<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - In Julie 1861 is n regiment bekend as die Ingenieurregiment van die Weste, wat hoofsaaklik in die State van Illinois en Missouri gewerf is, georganiseer deur kolonel J. W. Bissell, en Henry Flad is kaptein van Kompanjie B. In Augustus van dieselfde jaar is hy deur generaal Frémont, toe in bevel by St. Louis, vir diens in die konstruksie van vestings by Kaap Girardeau, Missouri, waar hy vir n paar maande gebly het. Later in die jaar, toe Frémont deur generaal Halleck opgevolg is, is kaptein Flad beveel om by generaal Pope in suidoos-Missouri aan te sluit, en het as stafofisier gedien deur die veldtog van New Madrid en Point Pleasant en die inname van eiland nommer tien, waarna hy weer by sy regiment by New Madrid aangesluit het. Hy was saam met sy regiment by Fort Pillow en Pittsburgh Landing  <response>: en in die bedrywighede voor Corinth. Gedurende die somer van 1862 was hy besig met die herstel van die Mobile en Ohio Spoorweg, met die bou van fort by Korinthe en met die herstel van die Mississippi Sentrale Spoorweg. Hy was ook betrokke by Grant se opmars op Grenada. In Februarie 1863 is hy na Youngs Point gestuur, waar hy in ingenieurswerk gewerk het, soos hy later by Baxter Bayou, Lake Providence en Bayou Macon was. 