Després de la Segona Guerra Mundial, la capacitat de Gènova per acabar en les classificacions superiors de la Serie A va disminuir de manera significativa; durant la resta de la dècada de 1940 el club va ser finalista de la taula mitjana. La temporada 1948-49
Va veure tres resultats molt significatius, el Gènova va guanyar a l'Inter 4<unk>1, el famós "Grande Torino" 3<unk>0 i el Padova 7<unk>1. La dècada de 1950 va començar de manera pobre per al club, havien comprat l'argentí Mario Boyé del Boca Juniors, però es va quedar només una temporada i el club va ser relegat després de acabar a la part inferior de la taula, però després de dues temporades van aconseguir el seu retorn després de guanyar la Serie B, per davant de Legnano. Ragnar Nikolay Larsen va ser un jugador notable per al club durant aquest període i van mantenir les classificacions mitjanes per a la resta de la dècada.