<prompt> Andika mwendelezo wa aya hii - Massa alianza vizuri kwa Ferrari, kufuzu wa pili katika mbio ya ufunguzi katika Bahrain  <response>: , na kuja kutoka nafasi ya 21 hadi ya 5 nchini Malaysia, kumpiga mwenzake Michael Schumacher, ambaye alikuwa ameanza kutoka 14. Hata hivyo, huko Bahrain, katika mazoezi ya Jumamosi na mbio, Massa alirudia zoea lake la kugeuka, na kumkosa Fernando Alonso, mshindi wa mwisho wa mbio. Katika GP ya Australia alianguka Ferrari yake katika kufuzu, kisha kugongana na Christian Klien na Nico Rosberg katika kona ya kwanza ya mbio. Hata hivyo, Massa alifunga podium yake ya kwanza ya kazi katika Nürburgring, kumaliza wa tatu nyuma ya Michael Schumacher na Fernando Alonso. Pia aliweka mzunguko wa haraka zaidi huko Barcelona mnamo 2006. Massa alikuwa na nne zaidi podium kumaliza katika 2006, na alichukua yake ya kwanza F1 pole nafasi na yake ya kwanza F1 kushinda katika Istanbul Park mzunguko. Nafasi yake ya baadaye katika Ferrari ilikuwa salama wakati Michael Schumacher alitangaza tarehe 10 Septemba 2006, yeye kustaafu kutoka F1 mwishoni mwa msimu wa 2006. Mnamo 22 Oktoba, Massa alishinda mbio yake ya nyumbani katika mashindano ya Interlagos, na kuifanya kuwa mara ya kwanza kwa dereva wa Brazil kushinda huko Interlagos tangu Ayrton Senna mnamo 1993. Massa alimaliza msimu wa tatu na alama 80, nyuma ya bingwa wa dunia Fernando Alonso na mwenzake wa Ferrari Michael Schumacher. 