Wetenschappers hebben lang gedacht dat Kuelap een fort was. Ze hebben echter ontdekt dat het religieuze aspect nog belangrijker was. Kuélap bestaat niet alleen uit oude militaire gebouwen. Je vind er ook civiele, religieuze en huiselijke gebouwen.
Kuélap is ook veel ouder dan het hele Inca-rijk. Uit radiokoolstofdatering-monsters blijkt dat de bouw begon in de 6e eeuw na Christus en duurde tot het begin van de koloniale periode (1532-1570).
Opgravingen wijzen erop dat Kuélap onder meer een militaire functie had en gebruikt werd als bescherming tegen de Wari stam, die op dat moment Noord-Peru bezette.
De muren rond Kuelap zijn gemaakt van meer dan 708.000 m3 stenen. Dit is ongeveer drie keer het volume van de piramides van Keops in Egypte.
De architecten van Kuelap werkten met honderden specialisten, van steenhouwers, metselaars en dragers van water, stenen en modder. Er leefden ook veel verschillende boeren op het terrein, wiens enige werk was om maïs, aardappelen en groenten voor de arbeiders te produceren.
Tot op heden is onbekend hoe de Chachapoyas het water voor al deze mensen de heuvel op brachten. De muurdecoraties bevatten ogen van katachtigen, slangen en vogels. Waarschijnlijk waren het goden van de Chachapoya-cultuur.
Een pad van twee kilometer, dat steeds wat omhoog loopt, bereik je de stadsmuur van Kuélap. De stadsmuur wordt omgeven door groen landschap, waardoor het een gewone hoge stenen muur lijkt. De originele stadspoort is wegens veiligheidsoverwegingen gesloten, verderop vind je een tweede poort, welke gebruikt werd door het personeel.