<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - Toe die Amerikaanse Burgeroorlog in 1861 uitgebreek het, het Fesler aan die kant van die Unie gestaan. Op 30 Augustus 1861 het hy by die Unie-leër by Morgantown, Indiana, ingeskryf. Fesler is die kaptein van Kompanjie G in die 27ste Indiana-infanterie-regiment gemaak. Fesler het sy maatskappy in die Slag van Eerste Winchester gelei  <response>: en by die Slag van Cedar Mountain. In 1862 is Fesler se regiment aan die 12de leërkorps toegewys, waarin dit deur 1863 sou bly. Fesler het toe sy maatskappy tydens die Slag van Antietam, naby Sharpsburg, Maryland, op 17 September 1862 beveel. Sy regiment het die winter van 1862 tot 1863 by Stafford Courthouse, Virginia, kamp opgeslaan, en op 13 Februarie 1863 is Fesler tot luitenant-kolonel van die 27ste Indiana bevorder. In Maart 1863 het die 12de Korps, waarvan die 27ste Indiana deel was, n ster as sy korpswapen ontvang. Op 5 Mei 1863 is Fesler gewond in aksie tydens die Slag van Chancellorsville, in Spotsylvania County, Virginia. Hy het toe van 2 tot 3 Julie 1863 tydelik die 27ste Indiana tydens die Slag van Gettysburg beveel toe die kolonel van die regiment in bevel van sy brigade geplaas is. Fesler en sy regiment het later daardie maand deelgeneem aan die onderdrukking van die New York City Draft Riots. 