<prompt> Andika mwendelezo wa aya hii - Hamšík alianza katika 2012 Supercoppa Italiana  <response>: , iliyofanyika Beijing, tarehe 11 Agosti; hata hivyo, Napoli walishindwa na Juventus 4 kwa 2 katika muda wa ziada. Baadaye mwezi huo, katika mechi ya kwanza ya ligi ya Napoli ya msimu wa 201213 Serie A, Hamšík alifunga bao la kwanza la klabu na akasaidia mgomo wa Christian Maggio katika ushindi wa 3-0 wa Palermo. Kukosa kipao cha juu cha goli Edinson Cavani kwa mechi ya klabu dhidi ya Chievo mnamo 28 Oktoba 2012, Hamšík aliunganisha msalaba wa Juan Camilo Zúñiga ili kumpa Napoli ushindi wa 1-0. Mnamo 6 Januari 2013, alifanya maonyesho yake ya 200 ya Serie A katika ushindi wa nyumbani wa 4-1 dhidi ya Roma. Katika siku ya mwisho ya mechi ya msimu wa Serie A, Hamšík alikusanya pasi kutoka kwa Goran Pandev na akaingiza mpira nyumbani katika dakika ya 93, akiokoa ushindi wa 2 kwa 1 dhidi ya Siena, akithibitisha nafasi ya kilabu katika hatua za makundi ya Ligi ya Mabingwa wakati akihukumu Siena kwa kushuka. Slovak alionekana katika kila mechi ya Serie A kwa Napoli wakati wa msimu wa 2012-13, akitoa mabao 11 na misaada 14 wakati Partenopei ilimaliza wa pili nyuma ya mabingwa wa Juventus, msimu ambao ulionekana kuwa meneja Walter Mazzarri wa mwisho katika klabu hiyo, kwani alikua kocha wa Internazionale baadaye msimu huo wa joto. 