Het jaar 1099 is het 99e jaar in de 11e eeuw volgens de christelijke jaartelling.

Gebeurtenissen 
januari
 6 - Keizer Hendrik IV kroont zijn zoon Hendrik tot Rooms Koning.
april
 8 - De monnik Petrus Bartholomeus in het vorstendom Antiochië ondergaat een vuurproef in een poging zijn gelijk te bewijzen. Hij sterft aan zijn verwondingen op 20 
april.

mei
 mei - Opmars van de Kruisvaarders. Tripoli valt in handen van Raymond van Toulouse. Ook Beiroet (19 mei), Tyrus (23 mei), en Jaffa (29 mei) 

juni
 3 -  Ramallah wordt ingenomen.
 6 - De kruisvaarders veroveren Bethlehem.
 7 - Begin van het Beleg van Jeruzalem

juli
 15 - De kruisvaarders nemen Jeruzalem in.
 15 t/m 17 juli - De kruisvaarders richten een bloedbad aan onder de (joodse en islamitische) inwoners van Jeruzalem.
 22 - Het koninkrijk Jeruzalem wordt gesticht. Godfried van Bouillon wordt de eerste monarch, maar weigert de koningstitel, en neemt in plaats daarvan de titel 'Beschermer van het Heilig Graf' aan.
 Tancred krijgt de titel 'prins van Galilea en Tiberias'

augustus
 1 - Het Latijns patriarchaat van Jeruzalem wordt gesticht, met Arnulf van Chocques als patriarch.
 5 - De Relikwieën van het Heilig Kruis worden gevonden.
 12 - Slag bij Ashkelon: De kruisvaarders verslaan de Fatimiden onder al-Afdal Shahanshah, die optrok om Jeruzalem te heroveren. al-Afdal vlucht terug naar Egypte. Einde van de Eerste kruistocht: Het grootste deel van de kruisvaarders keert terug naar Europa.
 13 - paus Urbanus II wordt opgevolgd door Ranieri di Bieda als Paschalis II
 
oktober
 oktober - Bagdad wordt een twistappel in de burgeroorlog die heerst in het voormalige Seltsjoekenrijk. De stad zal tot april 1101 zo'n dertig keer in andere handen overgaan.

zonder datum
 Robert Curthose trouwt met Sybille de Conversano.
 Godfried I van Leuven trouwt met Ida van Chiny.
 Voor het eerst genoemd: Duras, Ingelmunster, Malen

Opvolging 
 bisdom Terwaan - Gerardus van Kamerijk opgevolgd door Jan van Waasten

Geboren 
 Olaf Magnusson, medekoning van Noorwegen (1103-1115)
 Willem X, hertog van Aquitanië (1126-1137)
 Diederik van de Elzas, graaf van Vlaanderen (1128-1168) (jaartal bij benadering)

Overleden 
 14 april - Koenraad van Zwaben, bisschop van Utrecht (1076-1099)
 20 april - Peter Bartholomeus, kruisvaarder
 10 juli - Rodrigo Díaz de Vivar (El Cid) (~59), Spaanse ridder
 29 juli - Urbanus II, paus (1088-1099)
 21 november - Herman III van Hochstaden, aartsbisschop van Keulen (1089-1099)
 Donald III, koning van Schotland (1094-1097)

Jaar