De diagnose van een besmetting met het circo-virus moet plaatsvinden middels het maken van coupes van het weefsel van de Bursa van Fabricius. In deze coupes kunnen dan insluitlichaampjes aangetroffen worden in afweercellen. Met name in zgn. Macrofagen. Verder valt op dat er een tekort aan lymfocyten aanwezig is in de coupes.