<prompt> Andika mwendelezo wa aya hii - Kwa kujitenga kwa majimbo kumi na moja ya Kusini na kuzuka kwa Vita vya wenyewe kwa wenyewe, Miller alijiunga na Jeshi la Muungano. Mnamo Agosti 27, 1861, Gavana Oliver P. Morton alimteua Miller kama Kanali wa 29 Indiana Infantry. Baada ya mafunzo, kikosi hicho kilipewa Brigadi ya Kirk katika mgawanyiko wa Alexander M. McCook katika Jeshi la Ohio la Buell na kwenda Tennessee. Miller alihusika katika siku ya pili ya vita vya Shilo  <response>: , pamoja na wakati wa kuzingirwa kwa Korintho. Miller aliongoza kikosi chake kupitia Alabama kaskazini na Tennessee na kumfuatilia Braxton Bragg kupitia Kentucky. Miller aliamuru kikosi chini ya James Negley wakati wa vita ya Mto Stones mwishoni mwa Desemba 1862. Katika siku ya pili ya vita, Miller aliongoza shambulio la shirikisho kuvuka Mto wa Stones ambao ulipinga shambulio la John C. Breckinridge la Confederate. Wakati wa shambulio hilo Miller alijeruhiwa shingoni. 