Mentrestant, la intel·ligència naval dels Estats Units havia comprovat que els japonesos planejaven un atac a l'illa de Midway, al Pacífic central. L'Almirall Chester Nimitz, Comandant en Cap de la Flota del Pacífic dels Estats Units, estava decidit a aprofitar l'oportunitat per enfrontar-los. Perdre Midway hauria estat una amenaça molt seriosa perquè els japonesos llavors podrien prendre fàcilment Hawaii i amenaçar la costa oest dels Estats Units. La pèrdua del seu almirall de portaavions més agressiu i experimentat en combat, Halsey, en la vigília d'aquesta crisi va ser un greu cop per a Nimitz. Nimitz es va reunir amb Halsey, que va recomanar al seu comandant de divisió de creuers, el contraalmirall Raymond Spruance, que assumís el comandament de l'imminent Midway
operació. Nimitz va considerar el moviment, però significaria passar per sobre del contralmirall Frank Fletcher de la Task Force 17, que era el superior dels dos homes. Després d'entrevistar a Fletcher i revisar els seus informes del combat del Mar de Coral, Nimitz estava convençut que l'actuació de Fletcher era sòlida, i se li va donar la responsabilitat del comandament en la defensa de Midway. Seguint les recomanacions de Halsey, Nimitz va nomenar al contraalmirall Spruance com a comandant de la Task Force 16 de Halsey, que comprenia els portaavions "Enterprise" i "Hornet". Per ajudar a Spruance, que no tenia cap experiència com a comandant d'una força de portaavions, Halsey va enviar el seu irascible cap d'estat major, el capità Miles Browning.