<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - In 1861 het Hawkins gehelp om die 9de New York-infanterie, n regiment in Zouave-styl, bekend as Hawkins Zouaves vir diens in die Burgeroorlog, op te stel. Hawkins is op 4 Mei 1861 as kolonel van die regiment aangestel en het vroeg in die oorlog met onderskeid in Noord-Carolina gedien. Hy was deel van Benjamin F. Butler se ekspedisie om Fort Hatteras te verower  <response>: In 1861 het die Hy het verwag om n bevordering tot brigadier-generaal te wen vir sy diens by Fort Hatteras, maar is in plaas daarvan van bevel ontslaan vir ongehoorsaamheid. Op 8 Oktober 1861 het n ontevrede Hawkins geskryf: Brigadeergeneraals is deesdae so vreemd gemaak dat ek dit nie as n groot eer beskou om een te word nie. Hawkins sou in werklikheid in 1866 n brevetbevordering tot brigadiergeneraal ontvang om op 13 Maart 1865 te rangskik. Ten spyte van sy oorlogsgesindheid het n vroeë versending van Hawkins die aandag van president Abraham Lincoln getrek. Hawkins is na die Withuis genooi om met die president en generaal-in-hoof George B. McClellan te vergader. Daar was hy instrumenteel in die oortuiging van die Unie-hoë bevel van die moontlikheid van n gekombineerde operasie teen Pamlico Sound in Noord-Carolina. 