De marathon van Praag 2000 werd gelopen op zondag 21 mei 2000. Het was de zesde editie van deze marathon. 

De Keniaan Simon Chemoiywo zegevierde bij de mannen in 2:10.35. Hij won hiermee $ 20.000 aan prijzengeld en bleef zijn landgenoot Josephat Kiprono slechts drie seconden voor. De Russische Alina Ivanova won bij de vrouwen in 2:27.42.

Deze editie was eveneens het toneel van de Tsjechische kampioenschappen. Deze titels werden gewonnen door respectievelijk Jan Blaha (zestiende in 2:18.43) en Alena Peterkova (tweede in 2:31.08).

In totaal finishten 2776 marathonlopers, waarvan 336 vrouwen.

Uitslagen

Mannen

Vrouwen 

2000
Praag