<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - Nakajima is deur Williams vir die 2009 seisoen behou. By die Australiese Grand Prix in 2009 het hy in kurwe ses teen die muur neergestort en hom uit die wedloop gesit. Nakajima was die enigste bestuurder wat in Bahrein afgetree het en vyf rondtes voor die einde met oorverhitte olie gestop het. Hy het ook op die voorlaaste ronde van die Monaco Grand Prix neergestort terwyl hy op die 10de plek gehardloop het. Hy het byna by verskeie Grand Prixs aangeteken, waaronder die verlies van n punte nadat hy in die pitlane by die Turkse Grand Prix vertraag is. By die Britse Grand Prix het Nakajima sy hoogste ooit Formule Een-roosterplek verseker, wat in n indrukwekkende vyfde plek voor wêreldkampioenskapsleier Jenson Button gekwalifiseer het. Sy wedloop is egter in gevaar gestel deur swak pitstrategie, en hy het uiteindelik buite die punte geëindig. Nakajima het weer amper by die Hongaarse Grand Prix aangeteken  <response>: , eindig net 0.7 sekondes agter die agtste plek Jarno Trulli. Hy het weer negende geëindig in Singapoer. In Brasilië was Nakajima weer in die stryd om punte totdat hy deur die nuweling en landgenoot Kamui Kobayashi uitgeskakel is. Nakajima het die seisoen voltooi sonder om enige punte te behaal, met sy spanmaat Nico Rosberg wat alleen verantwoordelik is vir elke kampioenskapspunt wat deur die Williams-span behaal is, en Nakajima was die enigste nie-punte-telling uit die bestuurders wat aan elke wedloop in 2009 deelgeneem het. 