Hemato-oncologie | FUDGE brengt fusiegenen snel en nauwkeurig in kaart
Hemato-oncologie Nummer 2, pp. 7-10
jul 2020, jaargang 7 Hemato-oncologie Nr. 2, pp. 7-10
Bij naar schatting 1 op de 6 gevallen van kanker vormt een fusiegen de drijvende kracht achter de ziekte. Met de huidige technieken is het lastig een fusiegen snel en tevens zeer nauwkeurig moleculair te karakteriseren. Onderzoekers van het UMC Utrecht ontwikkelden FUDGE (FUsion Detection from Gene Enrichment), een techniek die dit met behulp van CRISPR-Cas9 en nanopore sequencing wel voor elkaar krijgt. Dr. Glen Monroe en Christina Stangl geven uitleg.
Christina Stangl: 'De volgende stap is aantonen dat de techniek gevoelig genoeg is voor gebruik in de dagelijkse klinische praktijk'
Stangl C, de Blank S, Renkens I, et al. Partner independent fusion gene detection by multiplexed CRISPR-Cas9 enrichment and long read nanopore sequencing. Nature Comm. 2020; Online 5 June (11, 2861).