De Emmaüs is één van de 30 basisscholen die deel uit maken van Sophia Scholen voor Katholiek Basisonderwijs in de Duin- en Bollenstreek. De Sophia Stichting is opgericht op 27 november 1997 en is ontstaan na een fusie van in totaal negen besturen van katholieke basisscholen, gelegen in de woonkernen Katwijk, Noordwijk, Noordwijkerhout, De Zilk, Warmond, Voorhout, Sassenheim, Lisse en Hillegom.
Daarna heeft er een bestuurlijke samenvoeging plaatsgevonden op 26 april 2012 met Stichting Katholiek Onderwijs Voorhout (SKOV). En per 1 januari 2018 maken ook de PCPO-scholen uit de Duin en Bollenstreek onderdeel uit van de Sophia Stichting, welke vanaf heden de naam Sophia Scholen is gaan voeren. De 30 basisscholen verzorgen onderwijs aan circa 5.930 leerlingen.
Sophia Scholen is een innoverende, op kwalitatieve en kwantitatieve groei gerichte en ondernemende organisatie, die zelf initiatieven neemt. De stichting bewerkstelligt vanuit een katholieke grondhouding een harmonieuze werk- en leeromgeving waarin alle kinderen én leerkrachten zich gerespecteerd en beschermd voelen en zich optimaal kunnen ontplooien.
Sophia Scholen streeft naar het gericht faciliteren van onderwijs op schoolniveau. Voor een optimale aansturing van het primair proces wordt geïnvesteerd in het onderwijskundig management van de school. De stichting is een ambitieuze organisatie met zowel professionals als vrijwilligers en is voortdurend in ontwikkeling.
Bestuur, management en directies van de Sophia Scholen hechten waarde aan respect, solidariteit en verbondenheid; een heldere en doelgerichte communicatie en organisatie; het effectief inzetten van de beschikbare middelen; het in kaart brengen, inzetten en benutten van aanwezige kennis en deskundigheid.
Sophia Scholen streeft naar hoge onderwijskundige kwaliteit; de scholen zijn autonoom in de wijze waarop ze het onderwijs vormgeven.