Het seizoen 1965/1966 was het eerste jaar in het bestaan van de voetbalclub FC Twente. De ploeg was op 1 juli 1965 ontstaan door een fusie van Sportclub Enschede en Enschedese Boys. SC Enschede was in seizoen 1964/1965 zevende geworden in de Eredivisie. FC Twente nam het recht over om in de hoogste Nederlandse profklasse te mogen starten. De Tukkers kwamen uit in de Nederlandse Eredivisie en namen deel aan het toernooi om de KNVB beker.

Selectie 
De Oostenrijker Friedrich Donenfeld werd in 1965 de eerste trainer van FC Twente. Hij was het jaar daarvoor nog trainer van SC Enschede. Zijn assistent was de Engelsman Ernie Robinson, die eveneens trainer was geweest van SC Enschede.

De selectie bestond voornamelijk uit spelers die in het voorgaande seizoen voor SC Enschede speelden. Willem de Vries was de eerste speler die een contract tekende bij de fusieclub. Egbert ter Mors werd ingelijfd van Go Ahead, de Duitse aanvaller Heinz Höher werd overgenomen van Meidericher SV en de Luxemburger Spitz Kohn kwam over van Fortuna '54. De Joegoslaaf Ned Bulatović was aanvankelijk de enige basisspeler die voor de fusie bij de Enschedese Boys in de Eerste divisie speelde.

De aanvoerder van FC Twente in het eerste seizoen was Johan Plageman.

Seizoensverloop 
In het eerste jaar van het bestaan eindigde Twente op een teleurstellende elfde plaats. De start van het seizoen was nog goed, met een gedeelde tweede plek na negen wedstrijden. De ploeg speelde echter wisselvallig en eindigde de competitie ronduit slecht door de laatste vijf wedstrijden te verliezen. Trainer Donenfeld kon de grote en dure selectie, waarin spelers die tot een jaar eerder vaste waarde waren in het eerste van SC Enschede en de Enschedese Boys om een plaatsje moesten vechten, niet inspireren. Hij zou een jaar later dan ook plaatsmaken voor de jonge Kees Rijvers.

Van de dertig wedstrijden werden er vijftien verloren. Negen werden er gewonnen en zes eindigden met een gelijkspel. De grootste overwinning was de thuiswedstrijd op 31 oktober 1965 tegen Willem II: 6-1 met vier doelpunten van Hans Roordink. De laatste wedstrijd van het seizoen, thuis tegen PSV, ging met 1-7 verloren.

Clubtopscorer werd Hans Roordink, met elf doelpunten. De latere trainer Spitz Kohn bleef op één doelpunt minder steken. Verdediger Job Hoomans viel op door in één wedstrijd (uit tegen Go Ahead) tweemaal in het eigen doel te scoren.

Ook in de KNVB beker 1965/66 was FC Twente weinig succesvol. In de eerste ronde van het toernooi waren de ploegen ingedeeld in vijftien regionale groepen. FC Twente moest het in een halve competitie opnemen tegen AGOVV, HVV Tubantia en De Graafschap. Twente en De Graafschap eindigden beiden met vijf punten. De Graafschap bekerde dankzij een beter doelsaldo door naar de achtste finales.

Wedstrijdstatistieken

Eredivisie 1965/66

KNVB beker 1965/66

Spelersstatistieken 

FC Twente naar seizoen
Twente, FC