<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - Trajkovski se termyn is gekenmerk deur spanning tussen etniese Macedoniërs en die republiek se groot etniese Albanese minderheid. Die nasleep van die Kosovo-oorlog het tot maande van gewelddadige gewapende botsings gelei  <response>: die Macedoniese veiligheidsmagte en die Albanese rebelle wat op soek is na verbeterings in hulle status as n wettige minderheid en oor die algemeen beter ekonomiese, administratiewe en regsvoorwaardes. Alhoewel sy magte beperk was en sy rol grootliks seremoniële was, het hy in 2001 n NAVO-bemiddelde vredesooreenkoms voorgestaan wat die geweld beëindig het en n volskaalse burgeroorlog in die Republiek Macedonië voorkom het. Hy is gesien as n gematigde in die etniese dialoog, wat argumenteer vir groter insluiting van etniese Albanees, en is gekrediteer as n sleutelfiguur in die oplossing van die konflik. Boris Trajkovski se vriend en adviseur was sy stafhoof Zoran Jolevski, wat die Macedoniese ambassadeur in die Verenigde State van Amerika was en die onderhandelaar van die naam van die staat in die Macedonië-naamgeskil. 