<prompt> Skryf n voortsetting vir hierdie paragraaf - Hardee het op 31 Januarie 1861 sy Amerikaanse leërkommissie bedank, nadat sy tuisstaat Georgia van die Unie afgeskei het. Hy het op 7 Maart by die Konfederale State-leër aangesluit as n kolonel en is bevel gegee oor Forts Morgan en Gaines in Alabama. Hy is daarna bevorder tot brigadiergeneraal 17 Junie en majoorgeneraal 7 Oktober. Teen 10 Oktober 1862 was hy een van die eerste Konfederale luitenantgeneraals. Sy aanvanklike opdrag as generaal was om n brigade van Arkansas-regimente te organiseer en hy het sy manne en mede-offisiere beïndruk deur moeilike voorsieningsprobleme op te los en vir die deeglike opleiding wat hy sy brigade gegee het. Hy het sy bynaam, Old Reliable, ontvang terwyl hy met hierdie bevel was. Hardee het in Arkansas gewerk totdat hy geroep is om by generaal Albert Sidney Johnston se Army of Central Kentucky aan te sluit as korpsbevelvoerder. Johnston sou terugtrek uit Kentucky en Tennessee, in Mississippi, voordat hy n verrassingsaanval by die Slag van Shiloh sou loods  <response>: in die lente van 1862. Hardee is op 6 April 1862 tydens die eerste dag van die geveg in die arm gewond. Johnston is by Shiloh doodgemaak en Hardee se korps het by generaal Braxton Bragg se leër van Tennessee aangesluit voor die beleg van Corinth, Mississippi, totdat departementsbevelvoerder P.G.T. Beauregard die stad ontruim het en na Tupelo teruggetrek het. Beauregard is vervang deur Bragg, wat daarna sy leër na Chattanooga verskuif het voordat hy met sy Konfederasie Heartland Offensive in Kentucky begin het. Daardie veldtog het geëindig met die Slag van Perryville in Oktober 1862, waar Hardee die linkervleuel van Bragg se leër beveel het. 