Het ontstaan van sommige van bovenstaande ziektes wordt in verband gebracht met verstoringen in de darmflora. Artsen kunnen bepalen of het nodig is om een probioticum te nemen.
Voor zover bekend zijn er geen ongewenste bijwerkingen van probiotica. Deze bijwerkingen worden wel genoemd, maar daar is geen goed bewijs voor:
Gewone yoghurt en kwark bevatten ook melkzuurbacteriën, alleen deze sterven door het maagzuur en daarom zijn het geen probiotica. Ook augurken en brie bevatten gezonde bacteriën die de darmen niet levend bereiken.
Een probioticum is pas een priobioticum wanneer er veel bacteriën aanwezig zijn, en wanneer ze de darmen voor een deel levend kunnen bereiken. Een hoeveelheid van 1 tot 10 miljard bacteriën per dag wordt als de minimale hoeveelheid gezien die nodig is om een effect te bereiken.