En 1462, el més ambiciós dels senyors de les illes, John MacDonald, va fer una aliança amb Eduard IV d'Anglaterra per conquerir Escòcia. Guerra civil a Anglaterra
va evitar que això tingués efecte i no fos descobert fins a 1475, quan la cort anglesa va revelar voluntàriament la seva existència. Les demandes de confiscació de la senyoria van seguir-se naturalment, però es van calmar quan Joan va renunciar a la majoria dels seus territoris continents. No obstant això, el nebot de John va llançar una incursió severa a Ross, però finalment va fracassar. Dos anys després de la incursió, el 1493, Jaume IV d'Escòcia va declarar la perdedoria del domini de les Illes, transformant el regne en una part intrínseca d'Escòcia en lloc d'una dependència.