Completa la següent frase: A l'inici de la Guerra Civil, Hays va tornar al servei com a coronel del 63r Regiment de Infanteria Voluntària de Pennsilvània, també amb el rang de capità del 16è Regiment d'Infanteria dels Estats Units en l'exèrcit regular des del 14 de maig de 1861. Els seus homes el coneixien per ser "tan valent com un lleó". Durant la Campanya de la Península, va ser adscrit amb el seu regiment a la primera brigada de la divisió de Kearny del III Cos d'Heintzelman. Va lluitar a les batalles de Yorktown, Williamsburg, Seven Pines,
L'estació Savage, i Malvern Hill. Al final de les Batalles dels Set Dies, va ser nomenat tinent coronel de brevet en l'exèrcit regular per valentia en acció, ja que Hays havia dirigit una càrrega de baioneta amb el seu regiment a les línies enemigues per cobrir la retirada de la seva brigada. Hays va anar breument en baixa per malaltia un mes més tard, patint ceguesa parcial i paràlisi del braç esquerre, lesions causades per la batalla.