In het geval van volledige hydrogenering, waarbij voldoende waterstofatomen worden toegevoegd om de hele koolstofketen te verzadigen, is er geen enkel gezondheidsrisico. Vaak denkt men bij de term hydrogenering evenwel aan een ander proces, en dan met name aan gedeeltelijke hydrogenering. Bij dat proces, dat vandaag alleen nog voor enkele zeer specifieke toepassingen wordt gebruikt, worden er bewust niet genoeg waterstofatomen toegevoegd om alle dubbele koolstofbindingen te verzadigen. Dit heeft als voordeel dat men de textuur kan variëren door de mate van gedeeltelijke hydrogenering te wijzigen. Het grote nadeel van deze techniek is echter dat er transvetzuren ontstaan doordat er dubbele bindingen overblijven, en transvetzuren zijn schadelijk gebleken voor de gezondheid.