Het wapen van het Waterschap Bijlmer werd op 7 juli 1967 per Koninklijk Besluit aan het waterschap Bijlmer verleend. Het wapen bleef tot 1979 in gebruik, dat jaar ging het waterschap op in het nieuw ontstane waterschap Drecht en Vecht. Uit het wapen van Bijlmer is onder meer het eerste kwartier overgenomen.

Blazoenering 
De blazoenering van het wapen luidde als volgt:

Het wapen is opgedeeld in twee horizontale helften. De bovenste helft is zelf gedeeld. In het eerste deel acht gouden en zwarte dwarsbalken, met daar overheen een schuinkruis bestaande uit zilveren en rode blokken (gelijk aan een schaakbord). Het tweede deel is geheel rood van kleur met daarop drie zilveren vissen. Zij vormen samen een driehoek met de punt naar boven gericht. De onderste helft van het wapen is in zogenaamd krukkenvair, het is verdeeld in zwart en zilver. De "krukken" zijn afgeleid van het krukkenkruis. Over dit vair heen een gouden paal met daarin een zwarte reiger. Normaal gesproken mogen zilver en goud niet over elkaar heen geplaatst worden, maar omdat vair een kleur is, is het nu wel toegestaan. De reiger staat naar heraldisch links (voor de kijker rechts) gedraaid. De poten en snavel van de reiger zijn rood van kleur. Op het schild een gouden gravenkroon.

Symboliek 
Het wapen is gedeeltelijk gebaseerd op het wapen van de heren van Amstel. De heraldisch rechter helft van het bovenste deel is op hun wapen gebaseerd. In het onderste deel staat op een gouden paal een reiger, deze is afkomstig uit het wapen van Bijlmermeer. Het wapen van de heren van Amstel is later ook overgegaan in het wapen van Drecht en Vecht. Na een nieuwe fusie is het waterschap Amstel en Vecht ontstaan, deze heeft er echter voor gekozen om niet langer het wapen van de heren van Amstel te voeren. Dit geldt ook voor het krukkenvair en de reiger.

Bijlmer
Noord-Hollands symbool