Na zijn priesterwijding ging Anton Vernooij muziek studeren in Rome. Terug in Nederland werd hij docent aan het instituut voor kerkmuziek in Utrecht. Dat deed hij tot 1998. Daarna werd hij bijzonder hoogleraar liturgische muziek aan de Universiteit Tilburg.
Vernooij is inmiddels een landelijke autoriteit op gebied van liturgische muziek. Zijn naam staat voor in de liedbundel 'Gezangen voor Liturgie' die nog steeds in de katholieke kerk gebruikt wordt, als voorzitter van de commissie die de twee edities van de bundel heeft samengesteld. Hij heeft talloze artikelen gepubliceerd en enkele boeken geschreven. Dat doet hij nog steeds. Vorige week gaf hij nog een lezing en deze week produceerde hij zijn zoveelste wetenschappelijk artikel.