Franz Joseph Freiherr von Jacquin ook wel Baron von Joseph Jacquin (Schemnitz (nu Banská Štiavnica), 7 februari 1766 - Wenen, 26 oktober 1839) was een Oostenrijkse geneeskundige, scheikundige en plantkundige.

Von Jacquin, zoon van Nikolaus Joseph von Jacquin, studeerde in 1788 af in geneeskunde aan de Universiteit van Wenen. Tussen 1788 en 1791 werd hij op een wetenschappelijke reis naar Duitsland, Frankrijk en Engeland gestuurd door Frans II.

Aan de Universiteit van Wenen erfde Von Jacquin zijn vaders positie als hoogleraar plantkunde en scheikunde, wat hij vanaf 1797 bleef tot aan zijn pensionering in 1838.

Nagedachtenis 
De auteur-afkorting J. Jacq. wordt gebruikt om Von Jacquin jr. aan te geven als auteur bij het citeren van een botanische naam.

Oostenrijks botanicus
Oostenrijks hoogleraar
Oostenrijks medicus
Oostenrijks scheikundige