De vijfde editie van de International Football Cup (later Intertoto Cup) van 1965-66 werd gewonnen door Lokomotive Leipzig, de verliezend finalist van het voorgaande jaar (toen nog als SC Leipzig). Ze versloegen in de finale IFK Norrköping. De competitie werd voor deze editie teruggebracht naar het originele format, met 32 clubs verdeeld over acht groepen. Daarop volgden knock-outrondes, beginnend met kwartfinales.

Groepsfase
De clubs werden verdeeld over acht groepen van elk vier clubs. Clubs uit Nederland, Zweden, Zwitserland en West-Duitsland werden in de 'A'-groepen geplaatst en clubs uit Tsjecho-Slowakije', Oost-Duitsland, Polen en Joegoslavië in de 'B'-groepen. De acht groepwinnaars stroomden door naar de knock-outrondes.

Groep A1

Groep A2

Groep A3

Groep A4

Groep B1

Groep B2

Groep B3
Željezničar mocht geen internationale wedstrijden meer spelen van de Joegoslavische voetbalbond, dus Leipzig ging door naar de kwartfinales

Groep B4

Kwartfinales

|}
De wedstrijd Chemie Leipzig vs. Hansa Rostock werd ook gerapporteerd als 3-2, na verlenging, maar de officiële uitslag is 4-3, na verlenging.

Halve finales

|}

Finale (mei)
De data van de finalewedstrijden zijn 10 of 11 en 29 of 30 mei.
SC Leipzig werd voor de finale hernoemd tot Lokomotive Leizpig.

|}

Zie ook
 Europacup I 1965/66
 Europacup II 1965/66
 Jaarbeursstedenbeker 1965/66

Externe links
 Intertoto Cup 1965/66 by Karel Stokkermans at RSSSF
  by Pawel Mogielnicki
  onzekerheid over één of meer uitslagen voor 1965-66

Intertoto Cup
Europacupvoetbal 1965/66