La temporada 2012/2013 va ser un any de gran èxit per a Lisowski, ja que es va classificar per a cinc tornejos de classificació, incloent el Campionat del Món, i va arribar a la seva segona final com a professional. El primer torneig que va arribar va ser l'Australian Goldfields Open vencent a Dave Harold i va perdre 2<unk>5 a Mark Davis en la primera ronda a Bendigo. No va poder classificar-se per als dos esdeveniments següents, però després va derrotar Chen Zhe i Joe Perry per presentar-se al Campionat del Regne Unit per primera vegada. En el seu partit contra Chen, Lisowski va fer el primer 147 en el joc competitiu de la seva carrera. A la primera ronda de l'esdeveniment a York, Lisowski va perdre 2 a 6 a Stuart Bingham. Lisowski va vèncer a Ian Burns i Jamie Burnett per qualificar-se per al China Open
i després va derrotar a Zhou Yuelong per avançar als últims 32. Va jugar contra el seu bon amic Judd Trump i va fer un break de 131 en la victòria de 5 a 3, abans de tornar de 2 a 4 per triomfar 5 a 4 contra Mark Davis i arribar al seu primer quart de final de classificació. No obstant això, aquesta vegada va ser Lisowski qui va deixar que un 4<unk>2 de lideratge s'esclatés quan va perdre 4<unk>5 a Shaun Murphy, amb Murphy declarant que el snooker havia vist el futur amb les actuacions de Lisowski durant la setmana.