<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - n Vaste teenstander van die kanselier Angela Merkel se reaksie op die migrasiekrisis van die 2010s  <response>: Seehofer het gedreig om n formele klagte by die Grondwetlike Hof in te dien, met die historiese CDUCSU-alliansie in gevaar om te skei en vir die eerste keer in die hele Duitsland teen mekaar te hardloop, maar dit het nie gebeur nie. Hy is n voorstander van n federale limiet op die aantal vlugtelinge wat die Duitse regering moet opneem. Nadat hy in die 2017 federale verkiesing histories sleg gevaar het met n veldtog wat gekritiseer is omdat hy die Alternatief vir Duitsland nageboots het, die party het sy ergste resultaat sedert 1949 gekry, en sonder sukses probeer om vir n derde termyn as Ministerpresident in 2018 te hardloop, is hy deur sy party onder druk geplaas om te bedank en het besluit om die amp van Minister van Binnelandse Sake, Bou en Gemeenskap oorspronklik bedoel vir Joachim Herrmann in Merkel se vierde regering in te neem om die migrerende beleid na sy sienings te vorm. In Julie 2018 het n weeklange meningsverskil tussen Seehofer en Merkel die regering amper omvergewerp en weer ernstig gedreig met n CDUCSU-verdeling, maar hulle het uiteindelik n kompromie gevind. 