De vlag van Rijnwoude is bij raadsbesluit vastgesteld als de gemeentelijke vlag van de in 1991 opgerichte Zuid-Hollandse gemeente Rijnwoude (tot 1993 Rijneveld genaamd). De vlag kan als volgt worden beschreven:

Het gemeentewapen is inclusief kroon op het gemeentelijke dundoek afgebeeld. De ontwerper van het wapen is Willem Vis.

Op 1 januari 2014 ging Rijnwoude op in de gemeente Alphen aan den Rijn. De vlag kwam daardoor als gemeentevlag te vervallen.

Verwante afbeeldingen 

Geschiedenis van Alphen aan den Rijn
Rijnwoude