Dit is een lijst van zoogdieren die voorkomen in Papoea-Nieuw-Guinea. Afwijkingen van de voornaamste bron, de derde editie van Mammal Species of the World uit 2005, zijn door middel van voetnoten aangegeven.

Orde Roofbuideldieren (Dasyuromorphia)

Familie Echte roofbuideldieren (Dasyuridae)
 Nieuw-Guinese gevlekte buidelmarter (Dasyurus albopunctatus)
Dasyurus spartacus
Micromurexia habbema
Murexechinus melanurus
Murexia longicaudata
Myoictis leucura
 Noordelijke gestreepte buidelmarter (Myoictis melas)
Myoictis wallacei
Myoictis wavicus
 Lorentzbuidelmuis (Neophascogale lorentzi)
Paramurexia rothschildi
Phascolosorex dorsalis
Phascomurexia naso
Planigale novaeguineae
Sminthopsis archeri
Sminthopsis virginiae

Orde Buideldassen (Peramelidae)

Familie Echte buideldassen (Peramelidae)
 Clarabuideldas (Echymipera clara)
Echymipera davidi
Echymipera echinista
 Kortstaartbuideldas (Echymipera kalubu)
Echymipera rufescens
 Grote kortneusbuideldas (Isoodon macrourus)
 Langstaartbuideldas (Microperoryctes longicauda)
Microperoryctes ornata
Microperoryctes papuensis
Peroryctes broadbenti
 Grote buideldas (Peroryctes raffrayana)

Orde Klimbuideldieren (Diprotodontia)

Familie Dwergbuidelmuizen (Burramyidae)
 Papoeabuidelslaapmuis (Cercartetus caudatus)

Familie Koeskoezen (Phalangeridae)
 Bergkoeskoes (Phalanger carmelitae)
 Grondkoeskoes (Phalanger gymnotis)
Phalanger intercastellanus
Phalanger lullulae
Phalanger matanim
Phalanger mimicus
 Witte koeskoes (Phalanger orientalis)
Phalanger sericeus
Phalanger vestitus
Spilocuscus kraemeri
 Gevlekte koeskoes (Spilocuscus maculatus)
Spilocuscus rufoniger

Familie Buideleekhoorns (Petauridae)
Dactylopsila megalura
 Kleine buideleekhoorn (Dactylopsila palpator)
Dactylopsila tatei
 Gestreepte buideleekhoorn (Dactylopsila trivirgata)
Petaurus abidi
 Suikereekhoorn (Petaurus breviceps)

Familie Kleine koeskoezen (Pseudocheiridae)
Pseudochirops albertisii
Pseudochirops corinnae
Pseudochirops cupreus
Pseudochirulus canescens
Pseudochirulus forbesi
Pseudochirulus larvatus
Pseudochirulus mayeri

Familie Vliegende buidelmuizen (Acrobatidae)
 Vederstaartbuidelmuis (Distoechurus pennatus)

Familie Kangoeroes (Macropodidae)
 Doriaboomkangoeroe (Dendrolagus dorianus)
 Goodfellowboomkangoeroe (Dendrolagus goodfellowi)
 Grijze boomkangoeroe (Dendrolagus inustus)
 Matschieboomkangoeroe (Dendrolagus matschiei)
 Goudmantelboomkangoeroe (Dendrolagus pulcherrimus)
Dendrolagus scottae
Dendrolagus spadix
Dendrolagus stellarum
 Goodenoughwallaby (Dorcopsis atrata)
 Hagenwallaby (Dorcopsis hageni)
Dorcopsis luctuosa
 Macleaywallaby (Dorcopsulus macleayi)
Dorcopsulus vanheurni
 Zandwallaby (Notamacropus agilis)
Thylogale browni
 De-Bruijnpademelon (Thylogale brunii)
Thylogale calabyi
Thylogale lanatus

Orde Zeekoeien (Sirenia)

Familie Doejongs (Dugongidae)
 Doejong (Dugong dugon)

Orde Vleermuizen (Chiroptera)

