El 1943, Friedman es va unir a la Divisió d'Investigació de Guerra de la Universitat de Colúmbia (dirigida per W. Allen Wallis i Harold Hotelling), on va passar la resta de la Segona Guerra Mundial treballant com a estadístic matemàtic, centrant-se en problemes de disseny d'armes, tàctiques militars i experiments metal·lúrgics. El 1945, Friedman va presentar Ingressos de Pràctica Professional Independent (co-autor amb Kuznets i completat durant 1940) a Colúmbia com a tesi doctoral. La universitat li va concedir un doctorat el 1946.
El 1945