L'exèrcit alemany va dirigir la seva atenció cap a l'oest, i a l'abril de 1940 va envair Dinamarca
- No. "Schleswig-Holstein" va ser assignat al component naval de la força d'invasió. Durant la invasió, el vaixell es va aturar breument al Gran Cinturó, a l'oest d'Agersø. Després de l'operació, va ser transferit de nou a les tasques d'entrenament, com a vaixell insignia del Cap de les Unitats d'Entrenament. A finals de 1943, la reactivació de "Schleswig-Holstein" es va contemplar una vegada més. En el seu favor va ser el fet que va conservar algunes calderes de carbó, donada la situació cada vegada pitjor del subministrament de petroli. Així, l'1 de febrer de 1944 va ser una vegada més posat en servei, primer assumint el seu vell paper com a vaixell d'entrenament de cadets, després més tard en l'any atracant a Gotenhafen (Gdynia) per a una remodelació. Va ser convertit en un vaixell d'escorta de combois amb un armament antiaeri molt millorat, però després de ser colpejat tres vegades per bombarders de la Royal Air Force el 18 de desembre de 1944, finalment es va enfonsar en aigües poc profundes. Com que el vaixell estava permanentment inhabilitat, la seva tripulació va ser enviada a terra per ajudar en la defensa de Marienburg.