Familie Grote vleermuizen (Pteropodidae)
 Bulmers roezet (Aproteles bulmerae)
Dobsonia anderseni
Dobsonia inermis
Dobsonia magna
Dobsonia minor
Dobsonia pannietensis
Dobsonia praedatrix
 Kleine langtongvleerhond (Macroglossus minimus)
Melonycteris melanops
Melonycteris woodfordi
Nyctimene aello
Nyctimene albiventer
 Groothoofdbuisneusvleerhond (Nyctimene cephalotes)
Nyctimene certans
Nyctimene cyclotis
Nyctimene draconilla
 Grote buisneusvleerhond (Nyctimene major)
Nyctimene masalai
Nyctimene vizcaccia
 Kleine buisneusvleerhond (Paranyctimene raptor)
Paranyctimene tenax
 Bougainvilleapenkopvleermuis (Pteralopex anceps)
Pteralopex flanneryi
Pteropus admiralitatum
Pteropus alecto
 Halstervleerhond (Pteropus capistratus)
Pteropus conspicillatus
Pteropus gilliardorum
Pteropus hypomelanus
Pteropus macrotis
Pteropus mahaganus
Pteropus neohibernicus
Pteropus rayneri
Pteropus scapulatus
 Tongavleerhond (Pteropus tonganus)
Rousettus amplexicaudatus
Syconycteris australis
Syconycteris hobbit

Familie Hoefijzerneusvleermuizen (Rhinolophidae)
Rhinolophus arcuatus
Rhinolophus euryotis
Rhinolophus megaphyllus
Rhinolophus philippinensis

Familie Bladneusvleermuizen van de Oude Wereld (Hipposideridae)
 Bloemneusvleermuis (Anthops ornatus)
Aselliscus tricuspidatus
Hipposideros ater
Hipposideros calcaratus
Hipposideros cervinus
Hipposideros corynophyllus
Hipposideros diadema
Hipposideros dinops
Hipposideros edwardshilli
Hipposideros maggietaylorae
Hipposideros muscinus
Hipposideros semoni
Hipposideros wollastoni

Familie Schedestaartvleermuizen (Emballonuridae)
Emballonura beccarii
Emballonura dianae
Emballonura furax
Emballonura raffrayana
Emballonura serii
Mosia nigrescens
Saccolaimus flaviventris
Saccolaimus peli
Saccolaimus saccolaimus
Taphozous australis

Familie Bulvleermuizen (Molossidae)
Chaerephon jobensis
Mormopterus beccarii
Mormopterus loriae
Otomops papuensis
Otomops secundus
Tadarida kuboriensis

Familie Gladneusvleermuizen (Vespertilionidae)
Chalinolobus nigrogriseus
Kerivoula agnella
Kerivoula muscina
Kerivoula myrella
Miniopterus australis
Miniopterus macrocneme
Miniopterus magnater
Miniopterus medius
 Langvleugelvleermuis (Miniopterus schreibersii)
Miniopterus tristis
Murina florium
Myotis moluccarum
Nyctophilus bifax
Nyctophilus microdon
Nyctophilus microtis
Nyctophilus timoriensis
 Nieuw-Guinese grootoorvleermuis (Pharotis imogene)
Philetor brachypterus
Phoniscus papuensis
Pipistrellus angulatus
Pipistrellus collinus
Pipistrellus papuanus
Pipistrellus wattsi
Scotorepens sanborni

Orde Roofdieren (Carnivora)

Familie Katachtigen (Felidae)
 Huiskat (Felis catus) (geïntroduceerd)

Familie Hondachtigen (Canidae)
 Wolf (Canis lupus) (geïntroduceerd)

Orde Evenhoevigen (Artiodactyla)

Familie Varkens (Suidae)
 Wild zwijn (Sus scrofa vittatus x Sus celebensis) (geïntroduceerd)

Familie Herten (Cervidae)
 Axishert (Axis axis) (geïntroduceerd)
 Javaans hert (Cervus timorensis) (geïntroduceerd)
 Damhert (Dama dama) (geïntroduceerd; mogelijk uitgestorven)

Orde Walvissen (Cetacea)

Familie Vinvissen (Balaenopteridae)
 Dwergvinvis (Balaenoptera acutorostrata)
 Edens vinvis (Balaenoptera edeni)
 Blauwe vinvis (Balaenoptera musculus)
 Gewone vinvis (Balaenoptera physalus)
 Bultrug (Megaptera novaeangliae)

Familie Potvissen (Physeteridae)
 Dwergpotvis (Kogia breviceps)
 Kleinste potvis (Kogia sima)
 Potvis (Physeter catodon)

