Het seizoen 2008/2009 is het 98e jaar in het bestaan van de Zwolse voetbalclub FC Zwolle. De club komt uit in de Eerste divisie en het toernooi om de KNVB beker.

Aan het begin van het seizoen 2008-2009 moeten alle tribunes in het nieuwe FC Zwolle Stadion gereed zijn voor gebruik en er zullen dan 10.500 mensen in kunnen. De overige werkzaamheden aan het stadion zullen in dit seizoen gedaan worden. Ook zal het stadion een officiële naam krijgen.

Vertrek Jan Everse 
Hoofdtrainer Jan Everse werd op 2 maart 2009 op non-actief gesteld door het bestuur van FC Zwolle. De reden ligt volgens FC Zwolle niet op het sportieve vlak, maar zou volgens de club een misdraging zijn, gepaard gaande met fysiek contact jegens een medewerker van FC Zwolle. De club vindt dat er een onwerkbare en onhoudbare situatie is ontstaan. Jan Everse is een andere mening toegedaan. Volgens hem hebben bestuur en directie bewust gezocht naar een aanleiding om hem te ontslaan. Everse ontkent fysiek geweld te hebben toegepast en zegt dat hij in zijn goede naam is aangetast door uitlatingen van voorzitter Ronald van Vliet in de media. Everse kwam al vaker in aanvaring met de clubleiding, die volgens de oefenmeester amateuristisch te werk gaat. In maart 2008 hadden FC Zwolle en Jan Everse bijvoorbeeld onenigheid over de duur van diens verbintenis. Na het op non-actief stellen van Everse is veel onrust ontstaan bij de achterban van de club. Op 5 maart protesteert een groep "supporters" bij het huis van voorzitter Van Vliet. Het protest loopt uit de hand en de politie grijpt in. Er sneuvelt een ruit in het appartement van de voorzitter. De politie verricht acht aanhoudingen. Honderden supporters eisen het vertrek van het bestuur en de terugkeer van Jan Everse.

Een arbitragezaak bij de KNVB moest duidelijkheid in de zaak scheppen over de gronden waarop de trainer op non-actief was gesteld. Verder zou er tevens worden bekeken of Everse als hoofdtrainer kon aanblijven bij FC Zwolle, of dat er een onwerkbare situatie was ontstaan. Indien het laatste het geval zou zijn dan moest FC Zwolle de oefenmeester een forse afkoopsom moeten betalen in ruil voor ontslag. Assistent van Jan Everse was Claus Boekweg. Hij nam na het op non-actief stellen van Everse tijdelijk de taak als hoofdtrainer op zich, maar besloot uit solidariteit met Everse deze functie slechts voor de duur van twee wedstrijden te vervullen. Op 10 maart 2009 maakte FC Zwolle bekend dat Marco Roelofsen, tot dan toe trainer van de B-jeugd van FC Zwolle, tijdelijk het hoofdtrainerschap op zich zal nemen. Claus Boekweg ging weer als assistent-trainer aan de slag.

Wedstrijdstatistieken

Oefenduels

Eerste divisie

Playoffs promotie/degradatie

KNVB beker

Selectie en technische staf 
Voor aanvang van het seizoen is bekend dat publiekslieveling Dennis van der Wal ook het komende seizoen voor de club uitkomt, waar eerder nog ontslag voor hem is aangevraagd, is alsnog een potje geld gevonden om Van der Wal een contract aan te bieden.
Belangrijke spelers die vertrokken zijn, zijn verdediger Moisander (die een contract heeft getekend bij AZ), middenvelder Zuidam (naar aartsrivaal Go Ahead Eagles), aanvallende middenvelder Jongsma (naar RKC Waalwijk) en spits Tozé.
Naast een 4-tal jeugdspelers (Gnodde, Pluim, Schuldink en Vossebelt) die zijn doorgestroomd heeft FC Zwolle ook de 'verloren zoon' Dominggus Lim-Duan als amateur teruggehaald. Als hij 10 kg verliest en zijn voetbalkwaliteiten toont kan hij een contract verdienen.
Verder zijn er een aantal tropische verrassingen gehaald uit Zuid-Amerika (Giglio, Guarino en Grizolli) en Oost-Europa (Görner en Kaprálik).
Botteghin en Van der Haar zijn de belangrijkste spelers die gebleven zijn.

Selectie 2008/09

Technische staf

Hoofdtrainer Jan Everse is per 2 maart 2009 op non-actief gesteld door het bestuur van FC Zwolle. Een arbitragezaak bij de KNVB moet duidelijkheid in de zaak scheppen over de gronden waarop de trainer op non-actief is gesteld. Dan zal tevens worden bekeken of Everse als hoofdtrainer kan aanblijven bij FC Zwolle, of dat er een onwerkbare situatie is ontstaan. In dat laatste geval zal FC Zwolle de oefenmeester hoogstwaarschijnlijk een forse afkoopsom moeten betalen in ruil voor ontslag. Assistent van Jan Everse was Claus Boekweg. Hij nam na het op non-actief stellen van Everse tijdelijk de taak als hoofdtrainer op zich, maar besloot uit solidariteit met Everse deze functie slechts voor de duur van twee wedstrijden te vervullen. Op 10 maart 2009 maakte FC Zwolle bekend dat Marco Roelofsen, tot dan toe trainer van de B-jeugd van FC Zwolle, tijdelijk het hoofdtrainerschap op zich zal nemen. Claus Boekweg zal weer assistent-trainer worden. Sierd van der Berg neemt de training van de keepers op zich en Martin Reynders is in dienst als techniektrainer. De verzorging ligt in handen van Erwin Vloedgraven en Jenny Admiraal, Arthur Vennik is fysiotherapeut. Wim de Weerdt is de teambegeleider en Jerome Mulder is in dienst als facilitair medewerker. Jaap Stam zit nu ook bij de technische staf.

Statistieken FC Zwolle 2008/2009

Eindstand FC Zwolle in de Nederlandse Eerste divisie 2008 / 2009

Topscorers

Kaarten

Punten per speelronde

Punten na speelronde

Stand na speelronde

Doelpunten per speelronde

Mutaties

Zomer

Aangetrokken

Vertrokken

Statistieken transfers zomer

Winter

Aangetrokken

Vertrokken

Statistieken transfers winter

Zie ook 
 FC Zwolle
 Eerste divisie 2008/09
 KNVB beker 2008/09

2008/09
Zwolle