Het seizoen 2008/09 van de KNVB beker was de 91e editie van de Nederlandse voetbalcompetitie met als inzet de KNVB beker en een plek in de play-offronde van de UEFA Europa League 2009/10. 88 ploegen uit de Eredivisie, Eerste divisie en verschillende amateurklassen namen deel aan het toernooi, dat bestond uit zeven knock-outronden. Het toernooi werd georganiseerd door de Koninklijke Nederlandse Voetbalbond (KNVB).

De competitie begon op 30 augustus 2008 met een eerste ronde waaraan enkel amateurteams aan deelnamen. Op 17 mei 2009 werd de finale gespeeld in De Kuip in Rotterdam.

sc Heerenveen won voor het eerst in haar geschiedenis de beker, nadat zij FC Twente in de finale met strafschoppen versloeg.

Deelnemers 
De achttien ploegen uit de Eredivisie en twintig ploegen uit de Eerste divisie hadden zich automatisch voor het toernooi geplaatst. Zij hadden een bye voor de eerste ronde. Via de Districtsbeker, seizoen 2007/2008 plaatsten zich 24 amateurteams uit verschillende klassen. Voor het eerst wisten zich twee teams uit de Reservehoofdklasse te plaatsen, namelijk de tweede elftallen van Quick Boys en Hollandia. Opvallend detail is dat beide teams hun eigen eerste elftal versloegen. Quick Boys 2 versloeg Quick Boys 1 na strafschoppen en Hollandia 2 won met 5-1 van Hollandia 1. Beide eerste elftallen kwalificeerden zich echter via de reguliere competitie.

Via de competitie in seizoen 2007/08 plaatsten zich 24 hoofdklassers. Tevens werden twee beloftenteams van betaaldvoetbalorganisaties uitgenodigd, namelijk landskampioen 2007/08 Jong FC Twente en bekerwinnaar 2007/08 Jong PSV. De beloftenteams stroomden in in de tweede ronde.

In de onderstaande overzichten staan de deelnemende teams. Het cijfer tussen haakjes geeft aan welke ronde het team heeft gehaald. De winnaar is vetgedrukt.

Eredivisie

Eerste divisie

Beloftenteams 
 Jong FC Twente (2)
 Jong PSV (2)

Hoofdklasse amateurs 
Ploegen hebben zich geplaatst via de competitie 2007/08, tenzij anders aangegeven.

(DB): Club heeft zich geplaatst via districtsbeker.

Overige amateurs 
Ploegen hebben zich geplaatst via de districtsbeker 2007/08.

Reservehoofdklasse 
Ploegen hebben zich geplaatst via de districtsbeker 2007/08.
 Hollandia-2 (1)
 Quick Boys-2 (2)

1e ronde 
Voor de eerste ronde werd geloot op 8 juli 2008. 48 amateurploegen spelen tegen elkaar, de 24 winnaars gingen door naar de tweede ronde.

Wedstrijden 
De grootste overwinning werd door Haaglandia/Sir Winston geboekt bij derdeklasser VV ASVB: 10-0. Be Quick 1887 stond in de wedstrijd tegen Xerxes na 90 minuten nog op 1-1. In de verlenging scoorde de ploeg vijf keer, waardoor de einduitslag 6-1 werd. Sylvano Comvalius van Quick Boys 2 scoorde vier doelpunten tegen Hollandia 2 en was hiermee topscorer van de eerste ronde. Onder de winnaars waren 22 ploegen uit de Hoofdklasse, één uit de Eerste klasse (EHC) en één uit de reservehoofdklasse (Quick Boys 2).

2e ronde 

Voor de tweede ronde werd net als voor de eerste ronde geloot op 8 juli. Ploegen uit de Eredivisie en Eerste divisie en de twee beloftenteams stroomden in deze ronde in. Voetballer Erik Pieters, die enkele dagen eerder van FC Utrecht naar PSV was getransfereerd, assisteerde bij de loting en koppelde zijn oude ploeg aan Ajax en zijn nieuwe ploeg PSV aan het beloftenteam van PSV.

Wedstrijden 

PSV had weinig moeite met Jong PSV: 3-0. Eerstedivisieclubs Go Ahead Eagles en RBC Roosendaal werden uitgeschakeld door de amateurs van respectievelijk HHC Hardenberg en Rijnsburgse Boys. Van de ploegen uit de Eredivisie werden Heracles Almelo en FC Utrecht meteen uitgeschakeld. Zij moesten het in uitwedstrijden opnemen tegen AZ en Ajax.

Twee teams uit de Eerste divisie zijn verslagen door amateurteams: Go Ahead Eagles verloor uit na verlenging tegen HHC Hardenberg en RBC Roosendaal werd ook uit verslagen door Rijnsburgse Boys.

3e ronde 
Voor de derde ronde werd geloot op 25 september. Er zijn nog maar zes amateurteams over, die allemaal spelen in de Hoofdklasse. Verder is er de wedstrijd PSV-AZ, tussen twee van de topvier teams in de Eredivisie. De wedstrijd HHC Hardenberg-Feyenoord wordt gespeeld in het Univé Stadion te Emmen in plaats van bij HHC Hardenberg.

Wedstrijden

4e ronde 

Voor de kwartfinales wordt geloot op 22 januari 2009. Opvallend is dat er net zoveel amateurclubs in de koker zitten als Eerste divisie teams. Allebei de amateurclubs moeten uit weten te winnen. FC Lienden moet het tegen Roda JC opnemen en Achilles '29 moet het opnemen tegen AZ. De twee clubs uit de Eerste divisie, FC Dordrecht en Excelsior, spelen tegen De Graafschap en FC Volendam. Feyenoord-sc Heerenveen wordt door meeste gezien als de topper.

Wedstrijden

Kwartfinales

Wedstrijden

Halve finales

Wedstrijden

Finale 
De finale werd gespeeld om 18:00 uur op 17 mei 2009 tussen sc Heerenveen en FC Twente. De locatie was het Stadion Feijenoord te Rotterdam. De scheidsrechter was Jan Wegereef en de assistent-scheidsrechters waren Roger Geutjes en Hans ten Hoove.

Wedstrijd

Geëlimineerde clubs 
De volgende clubs zijn geëlimineerd:

Topscorers 

Er is ėėn eigen doelpunt gescoord, door Herman Jan Stavast (VV Hoogeveen) in de eerste ronde wedstrijd tegen Be Quick '28.

Samen zijn er 305 doelpunten gescoord. Dat komt op een gemiddelde neer van 3.506 doelpunten per wedstrijd.

Deelnemers per ronde 
De deelnemers per ronde zijn:

KNVB Beker (mannen) naar seizoen
Bekervoetbal 2008/09
Nederlands voetbalseizoen 2008/09