Vetzuren worden afgebroken tot acetyl-CoA, in een proces dat bèta-oxidatie van Knoop (vernoemd naar Franz Knoop) wordt genoemd. De naam van het proces geeft aan dat het derde (tweede vanaf de acylgroep) koolstofatoom (bètakoolstof) wordt geoxideerd.

Bij de afbraak worden de volgende stappen per molecuul eenmalig uitgevoerd:
 1. Activering van het vetzuurmolecuul, waarbij er acylthioester wordt gevormd (Acyl-CoA).
 2. Transport door het buitenste membraan van het mitochondrion.
 3. Omestering met L-Carnitine
 4. Transport door het binnenste membraan van het mitochondrion
 5. Omestering met CoA
Hierna volgt de repeterende afbraak van de verzadigde koolstofketen tot Acetyl-CoA. 
 1. dehydrogenatie met FAD
 2. hydratatie
 3. dehydrogenatie met NAD+
 4. thiolytische splitsing met CoA.
De aanwezigheid van een onverzadigde binding in de koolstofketen maakt twee extra isomerisatiestappen noodzakelijk. Daarbij is het enzym enoyl-CoA isomerase betrokken.  

Deze reactie gaat verder tot de gehele keten gesplitst is in Acetyl-CoA-eenheden. De laatste cyclus produceert twee afzonderlijke Acetyl-CoA-eenheden in plaats van één Acetyl-CoA. Bij elke cyclus worden er twee koolstofatomen ontnomen aan de Acyl-CoA-eenheid. Tegelijkertijd worden er telkens één molecuul FADH2, NADH en Acetyl-CoA gevormd.

Het gevormde Acetyl-CoA wordt in het mitochondrion verder gemetaboliseerd in de citroenzuurcyclus.

Zie ook 
Medium Chain Acyl co-enzym-A Dehydrogenase deficiëntie

Externe links 
Afbraak van palmitoyl-CoA
Afbraak van linoleoyl-CoA

Biochemische reactie