Het seizoen 2008/2009 is het 44e jaar in het bestaan van de Enschedese voetbalclub FC Twente. De Tukkers komen uit in de Nederlandse Eredivisie, zullen deelnemen aan het toernooi om de KNVB beker en spelen voor het eerst in de geschiedenis van de club in de voorronde van de Champions League. Het beloftenteam van FC Twente komt door het kampioenschap in 2007/08 net als het eerste uit in het toernooi om de KNVB beker.

Na de verbouwing, die kort voor de thuiswedstrijd op 13 september 2008 tegen NEC gereed was, werd het Arke Stadion hernoemd in De Grolsch Veste en uitgebreid van 13.250 naar 24.000 plaatsen. Voor de thuiswedstrijd op 13 augustus tegen Arsenal in de voorronde van de Champions League werd in verband met de verbouwing nog uitgeweken naar GelreDome in Arnhem.

Wedstrijdstatistieken

Oefenduels

Topscorers in de oefenduels

Eredivisie

KNVB beker

Voorronde Champions League

UEFA Cup

Selectie en technische staf

Selectie

Technische staf

Mutaties

Zomer

Aangetrokken

Vertrokken 

Aantal wedstrijden geeft het totale aantal gespeelde officiële wedstrijden weer

Winter

Aangetrokken

Vertrokken 

Aantal wedstrijden geeft het totale aantal gespeelde officiële wedstrijden weer

Individuele statistieken 
Legenda
 W Wedstrijden
  Wissel in
  Wissel uit
  Doelpunt
 A Assists
  Gele kaart
  2× gele kaart in 1 wedstrijd
  Rode kaart

Jong FC Twente in de KNVB beker 
Door het landskampioenschap in de beloftencompetitie 2007/08 kreeg Jong FC Twente het recht om in de KNVB beker 2008/09 uit te komen. In de eerste ronde had het net als de ploegen uit de Eredivisie en Eerste divisie een bye, in de tweede ronde werd een thuiswedstrijd geloot tegen ADO Den Haag uit de Eredivisie.

In het basiselftal waren twee spelers opgenomen met ervaring in het eerste elftal van FC Twente, namelijk doelverdediger Nikolaj Michajlov en aanvaller Patrick Gerritsen. Het team verloor met 4-1.

Zie ook 
 Eredivisie 2008/09
 KNVB beker 2008/09
 UEFA Champions League 2008/09
 UEFA Cup 2008/09
 FC Twente (vrouwenvoetbal) in het seizoen 2008/09

FC Twente naar seizoen
Twente