 Hata hivyo, iwapo shughuli za uanzishaji na uendelezaji wa nishati ya mimea hazitafanyika kama inavyotakiwa, zinaweza kuleta athari mbali mbali zikiwemo kuongezeka kwa bei ya chakula na kupungua kwa upatikanaji wa mazao ya chakula Von Braun 2007, kuondolewa kwa wakulima katika maeneo yenye ardhi ya rutuba kupisha kilimo cha mazao ya nishati, pia athari mbali mbali za kimazingira zinaweza kutokea Thornton et al 2006. 