Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Yamaguchi va tornar al Japó breument a finals d'abril per al manteniment de la seva flota. El juny de 1942, va ser assignat a l'operació Midway.
- No. Durant la batalla, el 6 de juny de 1942, Yamaguchi no va estar d'acord amb el comandant de la flota, el vicealmirall Chūichi Nagumo. Un avió de reconeixement va descobrir un portaavions nord-americà prop de Midway. En aquell moment, els avions japonesos estaven armats per a un segon atac a Midway, amb els bombarders de nivell "Kate" portant bombes en lloc de torpedos. Yamaguchi va demanar un atac immediat contra la nau dels EUA, amb els avions armats com eren, però Nagumo va decidir esperar fins que els avions haguessin estat rearmats. Poc després, avions portaavions americans van destruir tots els portaavions japonesos excepte el vaixell insignia de Yamaguchi "Hiryū". Yamaguchi va ordenar ràpidament dos atacs successius a "Yorktown" que el van paralitzar. "Hiryū" va ser destruït per avions de, a més d'alguns avions "Yorktown" orfes.