De Beker van Albanië 2008-09 is de 57ste editie van de Beker van Albanië. Het toernooi loopt van 24 september 2008 tot en met 13 mei 2009. De bekerwinnaar plaatst zich voor de tweede kwalificatieronde van de UEFA Europa League. In de finale versloeg KS Flamurtari Vlorë landskampioen SK Tirana met 1-2.

Eerste voorronde 
De wedstrijden werden gespeeld op 24 september 2008.

|colspan="3" style="background-color:#B00000; color:#FFFFFF;"|Groep Noord

|-
|colspan="3" style="background-color:#B00000; color:#FFFFFF;"|Groep Zuid

|}

Tweede voorronde 
De wedstrijden werden gespeeld op 2 oktober 2008.

|colspan="3" style="background-color:#B00000; color:#FFFFFF;"|Groep Noord
{{Tabelrij wedstrijd|Erzeni Shijak||0–1|Iliria Fushe Krujë}}

|-
|colspan="3" style="background-color:#B00000; color:#FFFFFF;"|Groep Zuid'''

|}

Eerste ronde 
 De heenwedstrijden werden gespeeld op 29 oktober 2008
 De terugwedstrijden werden gespeeld op 12 november 2008.

|}

Tweede ronde 
 De heenwedstrijden werden gespeeld op 3 december 2008
 De terugwedstrijden werden gespeeld op 17 december 2008.

|}

Kwartfinale 
 De heenwedstrijden werden gespeeld op 25 februari 2009
 De terugwedstrijden werden gespeeld op 11 maart 2009.

|}

1Dinamo Tirana werd uitgesloten van de bekercompetitie omdat zij Elis Bakaj opstelde die nog speelde voor Partizani Tirana in de beker. De uitslag van de terugwedstrijd werd omgedraaid in een 2-0-overwinning voor Vllaznia.

De uitslagen van de wedstrijden tussen Flamurtari–Partizani werden geannuleerd omdat er spelers werden opgesteld die voor andere teams speelden in de beker.

|}

Halve finale 
 De heenwedstrijden werden gespeeld op 15 april 2009
 De terugwedstrijden werden gespeeld op 29 april 2009.

|}

Finale

Externe links 
 Official website
 Albanian Cup on rsssf.com

Albanië
Voetbal in Albanië
Sportevenement in Albanië