Passage: Doom 3 està ambientat a l'any 2145. Gran part de la història i el diàleg del joc va ser creat per l'autor Matthew J. Costello. Segons la història del joc, la Union Aerospace Corporation (UAC) ha crescut fins a convertir-se en la major entitat corporativa existent, i ha establert una instal·lació de recerca a Mart. En aquesta base, la UAC és capaç de realitzar investigacions en diverses àrees científiques, incloent el desenvolupament d'armes avançades, la investigació biològica, l'exploració espacial i la teleportació. A Mart, la UAC pot realitzar les seves operacions fora dels límits legals i morals.
Matthew J. Costello