De CONCACAF Champions League 2008/09 was de eerste editie van dit voetbaltoernooi voor clubs die door de CONCACAF wordt georganiseerd. De CONCACAF Champions League verving dit seizoen de CONCACAF Champions Cup die tussen 1963-2008 43 edities kende. Het is de Noord- en Midden-Amerikaanse tegenhanger van de Europese Champions League.

CF Atlante nam als winnaar van dit continentaal toernooi deel aan het Wereldkampioenschap voetbal voor clubs 2009.

Opzet 
In het eerste seizoen van de CONCACAF Champions League namen 24 clubs deel, als volgt verdeelt:
 - van de NAFU
 4 clubs uit Mexico en de Verenigde Staten
 1 club uit Canada
 - van de UNCAF
 2 clubs uit Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras en Panama
 1 club uit Belize en Nicaragua
 - van de CFU
 3 clubs via de CFU Club Championship

In de voorronde speelden zestien clubs een heen- en terugwedstrijd. De winnaars van deze duels plaatsen zich, samen met acht direct gekwalificeerde teams voor de groepsfase. De 16 teams werden verdeeld in vier groepen van vier waarvan de teams twee keer tegen elkaar spelen in een thuis- en uitwedstrijd. De nummers één en twee van elke groep plaatsen zich voor de knock-outfase die ook middels thuis- en uitwedstrijden wordt gespeeld.

 Voorronde (16 teams)
 2 clubs uit Mexico, Panama en de Verenigde Staten
 1 club uit Canada, Belize, Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras en Nicaragua
 3 clubs via de CFU Club Championship 2007

 Groepsfase (16 teams)
 2 clubs uit Mexico en de Verenigde Staten
 1 club uit Costa Rica, El Salvador, Guatemala en Honduras
 8 winnaars van de voorronde

Toernooi

Loting
De loting voor de voorronde en de groepsfase vond op woensdag 11 juni 2008 in New York plaats. De loting voor de knock-outfase (kwart-, halve finale en finale) vond op 10 december 2008 plaats.

Voorronde
De heenwedstrijden werden gespeeld van 26 tot en met 28 augustus gespeeld, de terugwedstrijden van 2 tot en met 4 september 2008.

|}
  * Door Orkaan Gustav is de wedstrijd tussen Harbour View en UNAM Pumas geannuleerd.

Groepsfase
 Speeldata
 speeldag 1: 16-18 september 2008
 speeldag 2: 23-25 september 2008
 speeldag 3: 30 september - 2 oktober 2008
 speeldag 4: 7-9 oktober 2008
 speeldag 5: 21-23 oktober 2008
 speeldag 6: 28-30 oktober 2008

 In de uitslagentabellen is het thuisteam genoteerd in de linker kolom.

Groep A

  * Deze wedstrijd stond officieel voor 23 oktober gepland maar door de overstromingen in San Pedro Sula is de wedstrijd verplaatst naar 5 november.

Groep B

  * Deze wedstrijd stond officieel voor 17 september gepland maar door Orkaan Ike is het duel uitgesteld naar 26 november.

Groep C

Groep D

Knock-outfase

Kwartfinale 
De heenwedstrijden werden van 24 tot en met 26 februari gespeeld, de terugwedstrijden van 3 tot en met 5 maart.

|}

 Heenwedstrijden
<div id="Houston Dynamo v Atlante">

<div id="Montreal Impact v Santos Laguna">

<div id="Cruz Azul v Universidad Nacional">

<div id="Puerto Rico Islanders v Marathón">

 Terugwedstrijden
<div id="Atlante v Houston Dynamo">

<div id="Marathón v Puerto Rico Islanders">

<div id="Universidad Nacional v Cruz Azul">

<div id="Santos Laguna v Montreal Impact">

Halve finale 

|}

 Heenwedstrijden
<div id="Puerto Rico Islanders v Cruz Azul">

<div id="Santos Laguna v Atlante">

 Terugwedstrijden
<div id="Cruz Azul v Puerto Rico Islanders">

<div id="Atlante v Santos Laguna">

Finale
De heenwedstrijd werd op 22 april gespeeld, de terugwedstrijd werd uitgesteld van 29 april naar 12 mei 2009 vanwege de uitbraak van de varkensgriep in Mexico.

|}

 Heenwedstrijd

 Terugwedstrijd

Topscorers 

2008/09
Voetbal in 2008
Voetbal in 2009