Ewell va comandar una divisió del petit exèrcit de Jackson durant la Campanya de la Vall, guanyant personalment bastants batalles contra els exèrcits més grans de la Unió del major Gens. Nathaniel P. Banks, John C. Frémont i James Shields a la Batalla de Front Royal i la Primera Batalla de Winchester
, Batalla de Cross Keys, i Batalla de Port Republic, respectivament. L'exèrcit de Jackson va ser llavors reclamat a Richmond per unir-se a Robert E. Lee en la protecció de la ciutat contra l'Exèrcit del Potomac del major general George B. McClellan en la Campanya de la Península. Ewell va lluitar de manera destacada a Gaines' Mill i va veure una acció relativament lleugera a Malvern Hill. Després que Lee rebutjà l'exèrcit de la Unió a les Batalles dels Set Dies, l'Exèrcit de Virginia del general de divisió John Pope va amenaçar amb atacar des del nord, així que Jackson va ser enviat per interceptar-lo. Ewell va derrotar a Banks de nou a la Batalla de Cedar Mountain el 9 d'agost i, tornant al vell camp de batalla de Manassas, va liderar la seva divisió en acció a Brawner's Farm el 28 d'agost. Una bola de Minie va trencar la cama dreta d'Ewell i va estar al terra durant diverses hores abans de ser trobat i portat. La cama va ser amputada per sota del genoll i Ewell va afrontar una dolorosa recuperació que va durar mesos. Tot i que va rebre una cama de fusta, la forma irregular del tronc de la cama va fer difícil encaixar-la. El dia de Nadal, Ewell va resballar i va caure a Richmond, agravant encara més la seva lesió.