De marathon van Nagano 2016 vond plaats op zondag 17 april 2016 in de Japanse stad Nagano. Het was de achttiende editie van deze marathon. Een sterke wind zorgde ervoor dat er geen snelle tijden gelopen werden.

Bij de mannen werd de wedstrijd gewonnen door de Keniaan Jairus Chanchima in 2:15.31. Bij de vrouwen was de Ethiopische Shasho Insermu het snelste in 2:34.19. Zij was ruim een halve minuut sneller dan haar achtervolger.

Uitslagen

Mannen

Vrouwen 

2016
Nagano