Jonathan Vaughters (Denver, 10 juni 1973) is een voormalig Amerikaans wielrenner. Momenteel is hij de manager van de Amerikaanse WorldTour-ploeg EF Education-Nippo.

Belangrijkste overwinningen 
1995
 1e etappe Ronde van de Gila
 Eindklassement Ronde van de Gila

1997
 2e etappe Redlands Bicycle Classic
 3e etappe GP de Beauce
 4e etappe GP de Beauce
 Eindklassement GP de Beauce
 Eindklassement Cascade Cycling Classic
 Amerikaans kampioen Individuele tijdrit op de weg, Elite

1998
 2e etappe Redlands Bicycle Classic
 3e etappe Redlands Bicycle Classic
 Eindklassement Redlands Bicycle Classic
 1e etappe Valley of the Sun Stage Race

1999
 4e etappe Redlands Bicycle Classic
 3e etappe Dauphiné Libéré
 Eindklassement Route du Sud
 2e etappe Celestonial Seasonings Red Zinger Race
 3e etappe Celestonial Seasonings Red Zinger Race
 Eindklassement Celestonial Seasonings Red Zinger Race

2001
 4e etappe Dauphiné Libéré
 Duo Normand (met Jens Voigt)

2003
 2e etappe Solano Bicycle Classic

Resultaten in voornaamste wedstrijden 

|}

Trivia 
 Tussen 1999 en 2004 in het bezit van het snelheidsrecord van de beklimming van de Mont Ventoux met 56:50u. Nam het record over van Charly Gaul en verloor het aan Iban Mayo

Externe link 

Amerikaans wielrenner
Amerikaans wielerploegleider