Familie Spitssnuitdolfijnen (Ziphiidae)
 Zuidelijke butskop (Hyperoodon planifrons)
 Longmanspitssnuitdolfijn (Indopacetus pacificus)
 Spitssnuitdolfijn van Blainville (Mesoplodon densirostris)
 Dolfijn van Cuvier (Ziphius cavirostris)

Familie Dolfijnen (Delphinidae)
 Kaapse dolfijn (Delphinus capensis)
 Gewone dolfijn (Delphinus delphis)
 Dwerggriend (Feresa attenuata)
 Indische griend (Globicephala macrorhynchus)
 Gramper (Grampus griseus)
 Sarawakdolfijn (Lagenodelphis hosei)
Orcaella heinsohni
 Orka (Orcinus orca)
 Chinese witte dolfijn (Sousa chinensis)
 Slanke dolfijn (Stenella attenuata)
 Gestreepte dolfijn (Stenella coeruleoalba)
 Langsnuitdolfijn (Stenella longirostris)
 Snaveldolfijn (Steno bredanensis)
 Tuimelaar (Tursiops truncatus)

Orde Knaagdieren (Rodentia)

Familie Muridae
Abeomelomys sevia
Anisomys imitator
Baiyankamys shawmayeri
Chiruromys forbesi
Chiruromys lamia
Chiruromys vates
Coccymys ruemmleri
Conilurus penicillatus
 Australische beverrat (Hydromys chrysogaster)
 Beverrat van Nieuw-Brittannië (Hydromys neobritannicus)
Hydromys ziegleri
Hyomys dammermani
Hyomys goliath
 Grootpootwaterrat (Leptomys elegans)
Leptomys ernstmayri
 Flywaterrat (Leptomys signatus)
Lorentzimys nouhuysi
Macruromys major
Mallomys aroaensis
Mallomys istapantap
 Gladstaartreuzenrat (Mallomys rothschildi)
Mammelomys lanosus
Mammelomys rattoides
Melomys arcium
Melomys bougainville
Melomys burtoni
Melomys dollmani
Melomys leucogaster
Melomys lutillus
Melomys matambuai
Melomys rufescens
Melomys spechti
Microhydromys musseri
Microhydromys richardsoni
 Huismuis (Mus musculus) (geïntroduceerd)
Parahydromys asper
Paraleptomys rufilatus
Paraleptomys wilhelmina
Paramelomys gressitti
Paramelomys levipes
Paramelomys mollis
Paramelomys moncktoni
Paramelomys platyops
Paramelomys rubex
 Laaglandborstelmuis (Pogonomelomys bruijni)
Pogonomelomys mayeri
Pogonomys championi
Pogonomys fergussoniensis
Pogonomys loriae
Pogonomys macrourus
Pogonomys sylvestris
Protochromys fellowsi
Pseudohydromys ellermani
Pseudohydromys fuscus
Pseudohydromys germani
 Oostelijke neusmuis (Pseudohydromys murinus)
Pseudohydromys occidentalis
Pseudomys delicatulus
Rattus arrogans
 Polynesische rat (Rattus exulans) (ingevoerd)
Rattus leucopus
Rattus mordax
Rattus niobe
 Bruine rat (Rattus norvegicus) (ingevoerd)
Rattus novaeguineae
Rattus praetor
 Zwarte rat (Rattus rattus) (ingevoerd)
Rattus sordidus
Rattus steini
Rattus vandeuseni
Rattus verecundus
Solomys ponceleti
Solomys salebrosus
Solomys spriggsarum
 Bergmozaïekstaartrat (Uromys anak)
 Mozaïekstaartrat (Uromys caudimaculatus)
Uromys neobritannicus
Xenuromys barbatus
 Onechte waterrat (Xeromys myoides)

Literatuur
In de volgende noten verwijst "nieuwe soort" naar een volledig nieuwe naam. "Gesplitst" of "afgesplitst" verwijst naar namen die eerst als synoniemen werden beschouwd, maar nu als geldig worden erkend.
Wilson, D.E. & Reeder, D.M. (eds.). Mammal Species of the World: a taxonomic and geographic reference. 3rd ed. Baltimore: The Johns Hopkins University Press, 2 vols., 2142 pp. ISBN 0-8018-8221-4

Zoogdieren
Papoea-Nieuw-Guinea
Zoogdieren