Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Durant la guerra russojaponesa de 1904-1905, un combat naval, la Batalla de Korsakov, va tenir lloc fora de la ciutat a l'agost de 1904. El 1905, el Japó va conquerir Sakhalin.
en les últimes etapes de la guerra, i el sud de Sakhalina, incloent Korsakovsky, va ser lliurat al Japó el 1905 després de la derrota de Rússia en la guerra. Els russos van cremar la ciutat de fusta abans de la rendició. Sobre les cendres del Fort Korsakovsky, els japonesos van construir una ciutat moderna coberta de pedra amb carrers pavimentats i electricitat, rebatejant-la "Ōtomari" (大泊), una traducció de les paraules ainu "Poro-an-tomari" (grand port). La ciutat va ser temporalment la capital de la prefectura de Karafuto entre 1905 i 1907. Mentre que en mans japoneses la ciutat va créixer substancialment. Una colònia penal sota l'administració de Rússia, Ōtomari va mantenir la pràctica del treball forçat: els japonesos van portar milers de coreans ètnics a Ōtomari com a treballadors. La població coreana actual de Korsakov és descendent principalment d'aquests reclutes de treball.