De fauna van het nationale park omvat meer dan 280 soorten, waarvan 44 soorten zoogdieren, 200 vogels, 16 soorten reptielen, 2 amfibieën en 20 vissoorten. Zo woont onder andere de Tien Shan bruine beer hier, maar ook vele inheemse vogelsoorten. De wilde zwijn, hoogland kwartels en beren zijn bijna uitgestorven in het gebied. De natuurbescherming doet er alles aan deze dieren in het gebied te beschermen en te behouden.