Onderstaande albums stonden in 1999 op nummer 1 in de Album Top 100, de voorloper van de huidige Media Markt Album Top 40. De lijst werd samengesteld door de Stichting Nederlandse Top 40. Vanaf 10 juli 1999 stopte de Album Top 100 van de Stichting Nederlandse Top 40 bij het samengaan van deze stichting met de Stichting Mega Top 100. De overgebleven lijst was die van Megacharts B.V.. Sinds 9 april 2011 wordt er door de Stichting Nederlandse Top 40 weer een albumlijst samengesteld. Deze lijst bevat zowel nieuwe en oudere albums als compilatie-albums. De lijst is vernoemd van de sponsor: de Media Markt Album Top 40.

Nummer 1-albums in de Nederlandse Album Top 100 naar jaar
Muziek in 1999