La prosperitat del seu equip va continuar en la segona meitat de 2009, quan el Barcelona es va convertir en el primer club en aconseguir el sextuple, guanyant sis trofeus de primer nivell en un sol any. Després de les victòries a la Supercopa d'Espanya i la Supercopa de la UEFA
El 19 d'agost, el Barcelona va guanyar la Copa del Món de Clubs de la FIFA contra l'Estudiantes de La Plata el 19 de desembre, amb Messi marcant el gol guanyador de 2 a 1 amb el pit. Als 22 anys, Messi va guanyar el Ballon d'Or i el premi del Jugador Mundial de l'Any de la FIFA, ambdues vegades pel major marge de vot en la història de cada trofeu.