó
El 3r Batalló va ser destacat de la 3a Divisió de Marines el novembre de 1945 i desactivat el mes següent el 20 de desembre de 1945. No obstant això, poc abans de ser desactivat, el 3r Batalló va patir el dubiós honor de ser l'últim nord-americà mort a la Segona Guerra Mundial, quan el PFC W.C. Patrick Bates de la Companyia Kilo va ser mortat per un franctirador japonès el 14 de desembre durant una operació de neteja a Guam (tres mesos després del final formal de les hostilitats).