Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Márquez és el tercer jugador amb més partits a la història de l'equip nacional de Mèxic, amb 147 partits a la seva carrera. El 2018, es va convertir en el quart jugador a jugar per a la seva selecció nacional en cinc edicions consecutives de la Copa del Món de la FIFA, juntament amb el compatriota Antonio Carbajal, Lothar Matthäus i Gianluigi Buffon, apareixent en les edicions de 2002, 2006, 2010, 2014 i 2018 del torneig. També és el jugador mexicà amb més partits disputats a la Copa del Món amb 19. Amb l'equip nacional, Márquez va guanyar la Copa de Confederacions de la FIFA de 1999, i la Copa de la FIFA de 2003 i 2011.
edicions de la Copa d'Or de la CONCACAF.